有這樣一個手術，可以讓智力70的人智商翻倍達到140甚至更高。
沒做手術前，智力低下的查理覺得自己總體還算是幸福的，有朋友、有關心、有工作。雖然别人也會嘲笑他，但他不介意，他會跟别人一起嘲笑自己。他唯一有執念的事是想要“變聰明” ，希望自己變聰明之後能讓更多人喜歡他。
在對小白鼠阿爾吉侬做了腦部手術而初顯成效之後，查理也作為第一個人類案例接受了手術。
接受了腦部手術的查理果然開始有變化，他智商爆表，學習能力和了解能力也非常人所及，他過目不忘，就像掃描器一樣讀書，他能迅速掌握多種語言，了解多種學科的核心内容。
可是變聰明的查理也慢慢發現自己生存的真相，發現了父母對自己的抛棄，朋友對自己的愚弄，還弄丢了賴以生存的面包店的工作。
他如願以償得到了“聰明”，卻感到更加的孤獨和痛苦。
查理自始至終都是孤獨的，唯一能懂他的就是那隻同樣被做過手術的小白鼠阿爾吉侬。
在一次他和小白鼠作為科研成果的研讨會上，他帶着阿爾吉侬逃走了，并且拒絕再把自己當成試驗品，租了一套較高價的電梯大廈獨立生活。
他發現了自己的手術的設計缺陷——不可避免的倒退到最初甚至更糟。在跟小白鼠阿爾吉侬一起生活的日子裡，他看到了自己最後的歸宿：智商會驟然下降到以前甚至更低的水準，在污穢中孤獨的死去。
但是查理争分奪秒的去想辦法解決這個瑕疵，希望通過這個手術能幫助更多的智能低下者，讓大家都知道無論在手術前還是手術後，智商高的還是低的，他們都是人。
艾米麗狄金森說過，我本可以忍受黑暗，如果我不曾見過太陽。陽光刺破我内心的荒涼，它卻化作另一種荒涼。
查理是不幸的，他天生智力低下，被父母抛棄被周圍的人厭棄。
從另一個層面上來說，他又是幸運的。因為很少有人能突破自己的智力限制，過迥然不同的另一種生活。絕大多數人隻能看到或者學到一點點自己智力範圍内的事，無法批判或超越自己，絕大多數人都會按照基因的序列一點一點解碼自己的人生。
經過了手術後他走的每一步都揭開了一個新世界，他攀越了智識的高山見識了頂級智慧所能到達的地方，感受了男女之間的靈魂之愛，了解了人性的灰暗。而讓人難過的是，這些終究會不可避免的化為灰燼。
未完成的母愛，無法确認的來處。
手術前的查理無法認知被母親遺棄的真相，隻知道自己要變聰明，隻有變聰明才能得到母親的認可和愛。
手術後智力超拔的查理一遍一遍潛入到智力的深海去撈取記憶的碎片并重新進行解讀：
母親開始還在意自己還會跟人進行鬥争來證明自己的存在，有了妹妹後，母親發現查理是需要被藏起來的，是讓整個家庭蒙羞的存在，他是他自己的錯誤，母親甚至怕自己傷害妹妹，閹割了查理完全不自知的性欲，并毫不猶豫的把查理遺棄。
成為天才後的查理還是去看了母親，母親雖然能認出他，但他發現母親并不能真正的識别和接納現在的自己。
我變聰明了啊媽媽，你還會愛我嗎？
媽媽沒有給出答案。沒有答案就是答案。
很多母愛未完成者終生都需要療愈，一個缺愛的男生可能會找各種各樣的母愛替代品，去喂養内心深處那個缺愛的小孩，還有一些會不停的證明自己，證明自己配得上母親的愛。
未完成的母愛，讓查理明白情感的問題無法像智慧一樣被解決，沒有人性情感的調和，智慧與教育都将毫無價值。
我們都是查理
我們每個人都是查理，查理濃縮的幾個月就像我們的一生，能力由低到高再到低，生命色彩由淡到濃再到淡。
反應靈活思維清晰的青年時代固然精彩，然而失智的老年也是無可回避的真實存在，和查理代表的一部分智商低下者一樣，他們的人生也有他們的幸福，不要拿我們的白去對比他們的黑，你怎麼知道，我們的白就一定比他們的黑更精彩呢？
如果你想為他們做些什麼，發自内心的尊重就是最大的善意和愛。