太戊死后，其子仲丁继位，开启商代迁都之旅，并兴兵征蓝夷；仲丁死后，商代开始了长达百年的九世之乱，商朝内部王位纷争不断，屡次迁都，诸侯叛离，同时与外邦连年战争，商朝中衰。但在九世之乱中，还是有一位有为之君祖乙，使商朝得以短暂中兴。
太戊死后，其子仲丁继位。仲丁也叫中丁。
仲丁在位的第一年，因黄河决堤，将都城从亳都迁到嚣，也称隞。嚣在今河南省郑州市西北。
仲丁在位的第七年，位于商朝东南方的蓝夷部族侵略商朝统治区域，仲丁率兵征讨并打败蓝夷。
仲丁九年去世，其弟外壬继位。
在仲丁死后，其弟外壬夺取王位，开始了商朝长达百年的“九世之乱”，商朝面临内外交困的局面：内部而言，王位纷争不断，水患不断，商朝屡次迁都，诸侯叛离；外部而言，与东方的夷族、西方的戎族时有战争。商朝开始衰落。
商朝中心区域地图
历史记载：
《竹书纪年》：仲丁，名庄。元年辛丑，王即位，自亳迁于嚣，于河上。六年，征蓝夷。九年，陟。 《史记·殷本纪》：中宗崩，子帝中丁立。帝中丁迁于隞。
商朝的九世之乱是指仲丁、外壬、河亶甲、祖乙、祖辛、沃甲、祖丁、南庚、阳甲这九代商王在位时期，因王位传承制度的混乱造成的连续的王位争夺，同时加之黄河水患而造成的屡次迁都，更有外部与东夷和西戎的战争，造成了诸侯不朝、商朝中衰的局面的历史事件，这一事件大概持续了一百年左右。这一事件直到盘庚迁都、商朝中兴之后才结束。
外壬
仲丁死后，其弟外壬继位。外壬在甲骨文卜辞中被称作卜壬。
外壬元年，商朝的两个关系较为亲密的诸侯国邳国、姺国发生了叛乱。邳国的祖先是夏禹时期的车正奚仲，也是商汤时期丞相之一仲虺的后代；姺国是从有莘氏发展而来的，商汤的妃子就是有莘国首领的女儿，而且伊尹也是从有莘国作为陪嫁奴隶而来到商国的。
从关系来讲，邳国、姺国的祖先是商汤时的左右丞相，与商朝的关系应当是比较亲密的，但在商朝衰落之后，在仲壬在位期间，都叛离了商朝的统治。
在外壬在位期间，他并没有能力解决邳国、姺国的叛乱。最终解决两国叛乱的是他的弟弟河亶甲。
外壬在位十年而崩（一说十五年），其弟河亶甲继位。
《竹书纪年》：外壬，名发。元年庚戌，王即位，居嚣。邳人、姺人叛。十年，陟。 《史记·殷本纪》：帝中丁崩，弟外壬立，是为帝外壬。仲丁书阙不具。
河亶甲
河亶（dǎn）甲和仲丁、外壬同为太戊的儿子。
河亶甲元年，将都城从嚣迁到了相。相在今河南省安阳市内黄县。其迁都的原因是为了缓解商朝内部争夺王位的矛盾，同时躲避邳国、姺国的叛乱。
河亶甲三年，与商朝关系亲密的诸侯国大彭国的首领彭伯，率军帮助商朝平定了邳国的叛乱，邳国重新臣服于商朝。大彭国据说是彭祖的后代，在夏启时大彭国首领彭伯寿就曾率军帮助夏启平定过武观之乱。而传说中的彭祖寿八百，其实是大彭国存在的年数，大彭国在后来武丁在位时为商所灭。
河亶甲四年，继仲丁之后，商朝再度出兵征讨蓝夷。
河亶甲五年，姺国和班方结盟。河亶甲命大彭国首领彭伯、豕韦国首领韦伯率军征讨班方，打败并臣服班方。姺国再无外援之后，面对大军只好投降，重新臣服于商朝并纳贡。
河亶甲在位九年而崩，其子祖乙继位。
就功绩而言，河亶甲是要强于前任外壬的，他解决了商朝内部的叛乱，同时征讨了东方夷族，在一定程度上缓解了商朝的矛盾，稳定了商朝的统治，为他的儿子祖乙中兴奠定了基础。
《竹书纪年》：河亶甲，名整。元年庚申，王即位，自嚣迁于相。三年，彭伯克邳。四年，征蓝夷。五年，姺人入于班方。彭伯、韦伯伐班方，姺人来宾。九年，陟。 《史记·殷本纪》：河亶甲居相。 《史记·殷本纪》：帝外壬崩，弟河亶甲立，是为帝河亶甲。河亶甲时，殷复衰。
祖乙中兴
祖乙元年，将都城从相迁到耿。耿在今山西省运城市河津市。迁都原因是因相居于黄河下游，黄河长年水灾，影响农业生产和商朝统治。
祖乙
祖乙二年，耿因黄河泛滥而被冲塌，将都城迁到邢。邢即今河北省邢台市。在此次迁都过程中，有一部分商朝贵族不愿再迁徙，就落脚在耿。祖乙将其弟祖丙分封于耿，建立耿国。祖丙也被认为是耿姓的祖先。
