中医教科书解释的阴阳五行，停留在哲学层面，但是哲学与科学是有区别的。我们怎么去回答阴阳的问题呢？如果简单地描述阴阳学说，从功能上来讲，阴阳是生理学上讲的兴奋与抑制。什么原因导致人体的兴奋与抑制？主要是在蛋白质与核酸层面的活化与失活，导致细胞、器官发生兴奋与抑制，从而使人整体表现出兴奋与抑制，即阴与阳的两种状态。
中医认为人体是以气血精津液为基本原料，以经络为通道，通过相互协同、相互制约的五脏，发生气血精津液的运动与变化，这就是中医讲的气化。气化活动最终表现为生理功能的兴奋与抑制，也就是阴阳，从而完成生命活动与生殖活动。西医认为人体是以氧、糖、脂、蛋白质、维生素、微量元素为基本原料，通过八大系统(运动、生殖、神经、呼吸、消化、循环、泌尿、内分泌)的协同作用，发生物质与能量的转化，最终使细胞与器官功能出现兴奋与抑制状态，从而完成生命活动。
所以中医说的原料是气血精津液，西医是氧和营养物质；中医是以经络为通道，通过五脏发挥作用，西医是八大系统；中医最终发生的是气血精津液的运动与转化，即气化；西医最终是物质能量与信息的转化，即新陈代谢；中医最终所呈现的是阴与阳的两种功能状态，西医是生理功能的兴奋与抑制。
西医认识人体主要有三个学派：第一是结构学派，主要通过解剖、光学显微镜与电子显微镜，去研究人体的结构；第二是功能学派，从系统、器官、细胞和蛋白质水平上，去了解人体的功能；第三是信息学派，主要研究生物大分子(如核酸、蛋白质、多糖等)是怎样传递生物信息的。例如核酸是三联子编码，是信息的一个主要分子；蛋白质通过量的变化和磷酸化来传递生物信息；多糖也传递生物信息。
我们可以从三个方面去研究阴阳：第一，阴阳的物质基础。基因、蛋白，包括神经内分泌等方面都可以表现出阴阳的某些特性，所以阴阳是有物质基础的。阴阳的物质基础不是某一个物质，而是多个物质都影响机体的生理功能，协同表现为阴与阳的特性。第二，阴阳的功能。比如要研究导致机体的兴奋与抑制的原因，可以从蛋白质、细胞和整体水平上去研究。第三，阴阳的信息。可以从物理学的层面去探讨，比如可以把阴阳理解为人体内物质、能量与信息的两种状态：阴成形是物质、能量和信息的自组织过程，从而形成细胞与器官，构成了“人”这个自组织的生物；我们活着的人需要消耗物质与能量，而阳化气是物质和能量的耗散过程；阴平阳秘是机体的一种自然有序状态，这些是以耗散结构理论为指导的阴阳研究方法。综上所述，研究阴阳，一方面可以去寻找阴阳的物质基础，另一方面可以从功能上去寻找阴阳的功能特征。只有把结构与功能有机地结合起来，才能更好地说明阴阳的本质。
1.阳化气研究。恶性肿瘤的特点是细胞分化低下，细胞的功能缺失。一个分化不成熟的细胞不具备细胞的完整功能，比如肝癌细胞合成白蛋白的功能低下。功能活动指的是气化，阳化气代表人体的功能活动。温阳药物有助于化气，能够促进细胞分化，提高细胞的功能活动，从而逆转肿瘤细胞，使其具有正常细胞的功能。我的硕士课题是附子多糖诱导早幼粒白血病细胞的分化，通过研究发现有些效果，但不是很明显。临床上使用的剂量要大，需用到患者发热、阳气来复为止，才能见到比较好的疗效。
2.阴成形研究。痰饮水湿属于阴的范畴，与肿瘤的形成有关系。阳虚阴胜就会导致寒痰凝结，所以我们研究用温化寒痰法治疗肿瘤。我们发现，单用化痰药物治疗痰饮凝结，效果不一定好。因为“病痰饮者，当以温药和之”，当临床中用附子配土贝、半夏、栝蒌、天南星等化痰药时，疗效会显著增加。我们还发现，单用附子时能够促进肿瘤细胞迁移，单用土贝母、栝蒌等化痰药物能够抑制肿瘤细胞迁移，但是当附子配栝蒌或土贝母时，不仅附子促进肿瘤细胞迁移的作用没有了，而且能够增强土贝母等药物的化痰作用。“病痰饮者，当以温药和之”，这句话是很有道理的，即治疗肿瘤不能够单纯化痰，也不能单纯温化，我们做过许多类似的研究。
3.和阴阳研究。莨菪(天仙子)温里，麻黄温表，麻黄含麻黄碱兴奋交感神经，莨菪含莨菪碱阻断迷走神经兴奋。交感神经和迷走神经在体内是相互拮抗的，在人体表现出类似阴与阳的功能活动，所以我们就用麻黄碱来兴奋交感神经，用莨菪碱来阻断迷走神经，可以导致第二信号分子CAMP、CGMP表达的变化，从而把乳腺癌细胞阻滞在G1期，最终抑制肿瘤的生长。
