慈禧駕崩以後，新朝所有擁護光緒帝的官員都對袁世凱恨之入骨，把驅袁作為當時最重要的事情。一場旨在肅清奕匡、袁世凱，鞏固攝政王執掌國家地位，重新配置設定公權力的鬥争悄然展開。
袁世凱
驅袁被提上日程
慈禧死後，皇權威嚴衰落。在當時的攝政王載沣看來，奕匡和袁世凱對清朝的政治權威和君權構成了嚴重威脅。許多企圖在新朝達到高位的皇族，如山奇、載澤等，也把位高權重的慶親王奕匡視為眼中釘，把擁有巨大權威的袁世凱視為肉中刺，都想趕緊除掉。奕曠貪婪卑劣，但因其在中心數十年的曆練，被禦賜奉為世襲的慶王爺。他在宗室中威望高，在朝臣中分量重，後輩不易撼動。
慈禧
袁世凱在年輕人眼中不過是清朝的奴隸，地位比奕匡略低得多。康有為、梁啟超稱袁世凱背信棄義光緒帝，被囚禁在瀛台。多年不如意，英年早逝，也讓袁世凱的形象極為難看。新朝所有愛戴和同情光緒帝的官員，都非常憎恨袁世凱，把驅袁作為當時的第一要務。一旨在肅清奕劻、袁世凱，鞏固攝政王執掌國家地位重新配置設定公權力的鬥争悄然展開。
奕劻
敖其林、姜春林、趙炳林三人率先出擊。趙麒麟曾因彈劾段之貴為載貞獻妓楊翠熙而得罪奕劻和袁世凱，被慈禧太後革職。後來，他在社會團結的情況下複職。三位禦史先後登基，非法袁世凱。此時，袁世凱也因一系列政策紛争，為他人創造了機會。袁世凱就任外交通商部部長以來，與歐美交好，抵制日俄對中國東北利益和權益的蠶食。他在籌劃這些措施時，很少與其他在朝軍機大臣商議，也不向朝廷請示，這難免觸動載沣的天平。1908年12月10日，袁世凱将中美互派大使問題送出朝廷讨論，在僞滿政府内部引發激烈沖突。此外，袁世凱誤判美國對日外交态度，與美國達成中德同盟的提議破産，引發朝臣的攻擊和日俄駐華公使的刁難，陷入政治困境。
1909年1月1日，袁世凱因财政問題，若怒了現任支部尚書的滿族欽貴。袁世凱得到可靠消息，連夜逃往天津。1月3日，禦史趙炳麟為陳天尚彈劾袁世凱，稱其“機械詐欺，善建血肉”“包藏禍心，不顧大義”“獨掌大權，冒進等”“長期持軍，持兵而驕”“入官制，怒而貴，搖樞臣，頗唐朝。
載沣從帝國寶座上找到借口，決定利用有利時機除掉袁世凱。當然，這不是一件容易的事。要感動袁世凱，不僅要有拍闆的勇氣，還要有過關斬将的能力。載沣剛剛拟定除袁诏書，稱其“盛氣淩人，不屈不撓”，準備奪走袁世凱的官銜，代為保管處置，是以不得不面對朝廷重臣和駐華外相的反對。長期居于中心、統領軍機長的奕匡，以及高官厚祿的史煦、張之洞等朝廷重臣，都不贊成除掉袁世凱。在勸阻載峰的同時，張之洞聲稱，兩宮必須保持穩定局面。袁世凱長期率軍，朝臣中不乏黨羽。新王朝需要穩定來應對艱難時期，不應殺臣添是非。
載沣
不僅如此，袁世凱于1906年辭去職務，将一、三、五、六鎮新軍移交陸軍部。1907年，袁世凱由明升、暗降調離北洋軍，任兵部部長、外交部部長。可以說，袁世凱的權力走了，不會對朝廷構成威脅。隻要他不用力過猛，就不會帶頭反對。袁世凱逃到天津後，時任英國駐華公使朱爾典親自為袁世凱求慈慈禧發誓要救他的命。同時，袁世凱以“腿疾”為由停止一切參與軍部和外交部的事務。駐守保定的北洋将領段祺瑞鼓動南苑兵鬧事，準備平定“南苑兵”改“為京師之名，雖然事件很快被平息，仍然震驚朝野。
面對朝廷内外的反對和北洋新軍的威脅，載沣猶豫不決，最後不得不通過袁世凱的“腳疾”找到一個台階下。同日，載沣以宣統皇帝名義下诏書，稱袁世凱患足疾，難奪其職，立即開辟短缺，回鄉養病，以示朝廷對大臣的體恤。袁世凱安全逃脫，暫時回避權力中心。載沣要清掃袁黨羽，袁世凱的離開是雙方為維持時局穩定而作出的讓步。将袁世凱排除在中心之外的目标，保袁派也實作了挽救袁世凱性命的初衷，雙方的較量自然進入了下一個環節。
