天天看點

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

作者:初八沒煩惱
薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用
薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

文丨初八沒煩惱

編輯丨初八沒煩惱

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

薄荷是唇形科薄荷屬草本植物,是廣泛種植的藥食同源植物,在藥用方面,薄荷可用于風熱感冒,風溫初起,頭痛,目赤,麻疹,胸脅脹悶等臨床常見症。

在食用方面,薄荷可作為茶飲、香料、鮮食蔬菜等,表明薄荷具有極大的研究和開發價值,茉莉酸是一種重要的天然植物内源激素,廣泛參與植物的生長發育和逆境響應。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

JAZ蛋白是JA信号途徑中的關鍵抑制子,作為植物特異性TIFY超級家族的成員之一,JAZs蛋白在N端含有一個保守的TIFY結構域,C端含有一個Jas,也稱為CCT_2的結構域。

同時,TIFY結構域可以介導JAZs蛋白之間的互相作用,形成同源或異源二聚體,并且不同JAZs基因的功能,具有備援性或差異性。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

實驗的材料與方法

實驗所用薄荷為M.canadensis,亞細胞定位實驗所用煙草為本氏煙草,所有材料均種植于光照培養箱内,23℃,光照16h/黑暗8h,正常條件下生長3~5周備用。

收集2周大的薄荷幼嫩葉片,置于液氮中,然後使用研缽充分研磨成粉末,根據RNA提取試劑盒的操作說明提取葉片總RNA。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

按照反轉錄試劑盒的操作步驟,合成第一鍊cDNA,根據薄荷轉錄組資料鑒定的McJAZ8基因序列。

利用McJAZ8基因全長克隆引物McJAZ8-F:5’-ATGGCTTCCTTTGAGAACGTC-3’;McJAZ8-R:5’-CTACCTGTCTCGTCTCTTCTCC-3’,之後使用PCR擴增候選McJAZ8基因。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

PCR擴增體系如下:1µL5×cDNA模闆、2µLPrimeSTAR®DNA聚合酶、5µL5×PrimeSTARDNA聚合酶緩沖液、正向和反向引物各0.5µL、16µL無菌ddH2O,總體積25µL。

擴增程式為:95℃預變性10min;95℃變性15s,指定溫度下退火20s,72℃下延伸45s,34個循環;72℃10min,4℃1min。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

随後,使用1%瓊脂糖凝膠進行DNA條帶的鑒定分離,使用DNA純化試劑盒回收McJAZ8基因的PCR産物,置于-20℃儲存備用。

将純化後的PCR産物連接配接至pClone007載體,連接配接産物轉化至大腸杆菌DH5α感受态,挑取單克隆擴大培養,通過菌液PCR進行驗證,确認McJAZ8基因序列的正确性。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

實驗結果分析

根據RNA提取試劑盒的步驟,提取薄荷葉片總RNA,經瓊脂糖凝膠電泳檢驗,RNA條帶清晰可見,無降解。

并且A260nm/A280nm和A260nm/A230nm的比值在1.9~2.0,核苷酸吸收曲線呈現單峰,表明總RNA品質良好,可用于後續實驗。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

将上述RNA反轉錄獲得cDNA,利用RT-PCR實驗擴增McJAZ8全長CDS序列,瓊脂糖凝膠電泳結果顯示,在500~750bp有1條清晰可見的PCR條帶。

随後将目的PCR産物建構至pClone007載體,陽性重組子經測序表明該序列為McJAZ8基因。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

薄荷McJAZ8基因的編碼序列CDS長度為543bp,将其CDS序列轉換成氨基酸序列,預測McJAZ8蛋白序列的理化性質。

結果顯示,McJAZ8蛋白序列含有180個氨基酸,其分子量為18.96kDa,理論等電點為6.30,該蛋白不穩定系數為55.31,大于40的界限,表明該蛋白為不穩定類蛋白。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

分析McJAZ8蛋白二級結構,結果顯示α螺旋占24.44%、β折疊占6.11%、延伸鍊占10.5%和無規則卷曲占58.89%,同時分析McJAZ8的蛋白三級結構。

