小麥是世界上主要的糧食作物之一，也是大陸最主要的糧食作物之一。小麥分子育種技術的出現，加速了小麥育種的程序，可以有效地提高小麥的品質、産量和适應性，是小麥育種研究的重要手段之一。
博瑞迪小麥100K液相晶片(GenoBaits® Wheat 100K Panel)産品依托于國内外1,000多份六倍體小麥重測序資料、4.5萬份GBS資料、近千份的外顯子測序資料和商業化晶片資料，同時涵蓋有數千個QTL位點，适用于野生種、農家種、栽培種及二倍體、四倍體種質材料，可用于種質資源評價、圖譜建構和全基因組關聯分析等。該産品開發流程中，分别選取了國外和國内材料中高品質SNP位點，通過位點優化生成種質資源100KSNP，并以此設計初始探針，利用國内國外各100份材料，最終經過實驗和優化後形成本産品。其中，國外材料中的高品質SNP資料分别來自1,000 wheat exomes project、dbSNP資料庫、GBS資料庫、CropSNPdb等；國内材料中的高品質SNP資料則來自WGVD：小麥資料庫、小麥基因組變異聯合資料庫等。
産品特點及優勢
1. 代表性高，多樣性資訊豐富
依托于國内外1000多份六倍體小麥重測序資料、4.5萬份GBS資料、近千份的外顯子測序資料和商業化晶片資料，同時涵蓋有數千個QTL位點，适用于野生種、農家種、栽培種及二倍體、四倍體種質材料。
2. 标記區段，資訊量更大
本産品為100K個标記區段，實際可提供多達251,215個SNP位點資訊，保證了科研應用時對于位點數量的要求，也極大程度上降低了使用成本。晶片中包含128個功能标記，涵蓋了小麥常見的21個性狀，其中抗病标記63個，品質性狀标記15個，産量性狀标記20個。
3. 應用方向廣泛
可用于種質資源評價、圖譜建構、全基因組關聯分析、分子标記輔助回交育種和基因組選擇等。
産品應用方向
科學研究
▶遺傳圖譜建構
▶QTL分析
▶全基因組關聯分析（GWAS）
育種應用
▶種質資源基因型鑒定
▶全基因組選擇育種
▶遺傳相似度分析、親緣關系分析
▶品種保護、真實性鑒定
産品服務流程
1. 送樣質檢
2. 捕獲建庫
3. 高通量測序
4. 資料質控
5. 雲端生信分析
産品資料表現
△圖1 小麥100K液相晶片标記在染色體上的分布圖
在圖1中，本産品的108,836個核心SNP标記均勻分布于小麥染色體上
*标尺釋義：在基因組上每個滑動視窗（視窗步長1Mb）核心心SNP的個數
△圖2 小麥100K液相晶片mSNP标記區段在染色體上的統計
△圖3 小麥100K液相晶片核心SNP位點MAF分布圖
△圖4 小麥100K液相晶片核心SNP位點均一性和檢出率
△圖5 小麥100K液相晶片核心SNP位點注釋統計
△圖6 小麥100K液相晶片核心SNP位點樣本檢出率
博瑞迪小麥物種系列産品