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“德爾塔克戎”來了?英國病毒學家:看起來像是序列被污染了……

“德爾塔克戎”來了?英國病毒學家:看起來像是序列被污染了……

據《塞普勒斯郵報》報道,當地時間1月8日,塞普勒斯科學家宣布在當地社群發現了一種新的新冠病毒變異毒株,該毒株為德爾塔與奧密克戎的重組體。

随後,塞普勒斯共和國衛生部長Michalis Hadjipantelas表示:“我們為本國科學家的這一發現感到驕傲。”

塞普勒斯國家新冠疫情科學咨詢委員會成員、塞普勒斯大學生物技術與分子病毒學實驗室主任Leontios Kostrikis博士表示,在當地社群發現的這種新變異毒株為德爾塔與奧密克戎的重組體,與這兩種變異毒株的一些突變具有相同的遺傳背景:基因序列與德爾塔更為接近,但擁有大量奧密克戎的特有變異。是以,他們将其命名為“Deltacron(德爾塔克戎)”。

“德爾塔克戎”來了?英國病毒學家:看起來像是序列被污染了……

Leontios Kostrikis

在接受當地媒體采訪時,Kostrikis解釋說:“我們發現了大量以前隻在奧密克戎病例中發現的突變,這與其他變異株不同,因為它有30個突變。在塞普勒斯采集的這些樣本中我們發現了其中10個突變。”

目前,塞普勒斯共有25個樣本中發現了“德爾塔克戎”變異毒株,其中11個來自新冠肺炎住院患者。

Kostrikis表示,住院患者的突變率更高,這可能意味着“德爾塔克戎”會導緻更高的住院風險。

他補充說:“很有可能這種特定的變異株在世界其他地方還沒有被發現,是以我們的發現可能會引起全球的興趣。這25個樣本的序列我們已經上傳到GISAID資料庫,這将使全球科學界可以研究它們。”

Kostrikis說,現在預測“德爾塔克戎”能否壓倒德爾塔和奧密克戎還為時過早。

當地時間1月9日,《塞普勒斯郵報》進行了更新報道,英國倫敦帝國理工學院新冠疫情應對專家組的病毒學家Thomas Peacock表示,塞普勒斯研究人員發現的“德爾塔克戎”變異毒株很可能是因為序列受到了污染。

“德爾塔克戎”來了?英國病毒學家:看起來像是序列被污染了……

Peacock在推特的一個文章中針對上述問題給出了技術性解釋。他說:"真正的重組體往往要在兩種病毒大量共存幾周甚至幾個月後才會出現;而我們發現奧密克戎也不過才幾周時間,我真的懷疑是否會存在流行的重組體......"

他指出,幾家大型媒體報道的塞普勒斯的“德爾塔克戎”序列看起來很明顯受到了污染。

Peacock說,有很多報道稱奧密克戎序列攜帶類似德爾塔的突變,如P681R或L452R。盡管其中一部分可能是真的,但絕大多數很可能是受到了污染或合并感染。

“到目前為止,還沒有明确的迹象表明令人讨厭的事情正在發生。”他補充道。

Peacock說:“為了确定像‘德爾塔克戎’這樣的重組毒株是真實存在的,需要多個測序實驗室獨立發現相同的重組或同質體,理想情況下,你也應該檢視原始的序列檔案,并顯示沒有混合堿基。”

Peacock認為,現在出現這樣的情況有兩個原因。一是在相同的區域有大量的德爾塔和奧密克戎共存;二是一些舊的測序引物組在提取奧密克戎成分時效率不高,是以,低水準污染的德爾塔毒株被選擇性地采集。

Peacock總結道:“最後,值得補充的是,我們已經了解了很多使德爾塔變異毒株更具傳染性的因素,而且奧密克戎已經具備了這些能力,但我目前還不清楚奧密克戎能從德爾塔中獲得什麼。”

此外,希臘病毒學家Gkikas Magiorkinis博士以及希臘科學小組的成員也發表了看法,他們在臉書上發文:“關于最近聽到塞普勒斯的‘德爾塔克戎’,我們第一次獨立分析表明,這是實驗室在讀取基因組過程中出現的技術性錯誤。”

來源:中國生物技術網

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