該蛋白與模闆序列的同一性為83.43%,全據模型品質估計為0.8,與二級結構預測一緻,含有α螺旋、β折疊、延伸鍊和無規則卷曲4種二級結構,其中無規則卷曲為主要結構。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

為了鑒定薄荷McJAZ8蛋白,與其他物種JAZs蛋白氨基酸序列之間的相似性,獲得12個拟南芥、15個水稻的、9個黃花蒿的和13個北美雲杉的JAZs蛋白,進行氨基酸序列比對。

所有的JAZs蛋白,都含有高度保守的TIFY和Jas結構域,并且保守結構域内的氨基酸序列高度保守,推測McJAZ8可能參與JA信号。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

另外,為了了解McJAZ8,和其他已知物種JAZ蛋白的進化關系,利用MEGA軟體建構了McJAZ8蛋白,和上述不同物種JAZs蛋白的無根系統發育樹。

結果顯示,McJAZ8與拟南芥AtJAZ1、AtJAZ2、黃花蒿AaJAZ4和AaJAZ5蛋白聚為一支,同源關系較近。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

為了确定McJAZ8蛋白的亞細胞定位,首先利用WoLFPSORT線上工具預測McJAZ8蛋白的亞細胞定位情況,預測結果顯示,McJAZ8蛋白可能定位于細胞核、細胞質以及線粒體。

建構McJAZ8基因,融合綠色熒光蛋白GFP的重組表達載體McJAZ8-GFP,将GFP空、McJAZ8-GFP、核定位載體SV40-mCherry分别轉化農杆菌GV3101。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

将含有不同表達載體的GV3101農杆菌重懸液等體積,混合後注入煙草葉片下表皮進行瞬時共表達。

含有對照GFP空載體,或McJAZ8-GFP融合載體的煙草葉片細胞,在細胞核、細胞質中均觀察到綠色熒光信号,且細胞核中的綠色熒光與紅色熒光重疊。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

綜上表明McJAZ8蛋白定位于細胞核、細胞質。

為了探究McJAZ8能否與其自身,或薄荷的其他JAZs蛋白,形成同源或異源二聚體,通過酵母雙雜交實驗将BD-McJAZs和AD-McJAZ8,或BD-McJAZ8和AD-McJAZs的不同質粒組合轉化酵母AH109,并分析它們之間的互作情況。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

所有轉化的酵母組合均能在對照培養基DDO上正常生長,然而,隻有AD-McJAZ8分别與BD-McJAZ1、BD-McJAZ3、BD-McJAZ4、BD-McJAZ5、BD-McJAZ8共轉化的酵母。

或者BD-McJAZ8分别與AD-McJAZ1、AD-McJAZ4、AD-McJAZ5、AD-McJAZ8共轉化的酵母,能在選擇培養基QDO上正常生長。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

表明McJAZ8能與自身,或McJAZ1、McJAZ3、McJAZ4、McJAZ5互作。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

實驗結果讨論

結果表明,茉莉酸信号抑制子JAZ基因在植物中廣泛存在,并且JAZ蛋白通過與下遊轉錄因子結合來抑制茉莉酸信号的傳導,進而調控植物的生長發育、抗病反應和逆境響應等過程。

目前,JAZs基因已在拟南芥、水稻、地錢、小麥、青蒿、丹參等物種中被克隆,然而,在薄荷中有關JAZs基因的研究還處于初級階段。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

基于前期的薄荷轉錄組資料,從薄荷中克隆到一條完整的JAZ基因,命名為McJAZ8,基因序列分析發現,McJAZ8基因的編碼序列長度為543bp,這與拟南芥AtJAZs基因的編碼序列長度相似。

此外,McJAZ8蛋白的pI值為6.30,這是由于McJAZ8蛋白氨基酸序列中酸性氨基酸的比例較高的緣故,并且這種現象在其他植物的JAZ蛋白中普遍存在。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

氨基酸序列比對分析發現,雖然McJAZ8與其他植物JAZs蛋白間的氨基酸的相似性較低,但McJAZ8與其他植物的JAZ蛋白,都含有一個保守的N端TIFY結構域,和一個C端Jas結構域,表明TIFY和Jas保守結構進化的保守性。

