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薄荷中McJAZ8基因的鉴定,与功能的表达,在不同细胞组织中的作用

作者:初八没烦恼
薄荷中McJAZ8基因的鉴定,与功能的表达,在不同细胞组织中的作用
薄荷中McJAZ8基因的鉴定,与功能的表达,在不同细胞组织中的作用

文丨初八没烦恼

编辑丨初八没烦恼

薄荷中McJAZ8基因的鉴定,与功能的表达,在不同细胞组织中的作用

薄荷是唇形科薄荷属草本植物,是广泛种植的药食同源植物,在药用方面,薄荷可用于风热感冒,风温初起,头痛,目赤,麻疹,胸胁胀闷等临床常见症。

在食用方面,薄荷可作为茶饮、香料、鲜食蔬菜等,表明薄荷具有极大的研究和开发价值,茉莉酸是一种重要的天然植物内源激素,广泛参与植物的生长发育和逆境响应。

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JAZ蛋白是JA信号途径中的关键抑制子,作为植物特异性TIFY超级家族的成员之一,JAZs蛋白在N端含有一个保守的TIFY结构域,C端含有一个Jas,也称为CCT_2的结构域。

同时,TIFY结构域可以介导JAZs蛋白之间的相互作用,形成同源或异源二聚体,并且不同JAZs基因的功能,具有冗余性或差异性。

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实验的材料与方法

实验所用薄荷为M.canadensis,亚细胞定位实验所用烟草为本氏烟草,所有材料均种植于光照培养箱内,23℃,光照16h/黑暗8h,正常条件下生长3~5周备用。

收集2周大的薄荷幼嫩叶片,置于液氮中,然后使用研钵充分研磨成粉末,根据RNA提取试剂盒的操作说明提取叶片总RNA。

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按照反转录试剂盒的操作步骤,合成第一链cDNA,根据薄荷转录组数据鉴定的McJAZ8基因序列。

利用McJAZ8基因全长克隆引物McJAZ8-F:5’-ATGGCTTCCTTTGAGAACGTC-3’;McJAZ8-R:5’-CTACCTGTCTCGTCTCTTCTCC-3’,之后使用PCR扩增候选McJAZ8基因。

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PCR扩增体系如下:1µL5×cDNA模板、2µLPrimeSTAR®DNA聚合酶、5µL5×PrimeSTARDNA聚合酶缓冲液、正向和反向引物各0.5µL、16µL无菌ddH2O,总体积25µL。

扩增程序为:95℃预变性10min;95℃变性15s,指定温度下退火20s,72℃下延伸45s,34个循环;72℃10min,4℃1min。

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随后,使用1%琼脂糖凝胶进行DNA条带的鉴定分离,使用DNA纯化试剂盒回收McJAZ8基因的PCR产物,置于-20℃保存备用。

将纯化后的PCR产物连接至pClone007载体,连接产物转化至大肠杆菌DH5α感受态,挑取单克隆扩大培养,通过菌液PCR进行验证,确认McJAZ8基因序列的正确性。

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实验结果分析

根据RNA提取试剂盒的步骤,提取薄荷叶片总RNA,经琼脂糖凝胶电泳检验,RNA条带清晰可见,无降解。

并且A260nm/A280nm和A260nm/A230nm的比值在1.9~2.0,核苷酸吸收曲线呈现单峰,表明总RNA质量良好,可用于后续实验。

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将上述RNA反转录获得cDNA,利用RT-PCR实验扩增McJAZ8全长CDS序列,琼脂糖凝胶电泳结果显示,在500~750bp有1条清晰可见的PCR条带。

随后将目的PCR产物构建至pClone007载体,阳性重组子经测序表明该序列为McJAZ8基因。

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薄荷McJAZ8基因的编码序列CDS长度为543bp,将其CDS序列转换成氨基酸序列,预测McJAZ8蛋白序列的理化性质。

结果显示,McJAZ8蛋白序列含有180个氨基酸,其分子量为18.96kDa,理论等电点为6.30,该蛋白不稳定系数为55.31,大于40的界限,表明该蛋白为不稳定类蛋白。

