故事的開篇鋪滿綠植，一座白色的漂亮瓦房，水清草綠，大片大片的花朵盛開着，不禁讓人想到是個療養的好地方。為了下個月的心髒手術，少年翔來到這裡進行靜養。
因為家中的糧食短缺，阿莉埃蒂決定和父親去這座屋子“借物”。他們穿過釘子牆，利用膠帶和繩索爬上櫃子，尋找方糖，卻驚動了睡覺的翔，阿莉埃蒂吓得瞬間躲進了衛生紙後，方糖也瞬間掉落在地闆上。
第二天阿莉埃蒂在晾衣服時，發現了下水道口的方糖，是昨天自己不小心掉落的那塊。是翔将它放在這裡的，除了這塊方糖外還有一個紙條和一枝花。
在父親去考察搬家新位址時，阿莉埃蒂帶着方糖和内片紙條想跟翔說清楚。在攀爬爬山虎時不幸被烏鴉盯上了而引發了不少的動靜，翔為了保護她将她護在手心，而她因為自己的族規，道完謝就偷偷的溜走了。
翔的姨母為翔介紹了一直放在桌上的迷你房子，是姨母媽媽的媽媽專門為小小人打造的，亮閃閃，她希望小小人可以接受這份禮物，但是再也沒有看到過了，迷你小屋也就這樣一直留置着。
這天晚上父親比平時回來的都要晚，在并且帶來了另一個小小人斯皮勒。父親告訴阿莉埃蒂他已經找到了新的住所，那裡有更多的小小人一族。多虧了斯皮勒受傷自己才能回家，明天斯皮勒會帶着大家去新的住所。
第二天，除鼠公司人員到達了，将房間翻了個底朝天。阿莉埃蒂的媽媽被阿春抓到了裝進了玻璃瓶内鎖進了廚房。回家的阿莉埃蒂發現了家中的異常和母親的失蹤，她求助翔的幫助，在一步一步的努力下找到并解救出了母親。
故事的最後，阿莉埃蒂一家和斯皮勒一起跋山涉水的搬家。在一個小木樁上，阿莉埃蒂露面和翔告别，翔對阿莉埃蒂講：“好美啊。”你已經是我心髒的一部分。”“我不會忘記你。”感情的流露不言而喻。
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