兇猛的暴力，進球的小組賽階段讓人們對下一個淘汰賽階段有點擔心，那麼下一場比賽會讓人失望嗎？
從小組中突圍的八支隊伍中，他們将互相戰鬥，直到最終的獲勝者确定為止。1/4決賽的第一輪由東道主智利對陣蘇聯，這是1960年第一個歐洲杯冠軍。雖然蘇聯隊有像亞辛這樣的超級門将，但他們在本屆世界杯的防守中表現不佳，已經丢了五個球。果然，智利的萊昂内爾·桑切斯在首場比賽開始僅11分鐘就打進了他本屆賽事的第三個進球。雖然蘇聯一度扳平比分，但埃拉迪奧·羅哈斯在比賽第29分鐘的進球讓智利隊以2-1領先進入四分之一決賽。
萊昂内爾·桑切斯
巴西隊在沒有貝利的第四輪比賽中的對手是英格蘭隊。雖然貝利隻能在場邊，但巴西人仍然是一支星光熠熠的球隊，尤其是被稱為鳥的加林查。這位巴西球星比另一位短六厘米，他在整個比賽中都與英格蘭的球員交手，最終以他的Meka II和Wawa的進球進入四分之一決賽。
相比之下，德國聯邦對陣南斯拉夫和匈牙利對陣捷克斯洛伐克的比賽表現平淡無奇，南斯拉夫直到比賽結束才在對陣德國的比賽中打進一粒漂亮的進球。捷克斯洛伐克在第13分鐘以舍雷爾的進球打開了進球的大門，依靠難以穿透的防守戰術確定了1-0戰勝匈牙利。
在半決賽中，巴西隊和智利隊相遇，盡管智利隊一如既往地在場上不時地激烈，甚至有點野蠻。但這并沒有阻止翼鳥加林查，他打開了第二個，瓦瓦也打進了第二個，東道主巴西4-2晉級連續兩屆世界杯的決賽。
在另一場半決賽中，捷克斯洛伐克以3-1淘汰了南斯拉夫，并在曆史上第二次晉級世界杯決賽圈，這要歸功于謝雷爾的點球大戰。值得一提的是，謝雷爾在淘汰賽階段已經打進了三個進球。
在三到四強賽中，東道主智利憑借埃拉迪奧·羅哈斯（Eladio Rojas）在最後一分鐘的進球創造了有史以來最好的世界杯紀錄。
決賽迫在眉睫，但更神奇的事情之一是，本應被禁賽的加林查進入了決賽，據說巴西總統已經介入，讓加林查參加決賽。最終，國際足聯打開了網，解除了加林查的禁令。比賽第15分鐘，捷克斯洛伐克的馬索普斯特為他的球隊取得領先。但捷克斯洛伐克的喜悅隻持續了兩分鐘，替補出場的阿馬拉爾多再次幫助巴西扳平比分。兩隊在上半場1-1握手。
巴西隊在下半場完全控制了比賽，阿馬拉爾多在第68分鐘送出一次助攻，齊托的頭球将比分扳回前場，第77分鐘，瓦瓦抓住對方門将的失誤，将比分鎖定在3-1，巴西隊赢得比賽，成為第三支兩次赢得世界杯的球隊， 在烏拉圭和意大利之後。
盡管巴西隊衛冕冠軍，但世界杯一直難以形容，總共32場比賽，隻有89個進球，平均2.78個進球。這位隻打進四球的最佳射手并列六球：巴西的加林查和瓦瓦，智利的桑切斯，南斯拉夫的傑科維奇，蘇聯的伊萬涅夫和匈牙利的阿爾伯特。與低進球率形成鮮明對比的是，共有34名球員因傷退出比賽。