對載沣來說，除了加強監視在河南彰德桓上村伺機而動的袁世凱外，逐漸斬斷在朝黨羽，聚攏分散的勢力。時任郵政部尚書的陳弼與北洋部關系密切，首當其沖受到攻擊。禦史謝元漢彈劾陳弼上位，說他空無國家錢财，貪贓枉法謀取私利。載沣大怒，召開軍機大臣會議，意圖先罷免陳弼，再嚴懲他。他被陳弼等幾個軍機大臣勸阻，不得不同意委任先吃了。
1月14日，載沣以宣統皇帝的名義下诏書，稱有人打陳弼虛國庫，派大學士孫家鼐、那桐公正無私地調查，據實而打，不應晦澀難懂。陳弼知道載沣不滿自己處理靈公不利，大肆賣缺賣缺，與袁世凱關系密切。證據一經查實，後果不堪設想。于是他和一些下屬一起篡改往來賬目，以消除痕迹。孫家耐、那桐等去查郵通處，也找不到多少證據，隻好以鐵路局局務人員工資太高為由坐鎮。2月6日，載沣不得不根據孫家鼐、那桐奏事，将陳弼交部調查，兩天後罷免。陳弼去職後，唐紹儀、嚴修、楊士奇、蔡乃煌、馮如祺、朱家寶等袁世凱黨羽也被排除在外。當時風聲鶴唳，朝廷裡很多元黨都驚慌了，不知道哪一天會輪到自己。面對政治紛争，許多人都試圖保護自己，不願坐以待斃。時任直隸總督楊世祥表面快迅速劃清界限，拒絕與袁世凱見面以撇清關系，并賄賂張儀在醇親王府上下向他求情。為了迎合權貴載沣，楊世祥在直隸率先清理财政，講要肅清中飽私囊的官吏，省吃儉用，關心百姓疾苦，非常及時。載沣以楊世祥為典型。一方面，他的批示符合朝廷閱民難的初衷，不愧是朝廷官員的領袖。另一方面，他在召見時稱贊他，說他為人踏實，今後要更加勤勉，特别是加強憲政的推行，以繼續成為各省的楷模。楊世祥不久病逝，被追授為太子少保。袁世凱的摯友、摯友徐世昌更是忐忑不安，隻好以身體有病為由要求補缺。載沣本來想趁機把徐世昌拿下來，但心裡不是很有把握。在軍機大臣石旭、鹿傳麟的勸說下，載沣以東三省事宜緊急為由，暫時拒絕了徐世昌的請求，讓他繼續留任東三省總督一職。徐世昌在松了一口氣的同時仍感到不安，于是再次收起身子要求内調，将自己置于載沣的眼皮底下，以示心中再無他主。正巧，陳弼被載沣解職，郵傳部尚書一職空缺。徐世昌得以因禍得福，進入郵政通信部。
徐世昌
載沣對徐世昌的順從和聰明非常滿意。他先是給了他郵政通信部部長的職位，後來又加了大學學位協辦人的頭銜，使他進入軍部。可以說，他被尊崇寵愛，被視為知己。捕完蝦蟹，下一步自然是釣一條大魚。這條大魚就是一直被認為是袁世凱背景的奕匡，但事情并沒有這麼簡單。禦史蔣春霖等人推倒一隊袁蕩，火力大開，将槍口對準身居高位的奕匡。蔣春霖告訴載沣，袁世凱雖然去了，但奕匡繼續留在中央，還是一大災難。帝國趙炳麟不甘示弱。他登基說，袁世凱雖被罷免，但他的黨有奕匡作為關照，直隸總督楊世祥提供财力。萬一朝廷偶有危險，他們就會趁機威脅他。他主張将楊世祥調離直隸總督，切斷袁世凱的經濟來源。
趙炳麟
載沣召見趙炳麟時，趙炳麟建議公布光緒帝刺殺袁世凱的诏書，澄清其罪行，罷黜袁世凱為叛徒，任命張之洞為獨相，啟用岑春暄負責侍衛，任命康梁等立憲黨為皇帝元老和攝政王謀士，實施憲政，聚天下之心。載沣擔心趙炳麟的意見，沒有采納。張之洞堅決反對罷免奕匡，認為奕匡是個嚴肅認真的人，應該信任他來安撫宗室。于是載沣隻好放棄，重新等待。
至此，一場以禦史彈劾袁世凱為開端、意在肅清袁勢力的政治鬥争，以袁世凱離職、黨羽暫時分離、奕匡如山不動而告終。