祖乙三年，任命巫贤为卿士，相当于丞相。巫贤是祖乙一朝辅佐其中兴商朝的贤臣，是太戊时大巫师巫咸的儿子。
祖乙八年，邢遭遇水患。于是祖乙再次迁都到庇，庇在今山东省菏泽市郓城县北。并在庇营建宫城，并立宗庙社稷。
祖乙十九年去世，其子祖辛继位。祖乙死后，因中兴商朝，被尊为中宗。
殷墟出土的祭祀祖乙的甲骨文
祖乙在位期间，凭借父亲坚定的基础，任用贤臣巫贤，对内发展民生，对外征服东夷，是的商朝的经济得到发展，商朝得到一定程度上的复兴。在后世，孟子和晏子都将祖乙和商汤、太甲、太戊、盘庚、武丁并列为商朝的有为之君。
出土于宝鸡的西周青铜器“祖乙卤”之上的铭文
《竹书纪年》：祖乙，名滕。元年己巳，王即位，自相迁于耿，命彭伯、韦伯。二年，圮于耿。自耿迁于庇。三年，命卿士巫贤。八年，城庇。十五年，命邠侯高圉。十九年，陟。祖乙之世，商道复兴，庙为中宗。 《史记·殷本纪》：祖乙迁于邢。 《史记·殷本纪》：河亶甲崩，子帝祖乙立。帝祖乙立，殷复兴。巫贤任职。 《孟子·公孙丑上》：由汤至于武丁，贤圣之君六七作。 《晏子春秋·内篇·谏上》：夫汤、太甲、武丁、祖乙，天下之盛君也。
祖辛
祖辛是祖乙之子，在甲骨文中他被称作且辛。在他继位后仍以庇为都城。而关于他在位时期的作为，史书上只字未提。
祖辛在位十四年而崩，其弟沃甲继位。
商晚期的青铜瑰宝——祖辛卣
《竹书纪年》：祖辛，名旦。元年戊子，王即位，居庇。十四年，陟。 《史记·殷本纪》：祖乙崩，子帝祖辛立。
沃甲
沃甲，在甲骨文卜辞中作羌甲，《世本》一书中作开甲。沃甲在位时期的事迹在史书中同样未曾提及。
沃甲在位五年而崩（一说二十五年），据说是患病而亡，谥号僖王，从其谥号来看，就是个碌碌无为、混吃等死的主。在其死后，由其哥哥祖辛的儿子祖丁继位。
《竹书纪年》：开甲，名逾。元年壬寅，王即位，居庇。五年，陟。 《史记·殷本纪》：帝祖辛崩，弟沃甲立，是为帝沃甲。
祖丁
祖丁，在甲骨文中被称作且丁，他是祖辛之子，沃甲之侄，盘庚之父。
在他继位后也以庇为都城。而关于他在位时期的作为，史书上也是只字未提。
祖丁在位九年而崩，谥号商庄王。在其死后，其弟南庚继位。
《竹书纪年》：祖丁，名新。元年丁未，王即位，居庇。九年，陟。 《史记·殷本纪》：帝沃甲崩，立沃甲兄祖辛之子祖丁，是为帝祖丁。
南庚
勘误：《史记》记载南庚是沃甲之子、祖丁堂弟；而根据甲骨文卜辞记载，南庚是祖辛之子，是祖丁的亲弟弟。
南庚继位的前两年，以庇为都。
南庚三年，将都城由庇迁到奄。奄即今山东省济宁市曲阜市。迁都原因是因王位争夺而连续内乱，内部矛盾尖锐，商朝国力再度衰落。
南庚在位二十八年病死，谥号商顷王，甄心动惧曰顷，意思是谨慎时刻保持警惕。在其死后，其侄阳甲继位。
甲骨文中的南庚合文，合文是一种合体字，在后来的青铜器铭文中也常见到
《竹书纪年》：南庚，名更。元年丙辰，王即位，居庇。三年，迁于奄。六年，陟。 《史记·殷本纪》：帝祖丁崩，立弟沃甲之子南庚，是为帝南庚。
阳甲
阳甲是祖丁之子，南庚之侄，盘庚之兄；在甲骨文卜辞中称作象甲。
阳甲在位期间，仍以奄为都城。
阳甲三年，他发兵征讨了位于西方的丹山戎。丹山戎位于今山西省晋城市。
阳甲在位四年而崩，谥号商悼王，年中早夭曰悼。死后，其弟盘庚继位。在盘庚在位期间，商朝终于定都，并且再次实现了中兴。
史书中称，在阳甲在位期间商朝衰落，诸侯不朝。要说这样的局面是阳甲一人造成，这显然是不公平的，这是自仲丁以来历经九世商王，忧外患累积的的结果，是一个量变到质变的过程。
《竹书纪年》：阳甲，名和。元年壬戌，王即位，居奄。三年，西征丹山戎。四年，陟。 《史记·殷本纪》：帝南庚崩，立帝祖丁之子阳甲，是为帝阳甲。帝阳甲之时，殷衰。自中丁以来，废适而更立诸弟子，弟子或争相代立，比九世乱，於是诸侯莫朝。