(百度百科-莨菪：又名“天仙子”。苦、寒、有毒，入心、胃、肝三经，有毒，具定痫、止痛之效，常用于治疗癫狂、风痹厥痛、喘咳、胃痛、久痢、脱肛、痈肿、恶疮等症。0.06～0.6g。外用：煎水洗，研末调敷或烧烟熏。天仙子是致幻植物中的佼佼者，始见《神农本草经》，中有“多食令人狂走。久服轻身，走及奔马，强志，益力，通神”。《千金方》：(1)治石痈坚如石，不作脓者：醋和莨菪子末，敷头上。(2)治恶疮似癞者：烧莨菪子末敷之。(3)治被打伤破，腹中有淤血：末莨菪子敷疮上。(4)治猘犬毒：服莨菪子七枚，日一。)
用麻黄治疗肿瘤来自阳和汤，《神农本草经》记载了麻黄能抗肿瘤，可治疗症瘕积聚。用莨菪冶疗肿瘤来自《圣济总录》，书中用莨菪配大枣，治疗“冷痃癖气”，这属于阳虚型肿瘤。
《伤寒论》用麻黄附子甘草汤治疗少阴病“但欲寐”，即白天瞌睡、困顿，也就是西医讲的迷走神经兴奋；黄连阿胶汤治晚上失眠，也就是西医讲的交感神经兴奋。为什么麻黄可以治遗尿？因为迷走神经兴奋导致遗尿，而麻黄碱可以拮抗迷走神经。麻黄可治过敏，如划痕症，皮肤一划一条白线，这是用麻黄的独证。如何判别阳虚？一个最简单的方法是划痕实验，西医的机理是迷走神经兴奋；中医说这是麻黄的适应证，也是因为麻黄碱能够拮抗迷走神经。交感神经兴奋使机体消耗，迷走神经兴奋则使机体储备，所以交感与迷走神经，也和阴阳有关系。我们通过研究麻黄的抗肿瘤作用，已经非常明确地知道它的机理是什么，适用于什么类型的肿瘤。
4.阴阳应象研究。我们做过季节与卵巢癌的关系研究，发现12月到3月复发的患者中位生存期只有19个月；而4月到11月复发的患者中位生存期是47个月，差了2倍多。卵巢癌12月到3月复发的无疾病进展时间只有8个月；4月到11月复发的是20个月，也差2倍多。这是为什么呢？因为卵巢癌是阳虚型肿瘤。“阳气者，若天与日，失其所，则折寿而不彰”，中医把阳气比喻为太阳，认为人体的寒与外界寒气相通，自然界日照最弱的时候是冬季，维生素D3水平低，容易导致肿瘤复发，这就是天人相应观落实到卵巢癌上的机理。
5.温阳治疗肿瘤的临床研究。“生之本，本于阴阳”，“少阳相火不可妄动”，“痞坚之下，必有伏阳”，“病痰饮者，当以温药和之”，我们要认真思考这几句话的道理。我们研究发现，用温法治疗的胰腺癌患者生存期最短，没有活过25个月的。临床上有很多胰腺癌患者表现为阳虚，比如说乌梅丸证。用乌梅丸可以显著改善患者的症状，但是很多患者的肿瘤却在进展，由此可见，辨证论治的优缺点值得进一步深思。
我们通过对胃癌的研究也发现：温法治疗的晚期胃癌患者生存期最短，很多都小于12个月。事实上，这些患者临床上使用温阳药物后，怕冷、乏力、消瘦、纳差、腹胀的症状改善很快，但是生存期大多较短。
用温法治疗肿瘤，里面有很多诀窍。我们对患者进行了多年随访，并经过现代科学研究之后，对温法治疗肿瘤的认识有了很大改观。我们研究了温法的机理，虽然也用温法治疗肿瘤，但是处方用药与传统的温法相比有了明显变化，配伍上也有很多讲究。我们从临床到动物，再到细胞，找到方法以后又回到临床。
比如温法可以促进细胞生长，但是我们把温法和化疗药物同时使用，先用人参把细胞阻滞在S期，然后用卡培他滨这类化疗药治疗。一个促进细胞生长，另一个杀灭细胞，这就是寒温并用、中西医汇通的思想。举一个病例，一位卵巢癌患者，肿瘤大概四五厘米，我们用大黄䗪虫丸这类处方，稳定了病情，控制住了肿瘤生长。她同时在做介入治疗，所以不能说完全是中药的效果。由于挂不上号，她找了另一个中医大夫治疗，用了十全大补汤，不到3个月，肿瘤长到了14～15厘米，腹大如鼓，全身衰竭，很快就死了。有人会质疑：患者全身状况很差，为仕么还要用大黄䗪虫丸？这个问题，我们可以思考。
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