三國時期，群雄逐鹿。其中董卓最先行謀逆之事，捉漢獻帝劉協以威脅一衆大臣。而在虎牢關一戰後，董卓實力漸消，後漢獻帝更是輾轉到曹操麾下，被曹操用來挾天子以令諸侯。而這樣的做法，使得群雄之間隐隐以曹操為首。但也正是是以，曹操"漢賊"的身份才一直為人诟病。但個人認為，這與曹操本身的性格也不無關系。
雖然其詩文中曾寫"周公吐脯，天下歸心。"也一直對能臣賢士禮遇有加，并表現出了對人才殷切地渴望，但這也并不代表其奸滑狡詐、多疑自負的性格會有所收斂。這一點，在曹操斬殺孔融三族的案例中便不難看出。孔融言辭激烈，曾多次表現出對曹操的敵視、輕蔑，即便曹操有愛才之心，久而久之，對于孔融也隻剩厭煩了。但在曹操斬殺孔融三族後，為何後世還會有"衍聖公"的存在呢？
第一、首先分析"衍聖公"的由來。
"衍聖公"稱号的由來，具體要追溯到孔子時代。在孔子死後，魯哀公在紀念孔子的悼詞中，為表示對一代聖人的尊敬，便稱呼其為"尼父"（孔子名丘字仲尼）。而随後魯哀公便為孔子修建孔廟，并從此開始了世人對其的祭祀。但當時尚未設立專門的奉祀官。直至漢高祖劉邦建立漢朝後，才于高祖10年，因路過山東祭拜孔子，遂封孔子第九世孫為奉祀君，主持孔子的祭祀事務。
而到了漢元帝時期，元帝封孔子的第十三世孫為褒成侯，其所得俸祿食邑，專門用以孔子的祭祀事宜。随後，孔子的後代便開始了世襲爵位的過程。漢平帝封孔子的十六世孫為褒成侯，并将爵位由關内侯提升為徹侯（有封國），食邑2000戶。而到了王莽新漢時期，由于孔子後代不承認朝廷的正統性質，拒絕接受王莽授予的官職，是以失去爵位。直至東漢光武帝劉秀時期，才重新恢複爵位。
而到了北周靜帝時期，孔子又被封鄒國公，孔子後代也襲得此爵。隋朝又封孔子後裔為紹聖侯，至唐代，唐玄宗封孔子為文宣王，又封孔子第三十五世孫為文宣公。唐末失爵，直至五代十國時期，後唐又恢複了孔子後裔的爵位，并将文宣公之爵位沿用至北宋時期。北宋仁宗年間，仁宗趙祯認為孔子後人世襲孔子谥号為大不敬，便改封孔子後人為"衍聖公"。這便是"衍聖公"的由來。
第二、分析孔融三族與孔子後代的關系。
而我們若是簡單的分析一下孔子的家譜，也不難清楚孔融與孔子直系後代的關系。孔子唯有一子，名孔鯉。孔鯉也唯有一子，名孔伋。而就目前來看，幾乎所有正統的孔氏後代，都是孔伋的後裔。而孔融自然也不例外。但從親子孔鯉至七世孫孔謙，皆為單傳。而到七世孫孔謙時，其有三子，分别是孔鮒、孔樹、孔騰，而九世孫孔忠則為孔騰之子。
以此類推，而得出了《後漢書·孔融列傳》中的結論:"孔融，字文舉，魯國人，孔子二十世孫。"但雖然孔融據史料記載，為孔子的第二十世孫，但這裡也并不意味着，孔融是孔子的嫡系子孫。這裡就牽扯了到古代的嫡庶問題。在禮法森嚴的古代嫡庶差别無疑十分巨大，而有資格繼承爵位的，也唯有嫡系。雖然庶出的子孫同樣可稱為孔子後代，但其中親疏，不言而明。
第三、孔融并非孔子嫡系子孫，即便被殺三族，也不影響"衍聖公"的傳承。
上文提到了，孔融并非孔子嫡系子孫。其實這從曹操對其痛下殺手的态度，就已經不難看出。若孔融為孔子嫡系二十世孫，為了表面的和平，不得罪根系錯綜複雜的孔氏家族，曹操也絕對會忍下的。但可惜事實并非如此，孔融雖然是孔子後代，但其血脈經過歲月沖刷，早已經不再親厚，自然曹操也不會對其過于容忍。
而孔融因反對曹操挾天子以令諸侯的行徑，再加之其處處掣肘曹操，要求增強漢室實權，惹得曹操對其嫌惡不已，最終于建安十三年（公元208年），孔融被曹操冠以"招合徒衆，欲圖不軌"、"謗讪朝廷，不遵朝儀"等罪名殺之，并株連三族。但也僅僅是三族而已，這對于已經根系頗豐的孔氏來說，并不會傷筋動骨，也不會影響到"衍聖公"的傳承。這便是曹操殺了孔融三族，但"衍聖公"依舊傳承的原因。