三、波斯尼亞基督教會
波斯尼亞基督教會今天已經不複存在，但它對波黑的曆史程序有着一定的影響，這裡簡單說一下。
來自羅馬與君士坦丁堡的傳教士于8世紀末到9世紀初進入巴爾幹半島，使南斯拉夫人基督化，彼時的教會雖然尚未正式分裂，但是羅馬教廷與君士坦丁堡之間已經事實上産生了差異和割裂，塞爾維亞人接受了君士坦丁堡教會（即後來的東正教），克羅地亞人接受了羅馬教廷（即後來的天主教，為友善起見，後面統一以天主教/東正教描述，但注意教會的正式分裂在1054年），而處于兩者之間，混居者克羅地亞人與塞爾維亞人的波斯尼亞地區，則出現了部分信仰天主教，部分信仰東正教的情況。
早期波斯尼亞教會教堂的遺迹
逐漸地，當波斯尼亞地區群眾的獨立意願越來越強烈的時候，波斯尼亞基督教會也随之産生。12世紀時，由于大部分地區受匈牙利王國支配，是以波斯尼亞教會名義上屬于天主教會。但事實上由于長期處于東西方教會邊緣，波斯尼亞教會的教義已經變得混雜起來，而且由于東西方教會對該地沒有有效的統治，被視為異端的的波各米勒派（Bogomils）在一些古代文獻中被認為混入了波斯尼亞教會之中，無論是天主教還是東正教，都将波斯尼亞教會視為異端。
各個基督教“異端教派”的傳播路線，波各米勒派（Bogomils）在波黑一帶活動。
波斯尼亞地區事實獨立後，匈牙利方面試圖以讨伐異教徒為由出兵波斯尼亞，時任波斯尼亞統治者巴昂庫林為了避免戰争，在1203年公開宣稱波斯尼亞教會服從于羅馬教廷，這一舉動延緩了匈牙利人的進攻，但是也導緻了波斯尼亞教會的内亂和分裂。巴昂庫林死後，匈牙利王國于1235年受教皇口谕發動波斯尼亞十字軍東征（Bosnian Crusade），清洗異教徒。雖然後來因為蒙古人的入侵使得匈牙利方面不得不撤兵，但波斯尼亞教會經此一役已經松散不堪，存在感越來越弱，平民的信仰并不穩固，也得不到東西方教會的支援，沒有歸屬感，為後面奧斯曼帝國入侵時波黑地區迅速伊斯蘭化埋下了伏筆。
11世紀時東西教會的勢力範圍，以及保羅派教義（Paulicians）的分布，波各米勒派（Bogomils）被視為其分支。