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分析McJAZ8蛋白二级结构,结果显示α螺旋占24.44%、β折叠占6.11%、延伸链占10.5%和无规则卷曲占58.89%,同时分析McJAZ8的蛋白三级结构。

该蛋白与模板序列的同一性为83.43%,全据模型质量估计为0.8,与二级结构预测一致,含有α螺旋、β折叠、延伸链和无规则卷曲4种二级结构,其中无规则卷曲为主要结构。

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为了鉴定薄荷McJAZ8蛋白,与其他物种JAZs蛋白氨基酸序列之间的相似性,获得12个拟南芥、15个水稻的、9个黄花蒿的和13个北美云杉的JAZs蛋白,进行氨基酸序列比对。

所有的JAZs蛋白,都含有高度保守的TIFY和Jas结构域,并且保守结构域内的氨基酸序列高度保守,推测McJAZ8可能参与JA信号。

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另外,为了了解McJAZ8,和其他已知物种JAZ蛋白的进化关系,利用MEGA软件构建了McJAZ8蛋白,和上述不同物种JAZs蛋白的无根系统发育树。

结果显示,McJAZ8与拟南芥AtJAZ1、AtJAZ2、黄花蒿AaJAZ4和AaJAZ5蛋白聚为一支,同源关系较近。

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为了确定McJAZ8蛋白的亚细胞定位,首先利用WoLFPSORT在线工具预测McJAZ8蛋白的亚细胞定位情况,预测结果显示,McJAZ8蛋白可能定位于细胞核、细胞质以及线粒体。

构建McJAZ8基因,融合绿色荧光蛋白GFP的重组表达载体McJAZ8-GFP,将GFP空、McJAZ8-GFP、核定位载体SV40-mCherry分别转化农杆菌GV3101。

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将含有不同表达载体的GV3101农杆菌重悬液等体积,混合后注入烟草叶片下表皮进行瞬时共表达。

含有对照GFP空载体,或McJAZ8-GFP融合载体的烟草叶片细胞,在细胞核、细胞质中均观察到绿色荧光信号,且细胞核中的绿色荧光与红色荧光重叠。

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综上表明McJAZ8蛋白定位于细胞核、细胞质。

为了探究McJAZ8能否与其自身,或薄荷的其他JAZs蛋白,形成同源或异源二聚体,通过酵母双杂交实验将BD-McJAZs和AD-McJAZ8,或BD-McJAZ8和AD-McJAZs的不同质粒组合转化酵母AH109,并分析它们之间的互作情况。

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所有转化的酵母组合均能在对照培养基DDO上正常生长,然而,只有AD-McJAZ8分别与BD-McJAZ1、BD-McJAZ3、BD-McJAZ4、BD-McJAZ5、BD-McJAZ8共转化的酵母。

或者BD-McJAZ8分别与AD-McJAZ1、AD-McJAZ4、AD-McJAZ5、AD-McJAZ8共转化的酵母,能在选择培养基QDO上正常生长。

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表明McJAZ8能与自身,或McJAZ1、McJAZ3、McJAZ4、McJAZ5互作。

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实验结果讨论

结果表明,茉莉酸信号抑制子JAZ基因在植物中广泛存在,并且JAZ蛋白通过与下游转录因子结合来抑制茉莉酸信号的传导,进而调控植物的生长发育、抗病反应和逆境响应等过程。

目前,JAZs基因已在拟南芥、水稻、地钱、小麦、青蒿、丹参等物种中被克隆,然而,在薄荷中有关JAZs基因的研究还处于初级阶段。

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基于前期的薄荷转录组数据,从薄荷中克隆到一条完整的JAZ基因,命名为McJAZ8,基因序列分析发现,McJAZ8基因的编码序列长度为543bp,这与拟南芥AtJAZs基因的编码序列长度相似。

