鲁迅还会到以会稽山为代表的近郊山上采集植物，制作标本，同时也在继续自杭州时期便开始的古代散逸书稿的修复工作。这项工作是根据唐朝的《初学记》《北堂书钞》、宋朝的《太平御览》《太平广记》等类书（一种按照条目将各种文献摘录、整理成文章的百科全书），将引自已散失书籍的章句抄录下来，按照书目加以整理、校订。
《会稽郡故事杂集》和《古小说钩沉》便是这项工作的成果。前者汇集了会稽出身的人物传记和相关的山水风土记录；后者集录了从汉代到六朝时期的古代小说。后者使用的“钩沉”一词，意为用钩（钓钩）将沉没于水底的东西钓上来。该书试图尽量准确地揭示那些被蔑视、埋没的古代小说，探明古代人真实的心境与想象力。这本书与收录唐宋小说的《唐宋传奇集》，以及关于古代小说的史料集《小说旧闻钞》共同为鲁迅后来的《中国小说史略》奠定了基础。
从上文信中的“此非求学，以代醇酒妇人者也”一句，可以窥见鲁迅当时的寂寞和微妙的家庭生活。他的工作根植于一种真挚的热情，他希望用崭新的光芒照见被埋没之物，从而读懂古人的灵魂。在留学时，鲁迅立志从事的事业是研究中国人的“国民性”，揭示其“固有之血脉”，而这一时期的工作表明，他对理想的追求进入了更加脚踏实地的阶段
