大家好，我是小马老师。
本文分享一个比较有意思的lammps案例：分子的自由落体运动。
lammps提供了fix gravity命令可设置分子或者原子的加速度。
语法规则为：
fix ID group gravity magnitude style args
如设置x方向的加速度为100（单位为Force/mass，与units有关），可写为：
本文案例和原子沉积类似，在盒子上方随机产生一定数量的分子，经过自由落体后到达盒子底部。
在盒子底部设置一个“墙”，防止原子跑出盒子外面。
分子采用刚体设置，与底部墙碰撞后停止运动。
模拟效果如下图所示：
lammps in文件代码如下：
#模型基本设置
units si
boundary p p f
newton on
atom_style sphere
atom_modify map array sort 0 0
neighbor 0.42 bin
timestep 0.0001
#创建盒子
region reg block 0 120 0 60 0 85 units box
create_box 1 reg
#设置原子属性
fix prop all property/atom mol ghost yes
#势函数设置
pair_style gran/hooke/history 4e5 NULL 1e2 NULL 0.5 0
pair_coeff * *
#分组
group particles type 1
atom_modify first particles
group rigid type 1
neigh_modify every 1 delay 0 check yes exclude molecule/intra all
#热力学信息输出
thermo 1000
thermo_style custom step atoms ke
thermo_modify flush yes lost warn
comm_modify vel yes cutoff 3
#创建分子模型
molecule mymol molecule.data
region pourreg block 5 115 5 55 60 80 side in units box
#设置重力加速度
fix gravfix all gravity 9.8 vector 0 0 -1 disable
#定义分子为刚体
fix rigidfix all rigid/small molecule mol mymol gravity gravfix
#在pourreg区域内随机生成400个分子
fix pourfix all pour 400 0 1234 region pourreg mol mymol rigid rigidfix
#设置底部墙
fix zwall all wall/gran hooke/history 4000.0 NULL 100.0 NULL 0.5 0 zplane 0.1 NULL
#保存坐标文件
dump 1 all custom 1000 molecule_pour.xyz id type mass radius x y z fx fy fz
#启动运行
run 50000
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