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奧密克戎又變異,混合病毒XE來勢洶洶

新冠病毒(SARS-CoV-2)是一個非常狡猾的病毒,雖然結構很簡單,卻一直不停在變異。

迄今為止,新冠病毒通過不斷變異,已經擁有不少“分身”[1]:

阿爾法(Alpha):最早于2020年9月在英國被發現,感染這一變異株後,病情重,死亡率高,但免疫逃逸程度低,免疫系統能夠識别它并進行攻擊。

貝塔(Beta):最早于2020年5月在南非被發現,這一變異株傳播力強,但病情通常不會很重。

伽馬(Gamma):最早于2020年11月在巴西被發現,這一變異株引發重症和危重症的比例高。

德爾塔(Delta):最早于2020年10月在印度被發現,這又是一個傳播力強的變異株。

奧密克戎(Omicron):最早于2021年11月在南非被發現,這是一個傳染性很強的變異株,而且感染後症狀不典型,隐匿性高,容易漏診。

目前,全球範圍内的主要流行毒株就是奧密克戎。它可是個“狠角色”,傳播速度快、傳染性強且傳播隐匿,且有BA.1和BA.2兩個“大名鼎鼎”的分身。

目前在大陸上海、吉林等地肆虐的主要毒株就是Omicron子變體BA.2。

近日,英國衛生安全局(UKHSA)釋出的報告中,提到了3種新冠病毒的重組變體——XD、XE和XF[2]。

重組變體,指的是幾種流行變異株合并形成的新毒株,相當于毒上加毒。

重組變體其實并不罕見,當機體同時感染2種或2種以上的新冠變種時,就可能産生重組變體。但絕大多數的重組變體會很快消亡,留存下來的,一般都是具有毒力和傳播優勢的毒株。

我們可以通過下圖,了解此次報告的XD、XE和XF這3個重組變體。

奧密克戎又變異,混合病毒XE來勢洶洶

(圖1 XD、XE、XD重組序列展示[2])

從圖中我們可以得出以下資訊:

第1排橙色展示了SARS-CoV-2的基因組全長;

第2排用紅色、黃色、橙色代表SARS-CoV-2的基因組成;

第3排綠色代表了變異毒株Delta的基因組;

第4排深紫代表了變異毒株Omicron BA.1的基因組;

第5排淺紫代表了變異毒株Omicron BA.2的基因組;

XD和XF變體均為Omicron BA.1 和 Delta 變體的重組,但組合方式不同,是以形成了不同的變異體;

XE變體則是Omicron BA.1 和BA.2的合體。

在這3種重組變體中,最受關注的是XE。主要的原因在于它的傳播力很強,傳播速度比BA.2還快9.8%,有可能造成大範圍的流行[2]。

截至今年3月22日,英國境内已發現637例XE感染病例,大陸香港在今年2月,就有發現兩名抵港旅客感染奧密克戎混合病毒XE,還好經過隔離,沒有流入社群[3]。

在報告中,研究人員評估了XE的增長率。增長率是一個衡量感染确診速度的名額。通過它,我們可以了解XE的傳播率有多強。

在此之前,BA.2的增長率比其他奧密克戎菌株高75%。但XE的增長率卻比BA.2還高出9.8%。

這意味着,XE傳播速度會比BA.2還要快,有可能會引發新的大規模流行[2]。

奧密克戎又變異,混合病毒XE來勢洶洶

(圖2 XE與BA.2的增長率比較[2])

對于XE感染後的嚴重程度(重症率、死亡率)以及免疫逃逸情況,目前還沒有足夠的證據。但僅從傳播力上看,XE絕對是個不容小觑的變異體。WHO也發出警告,千萬不要輕視或低估重組毒株的危險性[2]。

抗原檢測好使嗎?

抗原檢測,也就是目前可以進行家庭檢測的抗原試劑盒,會檢測樣本中的新冠病毒的核衣殼蛋白(NP)。新冠病毒發生變異後,核衣殼蛋白的相對位置也可能發生突變(如下表所示)。

(表1 新冠變異株的核衣殼蛋白突變[4])

有抗原檢測研究比較了其對不同變異體的檢測能力,發現抗原檢測敏感性與原始毒株相比隻有微小的差異。

奧密克戎又變異,混合病毒XE來勢洶洶

(圖3 某抗原檢測對新冠病毒變異株的檢測性能比較[4])

盡管目前尚無抗原檢測對XE敏感性的證據,但基于之前研究的資料推斷,抗原檢測應該能夠檢測出XE感染。

核酸檢測仍是最可靠的法子

核酸檢測,可以直接檢測病毒核酸來判斷是否感染,在進行新冠病毒檢測時,會對病毒核酸的多個靶點(ORF1ab基因、N基因、S基因)進行檢測。

面對奧密克戎時,核酸測試無法檢測到靶基因中的S基因,這被稱為S基因缺失或S基因靶标失效(S-Gene Target Failure , SGTF)。也正是通過這個方式,檢查者能夠把奧密克戎和其他變異體區分開[2]。

但奧密克戎變異體BA.2的出現,使得它不再具有所謂“S基因缺失”特征,導緻其剛出現時一度“隐形”。不過,随着對它了解的加深,調整檢測方式後,核酸檢測是能夠檢出BA.2的。

此次英國發現的XE感染病例都是通過核酸檢測确診的,是以,大家可以放心,核酸檢測是能夠查出XE的感染情況。

迄今,還沒有足夠證據了解疫苗對這一變種的效果。但疫苗對于奧密克戎的有效性,已經得到了多項研究的驗證。

3月22日,香港大學釋出的研究,評估了複必泰(即輝瑞/BioNTech疫苗)與科興兩種疫苗對奧密克戎的有效性。

研究結果顯示,無論複必泰還是科興,接種後都能減少感染奧密克戎後重症或死亡的風險,而且僅接種一針,就可以見效[5]。

奧密克戎又變異,混合病毒XE來勢洶洶

(圖4 新冠疫苗對奧密克戎的有效性[5])

可見,對于目前主導流行的BA.2,疫苗是能發揮有效防護作用的。XE作為BA.1和BA.2的合體,疫苗效果盡管尚不明确,但不能是以而拒絕疫苗接種。進行規範的疫苗接種,仍是保護自己的最有力手段之一。

除了接種疫苗,做好日常防護,減少流動、科學理性的對待新冠肺炎給我們帶來的各種醫學問題,也有助于我們更好地保護自己。

審稿專家:潘磊

上海市公共衛生臨床中心呼吸與重症醫學科醫師

參考文獻

[1].https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/

[2].https://www.gov.uk/government/publications/investigation-of-sars-cov-2-variants-technical-briefings

[3].https://news.sina.cn/gn/2022-04-02/detail-imcwiwss9503449.d.html

[4].Weishampel ZA, Young J, Fischl M, Fischer RJ, et al. OraSure InteliSwab Rapid Antigen Test performance with the SARS-CoV-2 Variants of Concern Alpha, Beta, Gamma, Delta, and Omicron. medRxiv

[5].http://www.med.hku.hk/en/news/press//-/media/HKU-Med-Fac/News/slides/20220322-wave_5_omicron_PHSM_update_final.ashx

作者:葉譯楚 | 編輯:吳家翔、葉正興

排版:韓甯甯 | 營運:李永敏 | 統籌:葉譯楚

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