明朝嘉靖年間，海瑞任淳安知縣時，一位少婦省親回家，半路遇上大雨，便到附近寺廟避雨。不料，寺中的老和尚見少婦貌美，動了邪念，但少婦隻對小和尚有意思，堅決不順從老和尚。
老和尚一怒之下，竟然殺死了少婦，将屍體埋在寺廟後院。少婦失蹤後，婆家、娘家都找不到人，互相責怪，因争執不下，最後告到衙門，找海瑞決斷。
海瑞便派了一個年輕的手下，裝扮成普通百姓，暗地裡偵察，得知少婦曾路過寺廟避雨。這名手下，便一連幾日和寺廟的和尚厮混，從小沙彌口中，得知是老和尚害了少婦。
次日，海瑞便帶着衙役一幹人等，隆重地入寺廟燒香，寺廟的老和尚照例出列陪同。隻見海瑞燒香時，當着衆人的面突然擡頭看向天，好像在傾聽什麼。過了一會兒，海瑞又突然向上天打躬作揖，連聲說道：“知道了，知道了！”
老和尚心虛，頓時臉色大變。海瑞見狀，随即大喝一聲：”菩薩已經告訴我了，說你（老和尚）殺了那個少婦，你還不快快招認，免得受皮肉之苦！“
說罷，就帶領衙役，帶着工具，向後院奔去，果然在後院掘出那名少婦的屍體。老和尚以為海瑞果真得到菩薩的指點，心中一慌，就如實交代了自己欲侵犯少婦不得，而殺人的經過，和尚招了供，案子也就破了。
可見，海瑞在審案，斷案方面果然智慧非凡，在古代沒有指紋提取等現代技術的前提下，審案往往需要審案官和罪犯打心理戰，用心計給罪犯”下套“，激着罪犯自我承認，不然罪犯死不招供，就難以結案了。
關于海瑞用智慧斷案的故事還有很多，比如”決東明鄉劉松冤事“。
話說，當時淳安縣東明鄉有一個叫劉松的人，外出經商，很久都沒有回家。劉松的父親便外出找兒子，後來在兒子劉松常住的一家旅店，發現了兒子使用的一杆秤，便咬定是旅店的店主殺了兒子，告到衙門，求海瑞大人替他申冤。
海瑞聽了劉松父親的哭訴，覺得這事沒有這麼簡單。海瑞暗想：”如果真是店主殺了劉松，店主應該把秤杆和秤砣都毀了，以便滅迹。既然完好無損地放在店裡，說明兇手不是店主“。為了不打草驚蛇，海瑞便将這個案子懸而不決，暗中派人尋訪。
半年後，衙役在一個叫三官營的地方發現了劉松的屍體，除了屍體旁邊有一塊白布頭巾外，無任何兇器，和其它線索。
海瑞便從白布頭巾下手，他檢查後，發現這是一塊當時辦理喪事之時才用的白布頭巾，便派人查訪半年前，有誰家辦理喪事，最後查到朱守先家。海瑞派人去朱守先家搜查，果然搜出了贓物和兇器。
大堂上，朱守先供認他還有兩個同夥。海瑞一聽，擔心同夥得到消息逃跑，便在大堂上假裝發怒，吼道：”既然殺了人，你一個人抵命就可以了，又何必無故牽連他人！“說着，就讓衙役把朱守先押入大牢，宣布明日宣判結案。
另外兩個同夥聽說海瑞隻追究朱守先一人，命日就要結案，便放松了警惕，沒有逃走。不料，海瑞把朱守先押入大牢後，馬上詢問朱守先另外兩人是誰，住在哪裡，詢問清楚後，火速派人前去抓捕。次日一早，另外兩個人就被抓捕歸案，三個人一起抵罪。