最初的魔導獸誕生于恩底彌翁，是一隻名為“刻耳柏洛斯”的怪獸。雖然被喚做魔導獸，但是在精靈世界的種族定義裡面，刻耳柏洛斯卻是屬于魔法師族。而一般來說魔法師大部分都是人類，至于是野獸進化成為了人，還是人退化成了野獸，恩底彌翁的魔導王并沒有對外界進行詳細的說明。
對于恩底彌翁城來說，刻耳柏洛斯的出現很可能是隻是一個偶然事件。因為在此之後的很長一段時間之内，并沒有新的魔導獸出現。然而這隻刻耳柏洛斯對于對于恩底彌翁來說，依然是世間少有的魔法奇迹。
人的身體對魔力的承載量是有極限的，是以恩底彌翁的魔法師不得不借助漆黑的能量石這樣的魔導器，來從外部擷取施展魔法的額外魔力。但是在魔導獸刻耳柏洛斯的身上，卻并沒有這樣的極限。無論往他的身上灌注多少魔力，他都能完美吸收并化作自己的力量。
恩底彌翁對于魔導獸的研究從來就沒有停止過。為此恩底彌翁城裡面還專門設立有一個魔導研究院，但是遺憾的是有關于魔導獸的研究多年來一直毫無突破，這種情況一直持續到覺醒了靈擺力量的魔力誘導者出現才被打破。靈擺之力的出現為魔導獸提供了新的研究方向。
在魔力誘導者之前，恩底彌翁的對于魔導獸的研究主要集中在刻耳柏洛斯的主體上面，而忽視了依附在主體上面的那隻弱小的胡狼。而在覺醒了靈擺的力量之後，魔力誘導者注意到這隻胡狼可能才是讓生物變化成魔導獸的關鍵，因為她在這隻胡狼身上感應到了相同的靈擺能量。
魔導獸胡狼被成功地從刻耳柏洛斯的身上分離下來，并且馬上就開展了相關的實驗。因為刻耳柏洛斯的原因，人體實驗已經在恩底彌翁被完全禁止，是以實驗的對象變成了動物，一位魔法師的寵物鷹有幸成為了第一個實驗對象。
實驗非常的成功，胡狼成功地依附到了老鷹的身上，二者合為一體誕生出來了新的魔導獸迦樓羅。但是一次實驗并不能說明太多的問題，為了證明合成魔導獸的普遍性，還需要更多的實驗資料來作為支撐。
魔導獸胡狼再次被分離出來，與陸生的蜥蜴類動物進行了合成實驗，實驗依然獲得了成功，誕生出來了魔導獸巴西利斯克冠蜥，這極大的鼓舞了研究院裡面的研究員的實驗熱情。
然而讓所有人沒有預料到的是當再次從魔導獸身上分離出胡狼的時候，胡狼的形态發生了變化，似乎是因為實驗的關系，胡狼的力量得到的成長，變成了胡狼王的形态。胡狼王無法成為魔導獸的素材，這使得魔導獸的研究突然陷入了停滞。
魔導研究院被陰雲籠蓋，所有人都陷入絕望。這個時候，胡狼王突然繼續開始了進化，進一步變成了刻耳柏洛斯尊者。而刻耳柏洛斯尊者帶給所有人的驚喜就是，在他的手中掌握着連結魔導獸胡狼原生地的次元通道。
通過手中的魔杖，刻耳柏洛斯尊者可以從胡狼的原生地中招來新的胡狼幼體，而這些胡狼幼體都可以作為魔導獸的合成材料。在有了複數的胡狼幼體之後，欣喜若狂的研究員們設計了一個更大膽的實驗。
以兩隻胡狼幼體作為素材，與水生生物進行合成的魔導實驗就這樣樣展開。實驗的結果非常成功，誕生了名為美杜莎水母的合成獸。這一實驗的影響是深遠的，魔導獸的合成因為這一次實驗而被證明具有普遍性，開始被視為獨立的一項魔法科目。而恩底彌翁城也因為合成魔導獸的技術，與魔導書院拉邁松的魔法競争中開始取得優勢。