故事的开篇铺满绿植，一座白色的漂亮瓦房，水清草绿，大片大片的花朵盛开着，不禁让人想到是个疗养的好地方。为了下个月的心脏手术，少年翔来到这里进行静养。
因为家中的粮食短缺，阿莉埃蒂决定和父亲去这座屋子“借物”。他们穿过钉子墙，利用胶带和绳索爬上柜子，寻找方糖，却惊动了睡觉的翔，阿莉埃蒂吓得瞬间躲进了卫生纸后，方糖也瞬间掉落在地板上。
第二天阿莉埃蒂在晾衣服时，发现了下水道口的方糖，是昨天自己不小心掉落的那块。是翔将它放在这里的，除了这块方糖外还有一个纸条和一枝花。
在父亲去考察搬家新地址时，阿莉埃蒂带着方糖和内片纸条想跟翔说清楚。在攀爬爬山虎时不幸被乌鸦盯上了而引发了不少的动静，翔为了保护她将她护在手心，而她因为自己的族规，道完谢就偷偷的溜走了。
翔的姨母为翔介绍了一直放在桌上的迷你房子，是姨母妈妈的妈妈专门为小小人打造的，亮闪闪，她希望小小人可以接受这份礼物，但是再也没有看到过了，迷你小屋也就这样一直留置着。
这天晚上父亲比平时回来的都要晚，在并且带来了另一个小小人斯皮勒。父亲告诉阿莉埃蒂他已经找到了新的住所，那里有更多的小小人一族。多亏了斯皮勒受伤自己才能回家，明天斯皮勒会带着大家去新的住所。
第二天，除鼠公司人员到达了，将房间翻了个底朝天。阿莉埃蒂的妈妈被阿春抓到了装进了玻璃瓶内锁进了厨房。回家的阿莉埃蒂发现了家中的异常和母亲的失踪，她求助翔的帮助，在一步一步的努力下找到并解救出了母亲。
故事的最后，阿莉埃蒂一家和斯皮勒一起跋山涉水的搬家。在一个小木桩上，阿莉埃蒂露面和翔告别，翔对阿莉埃蒂讲：“好美啊。”你已经是我心脏的一部分。”“我不会忘记你。”感情的流露不言而喻。
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