很明顯，阿拉伯人在印度有許多同盟者，他們一定會反抗葡萄牙人。
為了挫敗阿拉伯人的反抗，必須要有強大的力量。伽馬傳回裡斯本以後，很快裝備了一支由13艘船組成的船隊，這個船隊共有1500個乘員。葡萄牙政府對自己的慎重政策堅信無疑，當然不會再派瓦斯科·達·伽馬擔任這個探險隊的上司人。伽馬被人們象國王一樣地愛戴和尊敬，政府賜予他很高的爵位，授予他司令的官銜，并給他一筆數額十分可觀的終身俸，但是隻準他留在國内。
1500年3月9日，船隊啟航前往印度，被任命的船隊上司是年輕的宮廷官員彼得羅·阿爾瓦裡什·卡布拉爾，當時約32一33歲。他與伽馬一樣，從前并沒有什麼出類拔萃的表現，也未必具有什麼航海方面的經驗。巴托洛梅烏·迪亞斯已經不是一個危險的競争者了，他得到了一個較低的船長職位。其他的船長中有人們熟悉的尼古拉·庫埃留和杜阿爾迪·帕舍克。
如同伽馬一樣，卡布拉爾在大西洋熱帶海域遠離了非洲海岸，兩個星期後，一艘船失蹤了。船隊在南半球上陷進了一個無風的海區，被南部的季節海流推到了較遠的西部海域。4月22日，船隊停泊在一個為人不知的陸地附近，那是南美巴西的一個東部海角附近。
葡萄牙人把這片新地當作一個海島，因為他們沒有預料到會在這裡碰到大陸，是以他們把它稱為韋拉一克魯斯(真十字架)。卡布拉爾在那裡建造了一座不大的要塞，命名為波爾土一塞古拉(安全港)，并把兩個苦役犯留在要塞裡。他派出一艘船傳回葡萄牙送去消息說，發觀了一個海島，可以用這個海島為前往印度的船隻加水域補給糧食。
卡布拉爾與另外的11艘船調頭向東南的非洲海岸駛去，他在赤道以南穿過了大西洋，直奔好望角。3月底，在離好望角不遠的地方遇上了一場風暴，風暴摧毀了四艘船，船上的乘員全部死亡，被毀的船中有一艘是巴托洛梅烏·迪亞斯于指揮的船。
卡布拉爾僅率領六艘船航抵馬林迪。從馬林迪出發，他們仍舊借助有經驗的阿拉伯引水員的幫助到達卡利卡特(1500年9月中旬)。然而，在阿拉伯商人和宗教勢力的壓力下，當地的居民拒絕與葡萄牙人做生意，他們襲擊上岸的葡萄牙入，打死了大約50個人。卡布拉爾用炮火轟擊這座不設防的城市作為回答，并放火燒毀了幾十艘阿拉伯人的船隻。然而，要把這座城市完全征服，卡布拉爾的力量，顯然太單薄了。
于是他轉向鄰近的柯欽、坎納諾爾等港口城市，并建議這些城市與葡萄牙人開展貿易。這些鄰近城市與卡利卡特為敵，是以把大批辣椒、肉桂和其他種類調味品、各種乳香和麝香等香料以及當地的輕紡品和藥材賣給了這些異國人。
1501年1月中旬，卡布拉爾啟程傳回。由于船長的疏忽，一艘船在莫三鼻克附近擱淺了，船體漏水，船上的人員和大部分貨物被救出來了，但是這艘船巳經完全不能再用，是以被放火燒掉。
在非洲東南海岸的一場風暴中，一艘船離開了船隊，這艘船于1501年7月底首先傳回裡斯本。卡布拉爾在大西洋上收攏了留下的四艘船。在佛得角群島附近，第奧古·迪亞斯指揮的一艘船和卡布拉爾的船隻會合。1501年7月底，他們一起回到了葡萄牙。雖然損失了六艘船，但是運回貨物的價道是十分可觀的，把這些貨物全部變賣後所得的錢大于這次探險耗費的兩倍。
然而，可能正是因為他這次探險的成功，卡布拉爾再沒有被派往印度去過。
讀後記：卡布拉爾的航海，不在于他到達印度，不在于他賺取了百分之一千的利潤，而在于他發現了巴西，你會說，西班牙人也到達了巴西沿海啊，可是，真正影響巨大的是卡布拉爾，因為此後葡萄牙大批移民巴西。