小麦是世界上主要的粮食作物之一，也是大陆最主要的粮食作物之一。小麦分子育种技术的出现，加速了小麦育种的进程，可以有效地提高小麦的品质、产量和适应性，是小麦育种研究的重要手段之一。
博瑞迪小麦100K液相芯片(GenoBaits® Wheat 100K Panel)产品依托于国内外1,000多份六倍体小麦重测序数据、4.5万份GBS数据、近千份的外显子测序数据和商业化芯片数据，同时涵盖有数千个QTL位点，适用于野生种、农家种、栽培种及二倍体、四倍体种质材料，可用于种质资源评价、图谱构建和全基因组关联分析等。该产品开发流程中，分别选取了国外和国内材料中高质量SNP位点，通过位点优化生成种质资源100KSNP，并以此设计初始探针，利用国内国外各100份材料，最终经过实验和优化后形成本产品。其中，国外材料中的高质量SNP数据分别来自1,000 wheat exomes project、dbSNP数据库、GBS数据库、CropSNPdb等；国内材料中的高质量SNP数据则来自WGVD：小麦数据库、小麦基因组变异联合数据库等。
产品特点及优势
1. 代表性高，多样性信息丰富
依托于国内外1000多份六倍体小麦重测序数据、4.5万份GBS数据、近千份的外显子测序数据和商业化芯片数据，同时涵盖有数千个QTL位点，适用于野生种、农家种、栽培种及二倍体、四倍体种质材料。
2. 标记区段，信息量更大
本产品为100K个标记区段，实际可提供多达251,215个SNP位点信息，保证了科研应用时对于位点数量的要求，也极大程度上降低了使用成本。芯片中包含128个功能标记，涵盖了小麦常见的21个性状，其中抗病标记63个，品质性状标记15个，产量性状标记20个。
3. 应用方向广泛
可用于种质资源评价、图谱构建、全基因组关联分析、分子标记辅助回交育种和基因组选择等。
产品应用方向
科学研究
▶遗传图谱构建
▶QTL分析
▶全基因组关联分析（GWAS）
育种应用
▶种质资源基因型鉴定
▶全基因组选择育种
▶遗传相似度分析、亲缘关系分析
▶品种保护、真实性鉴定
产品服务流程
1. 送样质检
2. 捕获建库
3. 高通量测序
4. 数据质控
5. 云端生信分析
产品数据表现
△图1 小麦100K液相芯片标记在染色体上的分布图
在图1中，本产品的108,836个核心SNP标记均匀分布于小麦染色体上
*标尺释义：在基因组上每个滑动窗口（窗口步长1Mb）内核心SNP的个数
△图2 小麦100K液相芯片mSNP标记区段在染色体上的统计
△图3 小麦100K液相芯片核心SNP位点MAF分布图
△图4 小麦100K液相芯片核心SNP位点均一性和检出率
△图5 小麦100K液相芯片核心SNP位点注释统计
△图6 小麦100K液相芯片核心SNP位点样本检出率
博瑞迪小麦物种系列产品