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鰓是南美白對蝦重要的器官，主要起呼吸作用，同時鰓部又是蝦發病時的一個訓示性器官，許多病原都會導緻對蝦發生鰓病，這是因為鰓部是蝦體與外界直接接觸的器官，其防禦能力又較弱，是以當病原感染時，鰓部往往首先受到危害而出現症狀。
由于鰓參與了蝦體的呼吸、排洩等生理活功，在機體代謝中起着十分重要的作用，鰓功能的損害，必然使病症加重，甚至死亡，這也是對蝦鰓病危害性較大的原因。通過觀察蝦鰓的病變，尤其是鰓部的顔色，可以及時的判斷對蝦的發病情況及病因。常見鰓病變的顔色表現為黃色和黑色。
具體原因可以分為以下幾種：
1、細菌性侵染：
對蝦患病後，攝食減少或停止，常無規則的在池邊緩慢遊動，時而頭朝上在水面打轉，易受驚而跳出水面。換水時，常因體乏被水流沖至排污口攔底。重症者失去平衡，側卧池底死亡。引發該病的病原為弧菌，其中以溶藻弧菌、副溶血弧菌、鳗弧菌最為常見。
在發病的初期，蝦鰓呈淡黃色。随着病情的發展，鰓絲更加腫大，呈松散狀，并由黃色變為黃褐色，形成斑塊；鰓組織變脆，甚至糜爛；體色轉暗，鰓區甲殼内側變黃。第二觸鞭變紅易斷，甲殼上有黑色潰瘍或黑斑，肌肉白濁，有些對蝦的遊泳足變紅，血凝時間延遲。鏡檢可見鰓絲末端無規則腫大，鰓組織出現空泡狀變性；鰓絲内部和血淋巴中有杆狀細菌活動。建議拌料内服五黃粉+弧菌淨，用于蝦蟹及蛙類紅腿病、熒光病、瞎眼病、爛鰓病、黑鰓病、甲殼潰瘍病等細菌性疾病的防治。
2、纖毛蟲類附着：
病蝦活動呆滞，食欲減弱。鰓蓋略外翻，鰓部膨大，鰓絲上附有許多絨毛狀的淺黃色物體，若粘有其它雜物則常呈黃褐色或黑色。在顯微鏡下可見附着物為大量密集、能活動的纖毛蟲。纖毛蟲一般不侵入蝦體組織内，鰓部等組織，包括血液都無明顯的病理變化，也未發現細菌或其它生物。病蝦鰓部發現的纖毛蟲主要有聚縮蟲、單縮蟲和累枝蟲、鐘形蟲。建議拌料内服寄生淨，驅殺和抑制體内外寄生蟲及水中遊離寄生蟲，如斜管蟲、車輪蟲、纖毛蟲等；産品在 水産養殖技術寶典。寄生淨是以安全無毒的中藥原料，具有内外雙驅蟲的效果，讓寄生蟲逐漸脫離魚體，同時處理寄生蟲導緻的鰓部粘液過多、鰓小片腫脹的問題——這是寄生蟲危害最大的地方。通過這兩個方面的作用，達到魚體逐漸恢複健康的目的。
3、藻類附生：
在藻類繁殖過盛，蝦池水呈近醬色時，對蝦也會因大量藻類（特别是矽藻）堆積于鰓葉中而使鰓區呈黃色。但蝦的活動攝食并未出現明顯異常。在一些建立的黃泥底質蝦池放養潛底性種類，或進行越冬，由于鰓部沾了底泥，對蝦也會出現黃鰓。
4、環境不良：
由環境因素造成的黑鰓是生理性的，外觀鰓區呈一條條黑色花紋，鏡檢時鰓絲局部或彌漫性壞死，壞死的鰓絲呈褐色或黑色。養殖用水被镉、銅、原油等污染後水質變差，池底殘存飼料腐爛分解後産生氨、亞硝酸鹽、硫化氫等物質，使蝦慢性中毒而引起黑鰓病；也有因為在防治蝦病時使用硫酸銅或高錳酸鉀劑量過大或次數過多，銅離子直接損傷鰓絲，或高錳酸鉀形成的二氧化錳粘附在鰓絲表面，引起黑鰓；此外，由于對蝦缺乏維生素C，也易引發蝦患黑鰓病。
黃、黑鰓對對蝦的危害：
1、對蝦患病後，攝食減少或停止攝食，生長緩慢；
2、無法适量的吸收水體營養物質、微量元素會造成瘦身、棉花蝦，直接影響對蝦的上市銷售；
3、病蝦因鰓部呼吸功能受損，引起對蝦呼吸困難體内中毒缺氧，體質差而出現脫殼不遂陸續死亡。
對蝦鰓病防治方法：
1、增加開啟增氧機的時間：以提高池水溶解氧的含量，因為對蝦鰓部有病變，易引起蝦體缺氧，當遇到不良天氣時，導緻大量死亡。
2、有條件時先換水15-20cm：然後用水體消毒劑聚維酮碘等全池潑灑，隔天重複一次。最好消毒後的第二天再适當換水。
3、生石灰一次用量，每畝15～20公斤，定期全池潑灑，預防由水中懸浮物有機質過多引起的黑鰓病。但是池塘氨氮NH4過高時，特别是高于标準時，要慎重使用生石灰，或少量多次的方法潑灑生石灰。
4、定期驅蟲抑菌：纖毛蟲引起的對蝦鰓部問題，可用寄生淨，1袋拌120斤料，并配合潑灑，1袋潑灑一米深的水5畝，有效防治纖毛蟲；同時，配合弧菌淨可以抑制弧菌，抑制有害菌的繁殖。臨床應用證明能有效抑制和有害病菌病原微生物的生長繁殖，維護動物呼吸系統、腸道健康，可長期安全添加，無害無殘留。