使用JDSoft SurfMill繪制三維圖形必須先了解三維坐标系的概念。在三維坐标系中的X、Y、Z的位置關系可以用右手法則來描述。JDSoft SurfMill8.0中把在三維設計中遇到的坐标系分為兩類：世界坐标系和使用者坐标系。
(1)右手法則
右手拇指、食指和中指兩兩互相垂直，其中：
拇指方向代表三維直角坐标系的X軸方向
食指方向代表三維直角坐标系的Y軸方向
中指方向代表三維直角坐标系的Z軸方向
如果拇指指向代表軸的方向，其餘四指并攏彎曲，彎曲方向為繞旋轉軸旋轉角度的正向。
(2)世界坐标系(WCS)
英文全稱為World Coordinate System，是系統預設的固定不變的坐标系，它不會随着繪圖平面或視圖的變化而改變。世界坐标系是唯一的，使用者不能修改。世界坐标系的标記為一正方體并始終位于螢幕的左下角。
(3)使用者坐标系(UCS)
英文全稱為User Coordinate System，是由使用者定義的空間三維坐标系。使用者坐标系可以根據使用者繪制圖形的需要而建立、修改或者删除。一個坐标系有三個平面與其對應，即XOY平面、XOZ平面和YOZ平面，每個平面都可以根據需要設定為繪圖平面。
(4)系統目前坐标系
在定義了多個使用者坐标系統後，隻能有一個作為系統目前坐标系，預設情況下将世界坐标系設為預設的目前坐标系統，也可根據需要更改目前坐标系。在進行點的輸入和繪圖操作時，均是針對目前坐标系而言的。
(5)繪圖平面(CPlane)
繪圖平面又稱為構圖平面(Construction plane)，繪圖平面與目前坐标系相關聯，可設定為目前坐标系的XOY平面、XOZ平面或YOZ平面；目前繪圖平面可通過F9鍵切換，或通過下圖所示的常用工具條中的設定繪圖平面按鈕進行設定。
下圖為坐标系和繪圖平面的圖例：