孔文遠，字紹先，孔子第五十一代嫡孫。《阙裡文獻考·世系》：“宋光宗紹熙四年授承奉郎，襲封衍聖公。制曰：‘孔子之後，自漢以來，世俾襲爵。國家崇儒重道，又過前代，于是有衍聖公之封。爾于世次，實當紹績其務，恪恭以承祭祀。’子一萬春。”
孔文遠于宋光宗紹熙四年（1193）襲爵，曾官至隆興府通判，秩滿授朝奉郎（正七品），卒于宋理宗寶慶二年（1226），葬衢州。
衢州孔氏家廟大成殿
孔元措，字夢得。孔元措的名字頗具傳奇色彩，來自其父孔摠的一場夢，《阙裡文獻考·世系》記載說，孔元措的父親孔摠“年已四十，生數子皆不育。及宰曲阜收葬枯骨，夜夢衆人來謝”，孔摠在修築曲阜城牆時下令保護周邊的墳冢，某天夜裡，夢到衆人來謝，其中有一人稍前曰：“‘嗟哉！暮雲之弗及。’既寤，又搜得十餘骸并葬之。已，複夢其人來謝曰：‘今子非爾子，後醜年庚月丁日所生，真爾子矣！當名元措。’已，果得子，因即以名之，而字夢得。”明昌元年（1190）孔摠因病去世時，孔元措年僅十歲。次年，金章宗明昌二年（1191）四月，十一歲的孔元措補授文林郎，襲封衍聖公，主林廟祀事。當時金帝的制書說：“聖谟之大，儀範百王。德祚所傳，垂光千祀。蓋直道以經世，宜承家之有人。文宣王五十一代孫孔元措，秀阜衍祥，清洙流潤。芝蘭異禀，蔚為宗黨之英；詩書舊聞，蚤服父兄之訓。語年雖妙，論德已成。肆疏世爵之封，乃煥章身之數。非獨增華于爾族，固将振躍乎斯文。勉嗣前修，用光新命。”金代初期的衍聖公爵高品低，階文林郎，秩僅正八品，是以金章宗又特诏衍聖公孔元措首階中議大夫，職視四品，并兼“世宰曲阜”，且“以後襲封，并準此例”。對于這段故實，《金史·孔璠傳》也有記載：“元措字夢得。三年四月诏曰：衍聖公視四品，階止八品，不稱。可超遷中議大夫，永著于令。”
乾隆《曲阜縣志·通編》記載，金章宗明昌元年（1190）春三月诏修阙裡孔子廟。二年（1191）春興廟工，五月又诏諸郡邑孔子廟隳廢者一律修複，冬十月勅黨懷英撰修孔子廟碑文。孔元措繼續了其父孔摠修葺祖廟的志業，奉诏修廟。金帝撥錢七萬六千四百多缗，命幹臣領其役，大修阙裡聖廟，是役于明昌二年春興工，至明昌五年（1194）秋告竣。此次擴建後的阙裡孔廟“凡為殿堂、廊庑、門亭、齋廚、黉舍，合三百六十餘楹。位序有次，像設有儀，表以傑閣，周以崇垣。至于楃座欄楯、簾櫎罘罳之屬，随所宜設，莫不嚴具。三分其役，因舊以完葺者才居其一，而增創者倍之。”（金黨懷英撰《大金重修至聖文宣王廟碑》）并以捏塑易兩庑群弟子及先儒畫像，增置祭田六十五頃，又始賜奎文閣之名。明昌二年的修繕，是宋天禧二年之後，阙裡孔廟再次大規模擴建，後世的廟制形态初步具備。金代從熙宗皇統二年（1142）至章宗明昌五年（1194）的五十餘年間，修阙裡孔子廟凡八次。此時的阙裡孔廟基本保持了宋代的格局，但部分建築規模卻進行了擴建，建立大中門、棂星門，且始用琉璃瓦，殿庑均以綠琉璃瓦剪邊，青綠彩畫，朱漆欄檻，檐柱也改為石質，并雕龍為飾，使阙裡廟制大為提高。但可惜的是，這一耗費巨大人力物力的工程，卻在不久南下的蒙古兵鐵蹄下廟貌又複殘毀，率多化為灰燼。《阙裡志·曆代碑記》記載說：“阙裡祠宇毀于金季之亂，閣号奎文，若大中門闼，存者無幾。”
承安元年（1196）冬十一月，金章宗行郊祀禮，召孔元措赴阙侍祠，位在終獻之次。二年（1197）正月，孔元措年滿十七歲，诏令衍聖公兼曲阜縣令：“襲封衍聖公年及十七，兼曲阜縣令，仍世襲，不得别行差占。”五年（1200），又給孔元措擢升一階的獎勵：“正月，奉特旨：襲封衍聖公兼世襲曲阜縣令五年内祀事不阙，縣事修舉，特轉官一階。”泰和元年（1201）金章宗又撥給衍聖公祭田六十四畝，以供祀事。金宣宗完顔珣貞祐二年（1214）正月，紅襖軍攻占阙裡，火燒孔子廟。同年五月蒙古南侵，金帝遷都南京（今河南開封），诏孔元措赴汴京行在。但此時孔元措适逢母喪，遂于貞祐三年七月起複，遙授東平府（今山東東平）通判，诏令以來年春天再行赴任。十月，金帝又聽從高琪之議，因曲阜一帶地處宋金拉鋸戰的戰場，戰亂頻仍，時局動蕩，為保護聖裔計，遂令孔元措随朝任職，改授為太常博士。孔元措離開曲阜後，林廟奉祀之事暫交由其族兄孔元用代攝。
