康熙二十年(1681年)八月，剛剛接到任命的福建水師提都施琅在給康熙皇帝的奏折中，特别強調清政府統一台灣的“三大必勝”條件：
一是政治上，“新平三藩”天下歸心
二是經濟上，“天下之财賦”雄厚
三是軍事上，“以我之衆百倍于彼”的優勢
大清對台作戰的最高統率決非吹虛之詞。他是對雙方綜合實力進行深入研究後，作出的科學判斷。康熙這位少年英主，在新政之後不久——康熙八年(1669年)五月，用親自訓練的布庫(摔跤隊)，以小孩玩家家的方式果斷打掉了飛揚跋扈且老謀深算的鳌拜集團，恢複“内三院”内閣制。康熙十六年(1677年)，二十四歲的康熙設立“南書房”，結束了“議政王大臣會議”，把中央權力全部集中于天子之手。以此，維護皇權，加強中央集權。為清朝的統一大業奠定了政治、組織基礎。
台灣降将施琅被康熙任命為水軍提督，負責收複台灣。三藩基本平定後，康熙接受了福建總督姚啟聖的建議，決定乘鄭氏集團内亂的時機用武力收複台灣。施琅走馬上任後，立即着手調整兵力，訓練水師。為了等待适當的時機，出師時間一拖再拖。轉眼到了康熙二十一年（1682），一時群言四起。這期間，施琅與姚啟聖又在進剿戰術安排上意見相左，施琅三次上書要求授予他專征權，由他統領軍隊自行進剿。盡管康熙對一再推遲出兵也有不滿，但他沒有被輿論左右，考慮到海戰須避風浪，事先很難猜度，他采取了十分慎重的态度。他用人不疑，為了確定戰鬥勝利，同意了施琅的請求，給予他專征大權。
康熙二十二年（1683）七月，施琅率領兩萬多名官兵，分乘230多艘戰船，直搗澎湖。戰鬥從清晨一直持續到傍晚，矢石如密集的雨點，炮火遮住了天空。經此一戰鄭軍主力幾乎全軍覆沒，台灣的門戶被打開了。困守孤島的鄭克見大勢已去，不得不派人向清軍送上降表。施琅率領的清軍在鼓樂聲中登上台灣島，鄭克率屬下列隊恭迎。至此，台灣與大陸重新統一。