在克倫威爾所掌握的巨大權力當中，對于國務會議的政治壓制和控制自然是我們意料之中的，因為即便沒有那個所謂的"施政檔案"，國務會議依舊是被獨立派成員控制，而克倫威爾依舊是獨立派的最高領袖，是國務會議的最高統治者。
不過最為重要的是，通過該檔案的官方規定，身為護國公的克倫威爾實際上是一個集行政權、司法權、軍事權等，多方面權力于一身的專制者和上司者。
這其中最為重要的便是，克倫威爾對英國軍隊的絕對掌控，作為全國軍隊的最高統治者、總司令，克倫威爾具備無條件上司軍隊、發動戰争、調動軍隊作戰等一系列權力。
這就表明在護國公制度建立之初，依靠着克倫威爾所掌控的強大軍隊，整個英國就已經陷入到了軍事獨裁的政治威脅當中。
此後，由于"施政檔案"過度強化了克倫威爾本人，也就是護國公的權力，使其達到了一個全新的高度，引發了一些政府官員和民主主義者的不滿。
公元1654年9月，護國公時期的新議會第一次召開，一些不滿議員便開始提出想要重新審視檔案的要求，這令克倫威爾勃然大怒。
已經完全被權力沖昏頭腦的克倫威爾揚言，議會應在護國公的統治下，其并無任何權力去幹預護國公的權力，并一怒之下将剛剛召開會議的議會解散了，由此可見克倫威爾本人的極度專制。
公元1655年，為了防止英國出現反護國公制度的運動，克倫威爾将英國的統治範圍劃分成了11個軍區，紛紛派遣重兵駐守，在全國推行全面高壓的軍事獨裁統治。
随着克倫威爾在全國範圍内建立起了軍事獨裁統治，這也令這種護國公制度的專制色彩，達到了全新的高度。
就是在這種高度集權專制的情況下，獨立派那些克倫威爾的忠實追随者們，又開始了策劃新一輪的政治改革。
而且當軍隊作為一種正常化的專制統治工具之時，這令克倫威爾的獨裁已經和之前的君主專制，不存在較大的差別。
正因如此，獨立派進階成員以及當時國務會議成員，開始頻頻慫恿克倫威爾登基稱帝，重建立立一個封建君主王朝，讓英國徹底進入到克倫威爾以及獨立派掌權的光輝時代。
公元 1657年，國務會議自行通過了一項決議，并請求克倫威爾能夠通過，該決議的主要内容便是倡議克倫威爾建立起公開的君主制度，将此前已經廢除的國王制度恢複。
與之相适應的便是國王的專制權力也需要得到全面恢複，一旦克倫威爾稱帝之後，其作為英國的最高統治者，有權利直接任命國務會議的成員，可以随意決定會議的召開時間和關閉時間。
盡管克倫威爾的追随者們，有着如此令人欣慰和激昂的表現，但是克倫威爾在最終還是沒有走到稱帝自立的一步。
一方面是因為當時也有不少進階軍官，是推翻封建君主專制政體的功臣，一旦自己重回老路的話，必然也會遭遇他們的抗議。
另一方面便是克倫威爾對當時英國政局，還是有着清醒的認識，護國公制的建立，已經令他成為了至高無上的統治者，無需為此走到魚死網破的地步。
克倫威爾及獨立派高層通過一步步的戰略規劃，将獨立派清除英國政治舞台，同時将封建貴族、長老派牢牢掌控在自己手中，終于完成了護國公主制度的建立。而克倫威爾作為此時英國的第一任護國公，肩負着至高無上的權力。
護國公作為當時英國的最高統治者，在政治、經濟、軍事等方面進行了權力的全部壟斷。即便像國務會議這樣的最高權力機關，在護國公面前同樣也沒有任何話語權，他們就像是政治傀儡一樣，隻能聽從護國公的指令，秉承護國公的旨意辦事。
至高無上的統治權隻是護國公制獨裁專制的一個表現，此外，克倫威爾還能夠依據自己的喜怒哀樂，肆意調整英國的議會成員，這和當初的君主，特别是查理一世、詹姆斯二世之時非常類似。
克倫威爾通過将全國劃分為11大軍區的方式，利用軍隊力量來為自己的軍事獨裁，建立起有效保障機制。但是在自立為帝的這一件事情上，克倫威爾始終不敢越出雷池半步，這充分證明資産階級革命對英國具有深遠且重大的影響。