實驗還發現TIFY結構域在調節同源,或異源JAZs蛋白之間的互相作用,以及JAZs蛋白與NINJA蛋白互相作用,募集TPL/TPRs的過程中發揮着雙重功能。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

而Jas結構域在JAZs蛋白與茉莉酸受體F-box蛋白Coronatineinsensitive1,和各種轉錄因子的互相作用中起着重要作用,并參與調節JAZ蛋白的亞細胞定位。

亞細胞定位和酵母雙雜交結果顯示,McJAZ8蛋白定位于細胞核,并且能與其他McJAZs蛋白互作形成同源或異源二聚體。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

暗示與其他植物中的JAZ蛋白相似,薄荷中的McJAZ8蛋白可能在JA信号應答和調節JA介導的下遊基因表達中具有重要作用,目标基因的組織表達模式與基因功能密切相關。

小麥、橡膠樹和忽地笑中,不同的JAZs基因在不同植物的不同組織中其表達具有一定的組成性和差異性,而且JAZs基因在植物不同組織中的表達,與植物生長發育密切相關。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

McJAZ8基因在薄荷的不同組織中均有表達,但在不同組織中其表達水準有所差異,暗示McJAZ8基因,可能在調節薄荷不同組織的生長發育中,發揮重要作用。

拟南芥和水稻的JAZs基因在花和雄蕊的發育中,發揮着重要調節作用,而McJAZ8基因在葉中的表達高于所有其他組織,暗示McJAZ8基因在葉片發育中,可能具有重要的調節功能。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

在不同植物中,JA誘導了JAZs基因轉錄豐度的波動,并且,JAZ基因轉錄水準的變化,與JAZ基因在JA介導的植物發育、防禦和特殊代謝産物合成中的調節功能密切相關。

與對照組相比,McJAZ8基因在MeJA處理後的薄荷葉片和根中顯著上調,進一步表明該基因可能參與JA信号傳導。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

在不同非生物脅迫處理下,不同植物中JAZs基因的表達表現出一定的差異,如小麥、水稻、茶樹和白菜中,幹旱、鹽和低溫不同程度的誘導JAZs基因的表達,并且這些JAZs基因的上調表達與植物的耐鹽性和耐旱性有關。

本實驗發現McJAZ8基因在幹旱、NaCl脅迫處理的薄荷葉片和根中表現出不同程度的上調表達,推測McJAZ8基因,可能在調節薄荷響應幹旱和鹽脅迫中發揮重要作用。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

已有研究顯示JA處理提高了植物對外源镉、銅等金屬離子脅迫的抗性,發現CdCl2、CuCl2和AlCl3處理誘導薄荷葉片和根中McJAZ8基因的表達,表明McJAZ8可能調控薄荷對不同金屬離子脅迫的響應。

此外,JA處理上調了非生物脅迫響應基因McJAZ8的表達,表明薄荷McJAZ8可能通過JA信号通路調節植物對不同脅迫的響應。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

從薄荷中克隆獲得McJAZ8基因,該基因編碼序列長度為543bp,編碼180個氨基酸,分子量為18.96kDa,理論等電點為6.30,具有TIFY和Jas保守結構域,與拟南芥AtJAZ1和AtJAZ2的同源性較高。

McJAZ8蛋白定位于細胞核、細胞質,能與自身或McJAZ1、McJAZ3、McJAZ4、McJAZ5互作形成同源或異源二聚體。

薄荷中McJAZ8基因的鑒定,與功能的表達,在不同細胞組織中的作用

其在薄荷的不同組織中廣泛表達,在幼葉中表達量最高,并且McJAZ8基因在葉序中的表達具有波動,在第4片葉中表達量最高,而第2片葉中表達量最低。

而在薄荷葉片和根中對MeJA、幹旱、鹽、CdCl2、CuCl2以及AlCl3處理均有響應,表明McJAZ8可能在調節薄荷中的JA信号轉導,以及調控薄荷應答非生物脅迫中發揮重要作用。

繼續閱讀