龔賢喜用老辣樸拙的筆觸，沉着穩重，秃筆與尖筆兼用。秃筆，取之圓潤蒼勁，勾屋，皴擦，畫樹和點苔蒼老有力。
龔賢用筆在主張“欲秀而老”，秀而老就是準确、簡練而流暢有變化。畫家程正揆在贈龔賢的詩中道：“鐵幹銀鈎老筆翻，力能從簡意能繁”，這很好地點出了龔賢在用筆上的特點和成就。他提出筆法、墨氣、丘壑、氣韻作為畫家四要，主張作畫要中鋒用筆，并且要古、健、老、蒼，才能避免刻、結、闆之病，頗為精辟。龔賢用墨，以層層積墨見長，雖不用潑墨，實具有潑墨煙潤淋漓的效果，頗有宋人的用墨特點。
其畫山石樹木中鋒用筆，蒼勁古厚，并用積墨法作反複皴擦積染，多至十幾層，墨色極為濃重，但仍有深淺、濃淡、明暗等細微變化，山石樹木往往渾融一體，僅在陽面或輪廓邊緣處留出些許高光和堅實的輪廓，效果強烈，具有渾厚、蒼秀、沉郁的獨特風格，成功地表現了江南山水茂密、滋潤、幽深的特征。
龔賢作畫最善用墨，主張墨氣要厚、潤，他發展了積墨畫法，龔賢精研此法是追求一種蒼潤的境界，他以幹筆作墨骨，再以層層皴染包潤之，令山林樹木呈現出鮮潤沉厚的墨韻，使畫面濕潤厚重之感，這種畫法适于表現江南濕意濃重的山水景色，同時也使龔賢的繪畫具有了一種深郁靜穆的格調。
龔賢的畫法分兩類，世稱“墨龔”和“白龔”。他善用黑白對比的技法，前者濃密蒼茫，後者簡淡雅潔。他在《半千課徒畫說》中稱：“非黑，無以顯其白；非白，無以利其黑。”又如《平遠小景》圖（冊頁，紙本水墨）中所畫的房屋，簡潔明麗，在周圍筆墨的映襯下，潔白的屋牆似乎透出光亮。此處即用黑白對比的技法。
龔賢的山水畫非常重視構圖。他的畫視野開闊，氣象萬千。他的“三遠”構圖原則，發揮得淋漓盡緻，出神入化。他往往提高視線的角度，“平遠”構圖，多采取俯視角度，這樣，視野開闊，平淡中倍增飄渺的感覺。
—尺幅之中，山河無盡。
作“高遠”構圖，也是如此，先俯視，爾後眼光往上作仰視，真有下攬深谷、上突危峰的氣概。他十分注重上下的位置。他的山水畫一般很“滿”，但“滿”而不塞，常常用雲帶、流水作為空白透氣。從整個畫面來說，很有氣韻。
這才是龔賢的筆、墨、丘壑渾然一體的韻，進而創造出有地方特色的山水畫。他是當之無愧的“金陵畫派”的首領。