人工智能的崛起。
如果有一天人類成為了機器的奴隸，自然繁殖的特征被完全剝奪，每個人都隻能讓一群機器把人類養殖到動物園中。一旦胚胎發育到合适的時間，他們将被專門負責收集的機器人逐一收集。經過機器篩選，被貼上合格标簽的人将在這個超大矩陣中度過一生。
矩陣将收集人類産生的生物電能作為機器功能，其中所有被機器淘汰或即将死亡的人都會被機器無情的抛棄。然後像充排洩物一樣直接将人類視為垃圾。
随着下水道廢棄的人類将進入回收中心，然後通過機器碾壓合成轉化為黑色液體，最終成為促進下一代生長的營養物質。為了更好的控制和研究人類，這些機器專門創造了一個虛拟世界，讓人們認為這個世界是一個真實的世界，男主就是其中之一。他白天在公司工作，晚上翻牆查資料。
作為黑客，這一天他在國家安全網上發現了一個奇怪的人。這個女人不僅可以一個人對付兩組警衛隊，還可以跳過移動。面對卡車的追擊他不得不沖進卡車撞擊的電話廳。但是當追蹤的IBI下車搜尋時他突然消失了。
然而有一天男主人獨自去了酒吧，原來消失的女人突然出現了，并主動告訴男主人世界被舉證控制，一切都是假的，但沒有告訴男主人舉證什麼。等到第二天男主再去上班時候就被一群警察盯上，他們把男主帶到了一個秘密基地。
警衛隊長拿出一堆記錄男主多年來作為黑客記憶的檔案，男主人剛想反駁，卻發現自己的嘴已經被封住了。在恐懼中他沒有時間做出反應，被警衛壓在桌子上。然後一個警衛拿出一個藥丸，藥丸在很短的時間内變成了昆蟲。當面無表情的警衛放下昆蟲時他的觸須很快鎖定了肚臍的位置，不顧男主人的痛苦，他完全消失在男主人身上。
在恐慌中男人突然從睡夢中醒來，當他懷疑剛才的一切是否是夢時，電話鈴突然響起。一個忐忑不安的男人接起了電話，一個自稱墨菲斯的男人說他可以幫助他，懷疑中他還是來到了約定的地方。還是以前的女人來迎接他，隻是他一上車就被一把槍抵住了。
然後女人拿起一根巨大的吸管，瞄準男人的肚臍，啟動了儀器。看到皮肉立刻快速移動，在劇烈的疼痛傳導下，男人甚至無法控制咆哮。女人抓住機會按下按鈕，平靜的把昆蟲吸出去，閃爍紅光的藥丸也完全失效。女人想帶她去見她，就是墨菲斯之前打電話給她的那個人，她是反抗軍的統領。
她告訴男主，雖然世界表面上是1999年，但實際時間應該在2099年附近。由于21世紀人工智能的不斷發展，最終機器人集體覺醒。在那場戰争中，人類徹底失敗最終淪為機器的傀儡。但他們中的一些人提前意識到，這個世界是一個由機器控制的虛拟世界。而現在男主尼奧就是那個至關重要的人物。
為了尊重尼奧的選擇，她拿出兩個藥丸，選擇綠色意味着忘記一切繼續生活。選擇紅色意味着把尼奧帶入現實世界。尼奧毫不猶豫的選擇了紅色。随着療效開始發揮作用，原來破碎的鏡子慢慢恢複，變成不知名的營業包裹着她，恐懼在傳播之前就侵入了她的全身。
血色培養敏赤裸的身體突然醒來，在透明的粘液中，人影立刻坐了起來。但她終于拔出了嘴裡的氣體，落入她眼中的是不可思議的。看到她周圍擠滿了像她這樣的人。
