姚啟生為收複台灣做了很多功課。
一是降低鄭軍的實力。
三年亂的時候，鄭京也遠道而過，派出中央上司劉國軒率軍進攻清軍。
劉國軒也可以海上作戰，是以他利用這個優勢一路殺出勝利，逼迫泉州。
時任福建省省長的姚啟生在玩明康熙後率軍圍捕劉國軒。經過一番激烈的戰鬥，鄭俊道被殲滅，劉國軒與殘餘的軍隊隻能縮在漳州地區，導緻鄭俊的實力大大削弱。
第二，愛撫和使用。
姚啟生在攻打鄭軍，收複失地，向康熙提出了"愛撫與利用"的政策，這一政策得到了康熙的認可。随後，姚啟生包圍了鄭軍，而另一方面則以有利條件反對将領，為鄭君的倒台發揮了極大的作用。
第三，訓練水手。
因為鄭俊山海戰，而青廷一直不是訓練有素的水手，是以在與鄭俊作戰時，一旦鄭俊避海，清軍就無事可做，為此姚啟生特意玩康熙，希望加強水師建設，早日達到收複台灣的目的。
在康熙的支援下，第一艘1萬多人的福建海軍陸戰隊員組建起來，裝備精良的軍艦和西炮。
第四，推薦優秀的人才。
姚啟生不擅長水戰，雖然在平息叛亂的過程中有戰鬥的勇氣和能力。于是，他推薦康熙，并沒有野心勃勃的石偉當福建水利大師提香。
（姚啟生）
姚啟生為什麼推薦石啟生？原因有三。
首先，石偉是鄭軍的老部門，熟悉鄭軍的内幕消息。
石琦早在鄭志龍時期就當了明朝的将軍兵，然後帶着他的南進軍北上，因為他必須在戰争前猛攻，非常勇敢，而且有戰略眼光，是以鄭志龍重。
随着鄭志龍的倒下，因為不能再利用，而回到了鄭的隊伍中，成為正成在最年輕、知識最淵博的年輕将領下成功作戰的士兵。然而，由于他和鄭成功地在戰略觀點上截然相反，導緻軍事力量被削減，後來又因為父親和兄弟被殺，再次降級。
可以說，石琦是政集團内部情況最清楚的，也是攻擊鄭軍"愛撫和利用"最合适的推動者。
第二，有殺父殺弟的仇恨。
石磊回到鄭集團後，雖然在鄭文的成功下工作，但他卻反對鄭的諸多政策，比如下一個廣東秦王，鄭世宗的成功"槭水在陸地上，為了剽竊籌集軍費"，遭到了石磊的反對。
鄭成功一直不喜歡有人唱相反的語氣，再加上石石是鄭集團的老頭子，也頗能上司戰争，在軍隊中傲慢自大，是以鄭的成功對他更加警惕，是以切斷了他的軍事力量。
雖然後來在清軍突襲廈門，石維率領幾十人多勝少，打敗了清軍，但鄭軍還是沒有恢複官職。
接下來發生的事情徹底激化了施和鄭之間的沖突。
（鄭成的成功劇情）
史宗瀚手下有一個名叫曾德的旗手，他應該以違反軍法為由被判處死刑。
曾德為了逃避刑法，與鄭國的關系成功獲得庇護，并被提升為親軍随行人員。
石琦知道自己很生氣，于是把他抓回來，把他砍了出去。
聽到這個消息後，鄭成功要求石留在刀下，但石琦很快将曾德處死。
事發後，鄭成功認為石哈迪違抗了指令，事實恰恰相反，于是他和父親、哥哥被逮捕入獄。結果，在他的親信的幫助下，他得以逃脫。
鄭成功地看到施逃跑，生氣并殺死了他的父親和兄弟。
石儀怒氣沖沖地轉過身去，投降了清軍，從此和鄭一行人結下了不穿天敵的婚。
三、擅長海戰。
石琦在海邊長大，從小就跟着父親在海上做生意，是以精通航海等。後來，在鄭的小組中一直擔任将軍，在沿海地區參加過無數次戰鬥，在海戰方面經驗豐富。
其實直到姚啟生推薦，石薇雖然在北京任職，但沒用清朝宮廷，是以生活相當緊張，甚至曾經需要靠妻子在外面做女人紅膏補家。
即便是姚啟生的推薦，朝臣們對他的幾次兵變也有很多懷疑，是以也不同意重用石師。最後，姚啟生有了終身保障，再加上康熙也想早日收複台灣，石其才被提拔為福建省水利局局長。
（科學）
那麼，為收複台灣的偉大事業做出如此多貢獻的姚啟生，為什麼最終會得到回報呢？
原來，石哈迪在進攻台灣之前去過康熙，說他負責收複台灣的前線指揮部，而姚啟生隻負責後勤。
康熙答應了石先生的要求，才讓他走了。
這讓已經做足了功課的姚啟生，不至于不高興。但姚啟生顧大局來看，不僅為石世軍的攻擊鄭群保護糧草，也為他籌集了1萬多名士兵的支援，還自掏腰包建造了數百艘軍艦，保證了石芸軍成功收複台灣。
不過，台灣收複後，石琦為了不讓姚啟生為勝而戰，甚至在姚啟生前幾天就把報紙送到了法庭。康熙喜出望外，不僅提拔他為靖海将軍，還稱他為景海侯。
同時，石也趁機彈劾姚啟生，稱他的支援不及時，導緻收複台灣失敗。
因為姚琦直率，脾氣暴躁，是以在任時，他得罪了很多同僚，那些人也趁機彈劾姚啟生。
結果，姚啟生和康熙之間産生了誤會。
是以，當姚啟生的重播被送到康熙時，康熙不僅沒有表揚，反而說自己是"著名的漁人口碑"。
姚琦聖功高得無獎，這讓他相當郁悶，再加上背部潰瘍發作，在回福州的路上死了。
（參考史料：《清代史》《姚啟生與清朝統一台灣》）