曲阜孔廟杏壇
金宣宗興定四年（1220）七月晉孔元措為太常丞，元光元年（1222）十一月又授同知集賢院兼行太常丞事。金哀宗完顔守緒正大二年（1225）三月，再授知集賢院兼行太常丞。四年，秩滿複任。金哀宗天興元年（1232），改授孔元措泰定軍節度使、兖州管内觀察使、兼行太常少卿。二年正月，遷光祿大夫，晉太常卿。太常卿，為九卿之一，從二品上，文散官第七階。元太宗窩闊台五年（1233），蒙古兵伐金，占領汴京。元太宗命孔元措還東平，仍襲封衍聖公，主奉祀事。逾年，金亡。元太宗十年（1238）十一月，孔元措上書窩闊台請求收錄禮樂之舊：“兵興以來，禮樂散失，燕京、南京等處，亡金太常故臣及禮冊樂器多有存者，乞降旨收錄。”元帝準其所奏，命各處管民官如有亡金知禮樂舊人，可并其家屬徙東平，令孔元措統領，于本路稅課所給其食。元太宗十一年（1239）孔元措奉诏赴燕京，得到金帝時候的掌樂許政、掌禮王節、和樂工翟剛等九十二人并帶回曲阜，在阙裡祖庭演習登歌樂。後來又在東平造樂器，制冠冕法服、鐘磬筍虡儀物。禮樂肄習既成後，元憲宗二年（1252）蒙哥汗與諸王聚會于怯綠連河，八月八日祭天于日月山。東平世侯嚴氏受命組織中原太常禮樂人員在日月山行祭天之禮，孔元措遂帶領樂人遠赴漠北日月山，奏于元帝蒙哥之前，“元朝一代禮樂，公實始創之”（《阙裡文獻考·世系》）。此後，随着漢化程度漸深，再至元武宗海山至大三年的冬至日親祀南郊，有元一代終于建立起來符合中原禮制的郊祀制度。
元太宗窩闊台五年（1233）冬十一月，曾勅修孔子廟，九年（1237）诏令衍聖公孔元措再修阙裡孔子廟，并給複守廟一百戶，但這次維修工程很小，僅僅“複建寝殿，暫寓先聖及十哲像”而已。乃馬真後三年（1244），孔元措又主持重修了至聖林思堂，并首立宣聖王、二世祖、三世祖、聖考齊國公等墓碑。
《孔氏祖庭廣記》書影
孔元措對孔氏家族的另一大貢獻是撰成《孔氏祖庭廣記》一書。是書依據孔子第四十六代孫孔宗翰所撰《家譜》和孔子第四十七代孫孔傳的《祖庭雜記》合二為一、纂集增補而成。孔傳的《祖庭雜記》之版亡于宋金之亂，孔傳遂後來在撫州任上重新編纂了《東家雜記》二卷。《祖庭雜記》的部分内容則實際收錄于孔元措《孔氏祖庭廣記》之中。《孔氏祖庭廣記》卷首為圖本，分孔子像、尼山防山魯國圖等，以下各卷分先聖、追崇聖号、世次、崇奉诏文、崇奉雜事、林廟親祠、學廟親祠、祭祀雜事、族孫、世系别錄等門類，凡林廟内外之古迹、古碑、廟宅等均有涉及，計十二卷二十六門八百四十條，被視為一部重要的孔氏志書。
海迷失後二年（1250）、即宋理宗淳祐十年，孔元措卒，享年七十歲，葬于祖墓之西。因其沒有子嗣，以其弟元紘之孫孔浈襲爵。
孔元用，字俊卿，為孔宗願第三子若愚之後。孔若愚四子：端弼、端雅、端禀、端立，端弼、端雅無傳，端禀生珵，端立生琥。珵亦無傳，琥生拂，拂三子：元直、元孝、元用。金宣宗貞祐三年（1215）衍聖公孔元措被召赴汴京，孔元用受囑代攝阙裡林廟祀事。但随着蒙古軍對金戰争的全面推進，蒙古征金大元帥、太師木華黎的軍隊更幾乎踏平了黃河以北。金宣宗興定四年（1220），木華黎經略山東，曾頒給孔元用衍聖公兼曲阜縣印信。宋甯宗嘉定十五年、即金宣宗元光元年（1222），宋軍收複京東西路，曲阜縣複歸于宋。嘉定十七年（1224）授孔元用通直郎。理宗寶慶元年（1225）孔元用權襲封衍聖公，行仙源縣令。二年（1226），改濟州通判，兼京東西路安撫司，主管機宜文字。但旋即而來的蒙古兵再取京東西路，曲阜縣遂又入于蒙古。蒙古太祖二十一年（1226），木華黎之弟、蒙古大将帶孫出兵征讨紅襖軍首領李全，以孔元用有将略，命其帶兵随征，孔元用遂以其子孔之全主祀事兼曲阜縣尹。次年（1227），孔元用卒于益都（今山東青州）城下，終年五十三歲，葬于祖墓西北。孔元用妻聶氏，封宜人。子一，孔之全。