可以從以下幾方面去分析朱棣是朱元璋的親生兒子
朱棣出生于元末亂世至正二十年（公元1360年）五月初二，生于應天府(今南京)，是朱元璋的第四子。前線傳來了陳友諒進攻太平（今安徽塗縣）的告急文書，1361年朱元璋親自率軍讨伐，大破陳友諒水軍于安慶，長驅直入抵達江州，打的陳友諒屢屢戰敗。
朱棣
是以從時間上可見朱棣是朱元璋的親生兒子。
朱棣的母親馬氏(馬皇後)，早在1352年，在陳友諒率兵東下（公元1360年）之前就認識了，并且是馬氏的養父郭子興親自許配給朱元璋的。1352年（至正十二年），郭子興在定遠（安徽定遠）起兵響應。
朱重八(朱元璋)與馬氏
郭子興舉兵起義，成為當時白蓮教的首領，同年農曆2月27日，率領起義軍攻下濠州後，郭子興自稱郭元帥。濠州鐘離人朱元璋前來投奔郭子興的義軍，朱元璋加入對伍後精明能幹，處事得當，打仗時身先士卒，獲得的戰利品全部都上交郭子興元帥，得到了郭元帥的賞識！并給他封功行賞，又說功勞是大家的，就把賞賜分給大家。
郭子興元帥
後不久，朱元璋在部隊中的好名聲傳播開來。郭子興也把他視為自己的心腹，有重要事情總是和朱元璋商量 。郭子興見朱元璋是個人才，覺得對自己的事業将會有很大的幫助。于是便把養女馬氏許配給了朱元璋。馬氏與朱元璋成親後，和朱元璋感情深厚，追随朱元璋南征北戰，精心輔佐朱元璋。
朱棣的母親孝慈高皇後1352年（至正十二年）嫁給了時為紅巾軍将領的朱元璋。
朱元璋與馬皇後
婚後與朱元璋感情深厚。就一直陪伴在丈夫的身邊，跟随着他東奔西走。對于朱元璋來說，馬氏不僅是個賢内助，幫助他管理好家中的一切事物，同時也是他的好助手。随着老朱南征北戰，建立大明基業，為大明奠定了基礎！她的賢良淑德得到了全國上下的認可，得到了百姓們的愛戴，同時也得到了丈夫的寵愛，成為朱元璋最愛的老婆。
是以從以上幾點可以看出，朱棣是朱元璋的親生兒子。