明代著名醫學家除了李時珍、吳右可、萬全、陳實功等以外，還有一位号東宿，别号生生子的著名醫學家孫一奎。孫一奎生活在明代嘉靖至萬曆年間，是安徽休甯縣人。
孫一奎是汪石山的再傳弟子，他非常聰明，又勤奮好學，而且為了遍訪名師，曾遠曆湖南、江西、江蘇、浙江等地，不斷探冥搜奇，博采衆長，不僅增長了治病救人的經驗，而且還提升了學術理論。而且對三焦、命門等理論有着深刻的研究，有着獨到的見解，可以訣人生死，屢起沉疴，學驗頗豐，名聲大噪！
孫一奎曾聽父親的話去浙江經商，一次偶然的機會遇到了一位醫術高超的道士，這位道士傳給了他一本書。孫一奎認真拜讀，每次用其驗方都有奇效，于是開始學習醫術。
孫一奎不僅熟讀了道士傳給他的方書，而且不論寒暑，日夜刻苦鑽研《難經》、《靈樞》、《素問》等各名家經典。此外，孫一奎還涉及了道、釋、儒三教與醫學的有關部分。學習了三年之後，他認為“索居而窺觀”還不如“廣詢而遠覽”。于是，他離開家鄉，開始遠遊，不斷廣尋名師，在此尋師途中，還一邊行醫濟世，後來還跟随徽州黟人黃古潭先生學習。
黃古潭的醫術也非常高超，孫一奎在醫理和臨證診療上受益匪淺，學驗是頗有建樹，在理論上可謂是“鏡瑩于中”，實踐上就是“投劑辄效”，最後成為了一代名聲在外的醫生。
孫一奎還提出了“命門動氣”學說，命門問題到了明代已經成為了當時醫學研究的熱點之一。而孫一奎首創“命門動氣”學說，具有新時代意義，也具有非常重要的理論價值。
命門動氣，是人之元氣，是人身上太極之所在，此元氣即太極之體，有着“生生不息”的性質，是以為“動氣”。那太極之體在何處？就在人的兩腎。
孫一奎參照太極圖的形式作出了命門太極圖，而且還注明“此中間動氣就是太極”。孫一奎把命門動氣看成是生命之源，是五髒六腑的根本所在。
而孫一奎在治病時，注重明證，他說如果不能明證，不拘大小輕重，而且病變有始同終異之象，是以在治法上不能一成不變。有了這種思想作為指導，他提出時醫對内傷血證、虛損、發熱等用一些苦寒、甘溫之藥的弊端。是以，他非常重視保護三焦元氣以及治療方法，他反對随意寒涼之藥來治療身體，也不贊同過用疏導、辛辣之藥。
因為孫一奎認為寒涼之藥會損傷脾胃，導緻元氣耗損，而辛辣藥又散氣，過度疏導，同樣會傷元氣。若是命門元氣不足，就會導緻三焦元氣不足，進而出現水谷不化、清濁不分等問題。
孫一奎文化水準極高，《孫文垣醫案》（共5卷）、《醫旨緒餘》（共2卷）、《赤水玄珠》（共30卷）等 都是孫一奎從一生經驗中總結和整理出來的。
其中，講述了孫一奎對中醫的思考和見解的是《醫旨緒餘》，也是理論性非常強的醫學著作，具有很強的參考價值。
孫一奎最具代表性的醫學著作是《赤水玄珠》，是他彙總了一生的臨床經驗以及心得。這本書共有30卷，分兒科、婦科、外科、内科等以及疑難雜症和罕見病，詳細介紹了諸病的症狀，如何治療和用藥等，是非常好的中醫精品之作，對中醫産生了非常寶貴的财富，對複興和發展中醫起到了非常重要的作用，是後世學醫者非常重要的參考資料。