此外,McJAZ8蛋白的pI值为6.30,这是由于McJAZ8蛋白氨基酸序列中酸性氨基酸的比例较高的缘故,并且这种现象在其他植物的JAZ蛋白中普遍存在。

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氨基酸序列比对分析发现,虽然McJAZ8与其他植物JAZs蛋白间的氨基酸的相似性较低,但McJAZ8与其他植物的JAZ蛋白,都含有一个保守的N端TIFY结构域,和一个C端Jas结构域,表明TIFY和Jas保守结构进化的保守性。

实验还发现TIFY结构域在调节同源,或异源JAZs蛋白之间的相互作用,以及JAZs蛋白与NINJA蛋白相互作用,募集TPL/TPRs的过程中发挥着双重功能。

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而Jas结构域在JAZs蛋白与茉莉酸受体F-box蛋白Coronatineinsensitive1,和各种转录因子的相互作用中起着重要作用,并参与调节JAZ蛋白的亚细胞定位。

亚细胞定位和酵母双杂交结果显示,McJAZ8蛋白定位于细胞核,并且能与其他McJAZs蛋白互作形成同源或异源二聚体。

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暗示与其他植物中的JAZ蛋白相似,薄荷中的McJAZ8蛋白可能在JA信号应答和调节JA介导的下游基因表达中具有重要作用,目标基因的组织表达模式与基因功能密切相关。

小麦、橡胶树和忽地笑中,不同的JAZs基因在不同植物的不同组织中其表达具有一定的组成性和差异性,而且JAZs基因在植物不同组织中的表达,与植物生长发育密切相关。

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McJAZ8基因在薄荷的不同组织中均有表达,但在不同组织中其表达水平有所差异,暗示McJAZ8基因,可能在调节薄荷不同组织的生长发育中,发挥重要作用。

拟南芥和水稻的JAZs基因在花和雄蕊的发育中,发挥着重要调节作用,而McJAZ8基因在叶中的表达高于所有其他组织,暗示McJAZ8基因在叶片发育中,可能具有重要的调节功能。

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在不同植物中,JA诱导了JAZs基因转录丰度的波动,并且,JAZ基因转录水平的变化,与JAZ基因在JA介导的植物发育、防御和特殊代谢产物合成中的调节功能密切相关。

与对照组相比,McJAZ8基因在MeJA处理后的薄荷叶片和根中显著上调,进一步表明该基因可能参与JA信号传导。

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在不同非生物胁迫处理下,不同植物中JAZs基因的表达表现出一定的差异,如小麦、水稻、茶树和白菜中,干旱、盐和低温不同程度的诱导JAZs基因的表达,并且这些JAZs基因的上调表达与植物的耐盐性和耐旱性有关。

本实验发现McJAZ8基因在干旱、NaCl胁迫处理的薄荷叶片和根中表现出不同程度的上调表达,推测McJAZ8基因,可能在调节薄荷响应干旱和盐胁迫中发挥重要作用。

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已有研究显示JA处理提高了植物对外源镉、铜等金属离子胁迫的抗性,发现CdCl2、CuCl2和AlCl3处理诱导薄荷叶片和根中McJAZ8基因的表达,表明McJAZ8可能调控薄荷对不同金属离子胁迫的响应。

此外,JA处理上调了非生物胁迫响应基因McJAZ8的表达,表明薄荷McJAZ8可能通过JA信号通路调节植物对不同胁迫的响应。

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从薄荷中克隆获得McJAZ8基因,该基因编码序列长度为543bp,编码180个氨基酸,分子量为18.96kDa,理论等电点为6.30,具有TIFY和Jas保守结构域,与拟南芥AtJAZ1和AtJAZ2的同源性较高。

McJAZ8蛋白定位于细胞核、细胞质,能与自身或McJAZ1、McJAZ3、McJAZ4、McJAZ5互作形成同源或异源二聚体。

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其在薄荷的不同组织中广泛表达,在幼叶中表达量最高,并且McJAZ8基因在叶序中的表达具有波动,在第4片叶中表达量最高,而第2片叶中表达量最低。

而在薄荷叶片和根中对MeJA、干旱、盐、CdCl2、CuCl2以及AlCl3处理均有响应,表明McJAZ8可能在调节薄荷中的JA信号转导,以及调控薄荷应答非生物胁迫中发挥重要作用。

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