三、波斯尼亚基督教会
波斯尼亚基督教会今天已经不复存在，但它对波黑的历史进程有着一定的影响，这里简单说一下。
来自罗马与君士坦丁堡的传教士于8世纪末到9世纪初进入巴尔干半岛，使南斯拉夫人基督化，彼时的教会虽然尚未正式分裂，但是罗马教廷与君士坦丁堡之间已经事实上产生了差异和割裂，塞尔维亚人接受了君士坦丁堡教会（即后来的东正教），克罗地亚人接受了罗马教廷（即后来的天主教，为方便起见，后面统一以天主教/东正教描述，但注意教会的正式分裂在1054年），而处于两者之间，混居者克罗地亚人与塞尔维亚人的波斯尼亚地区，则出现了部分信仰天主教，部分信仰东正教的情况。
早期波斯尼亚教会教堂的遗迹
逐渐地，当波斯尼亚地区民众的独立意愿越来越强烈的时候，波斯尼亚基督教会也随之产生。12世纪时，由于大部分地区受匈牙利王国支配，所以波斯尼亚教会名义上属于天主教会。但事实上由于长期处于东西方教会边缘，波斯尼亚教会的教义已经变得混杂起来，而且由于东西方教会对该地没有有效的统治，被视为异端的的波各米勒派（Bogomils）在一些古代文献中被认为混入了波斯尼亚教会之中，无论是天主教还是东正教，都将波斯尼亚教会视为异端。
各个基督教“异端教派”的传播路线，波各米勒派（Bogomils）在波黑一带活动。
波斯尼亚地区事实独立后，匈牙利方面试图以讨伐异教徒为由出兵波斯尼亚，时任波斯尼亚统治者巴昂库林为了避免战争，在1203年公开宣称波斯尼亚教会服从于罗马教廷，这一举动延缓了匈牙利人的进攻，但是也导致了波斯尼亚教会的内乱和分裂。巴昂库林死后，匈牙利王国于1235年受教皇口谕发动波斯尼亚十字军东征（Bosnian Crusade），清洗异教徒。虽然后来因为蒙古人的入侵使得匈牙利方面不得不撤兵，但波斯尼亚教会经此一役已经松散不堪，存在感越来越弱，平民的信仰并不稳固，也得不到东西方教会的支持，没有归属感，为后面奥斯曼帝国入侵时波黑地区迅速伊斯兰化埋下了伏笔。
11世纪时东西教会的势力范围，以及保罗派教义（Paulicians）的分布，波各米勒派（Bogomils）被视为其分支。
