《幽灵公主》对于宫崎骏自己可以说是最重要的作品，该作探讨了他思索半生但找不到解法的矛盾，人与自然的冲突、人与人的不和。工业化文明势不可挡地瓦解传统文明中的信仰与平衡，崇敬自然的阿依努族偏居一隅，古老的神明消亡，被毁的森林即便重建也是驯服，可为人所摆布。
该作品也相对明显地展现宫崎骏的悲观与忧伤，不像其他一些作品为了孩子而常常流露温情。阿西达卡的族人以“需要有年轻人出去闯荡”等理由竭力驱逐他，见识了黄金的人企图谋财害命，疙瘩和尚夺取不属于自己的东西总是一副理由应当的态度，桑满怀仇恨与偏激成长为狂热的战士，与野猪作战的人类拿同胞当诱饵……但也不是全然的绝望，悲观中还夹杂着凄惨的希望。
《幽灵公主》其实不太适合长篇大论的解说跟华丽辞藻的堆砌。反而需要自己静静地去体会、去反思。影片的惊艳始于画面与配乐，终于被震撼的内心。宫崎骏虽然没有给出人与自然如何和谐共处的具体答案，却也留下了希望。
一如曾被诅咒的阿席达卡因直面命运的勇敢与内心的良善而终获救赎一样，“劫后余生”的人类也需要正视自身“发展无度必遭自然反噬”的诅咒。在经历自然的洗礼之后，智慧且保有良善的人类终会在未来的某一节点找到与之和谐共处的平衡点。从这一角度看结局，或许更能让人释然。
《幽灵公主》的结尾和前面反差如此之大，宫崎骏应该是对人类的未来感到绝望的，如果从宫崎骏之后的所有片子来看的话，他在叙述了一个自然抛弃人类的过程。千与千寻中，人与神已经分道扬镳了，神有神的居所，人有人的社会。哈儿的移动城堡里，神仅仅作为魔法的力量存在，悬崖上的金鱼姬里，神已经到了“落魄”的地步，起风了已经看不到神了。
我不知道吉卜力里是不是要开空调的，但是当我们自己必须依赖空调度过夏天的时候，不就证明了我们已经无法生存下去了吗，我们对宇宙的探索无非就是无数次的告诉自己我们根本就出不去，出去了也到不了，而我们赖以生存的世界已经被我们榨干了。
但是依然有人觉得我们所做的破坏都是微不足道的，我们不过是让地球的一小部分变成了繁华的城市，不过是让那些无法适应新环境的生物一个个的消失而已吗，人类活不下去又怎么可能是人类自己造成的呢，也许吧。地球50亿年的历史中肯定不止一代拥有智慧的文明，现在我们知道他们是如何消失的了。