1953年12月，陈水扁口述了对科学院的答复，毫无疑问地拒绝了科学院向北服务的邀请。
在他的信中，他反复声明"独立精神，自由的思想"，并回答说，他在1911年在瑞士阅读了三年的资本主义原文。
他不反对男性主义，或者，从学术上讲，任何人的著作都有值得探索的东西，学术研究总是用事实和材料说话，就像陈的学习一直以来的情况一样。
对于民国时期的著名人物陈玉科来说，他在王伟墓碑上刻下的铭文，至今仍设置在清华校园内。
这一段文字，更是让人捧腹。"来世不可知论者也是，先生的写作，或者有时不显眼;Doctrine先生，或者有时值得商榷，但这种独立精神，自由的思想，已经持续了数千年，世界是一样的很长一段时间，总共有三光和永恒之光。"
看似是好朋友王伟写的，陈其实是在说出自己的想法。
1953年，还有多少人能够坚持学术独立的思想，反对聘用科学院的高级官员？
科学院成立历史研究所，决定让郭沫若、范文兰、陈玉克担任各研究所所长。陈直接拒绝了。这样的精神对于受邀写信的郭墨来说也没什么不同。
作为历史学家，陈是民国初期清华大学的四位导师之一，另外三位分别是梁启超、王伟、赵元仁。他以二十多种语言著称，他的《唐朝起源简论》和《唐朝政治史简论》对后代的学术研究产生了很大影响。在他晚年失明的情况下口述了"刘不是传记"，诗歌史相互取证，令人耳目一新，可以说是陈玉科一生的结晶。
梁启超曾经说过：《我梁》是一本书等等，但作品总量还不如陈先生的几百字那么有价值。
福贤曾经说过：陈先生的学问，光是近三百年。
这些学术同事的肯定具有极大的自然价值。
刘文贤一生的骄傲，也是其知识和个性的钦佩，他说，陈玉科拿着400工资，我只能拿40，而沈从文只能拿44根头发。
刘文贤对沈从文的评价是不公平的，他是学术性的，尊重陈玉科。沈从文以文学著称，文人轻盈可见。
陈玉科不仅学得好，讲座也充满魅力，曾经说过："我说过，我不说话;现在只是没有人说过。"每次上课，班上都挤满了学生，甚至有一些大学老师来听，比如朱子清、冯友兰。
曾经为清华大学的新生出国，陈玉科出一对，上工会为"太阳行者"，只得到一个人满分，回答"胡世之"，这个人就是周祖木，后来成为著名语言学家、北京大学教授。
陈玉科就像一座丰碑，他的学术成就注定有一天会被超越或发现很多缺点，但他的精神，他对学术的坚持，将永远激励着子孙后代前进。
这样一个坚强而独立的天才灵魂，是不能被高估的;