解放战争结束，蒋集团土崩瓦解，退守台湾。知识分子一部分流亡台湾，一部分留在大陆，一部分在欧美留学。
傅斯年：山东聊城人，武松、宋江等只反贪官，不反皇帝的儒家“正统”“忠君”思想，到后来不反对蒋，只反对孔祥熙和宋子文，让蒋痛并快乐着得人物，号称黄河流域第一才子，考入北大，之后与陈独秀、李大钊、胡适在北大兴风作浪，后台老板就是北大校长蔡元培。蔡元培是光绪钦点的翰林，1917年接受黎元洪发的任命状，当时人们笑言，猪八戒肚子里吞了个孙悟空。1919年5月4日的五四运动，傅斯年就是其中一，有人说他是学生运动领袖，废除21条，归还山东青岛，赵家楼痛殴曹汝霖，烧了赵家楼，从北大毕业，辗转到英国和德国深造，追寻愈大维和陈寅恪，1926年在外学习7年的傅斯年归国被朱家骅请为广州中山大学教授，之后傅斯年被聘请为中央研究所所长，傅斯年学问高深同时性格强硬，在政治上想有所作为。一直辗转在政府与学术之间。直到蒋退守，1949年1月，傅斯年正式就任台湾大学校长，兼任中央研究院史语所所长。台湾大学，是中日甲午海战之后1928年日本建立的，原名台北帝国大学，直到1945年抗日战争胜利，国民党派罗宗洛接手，改名国立台湾大学，因为种种原因，傅斯年就任时台大已经是第4任校长了，国民党撤退，正处于大萧条、混乱时期，一百万人蜂拥而至的时候，校舍都没有办法容纳。55岁的傅斯高血压脑出血死后，台湾各界名流5000多人前来吊唁。一年后，台北大学在实验植物园内建造纪念亭一座，傅园，亭子为斯年亭，后来兵工厂赠送一座纪念钟，傅钟。
胡适。胡适（提倡白话文），新文化运动的倡导者。1948年，胡适没有听从爱徒吴晗的劝说留在北大，艰苦支撑一年之后，被美国普林斯顿大学聘请为东方图书馆馆长，胡适尽管是一代大儒，也要接受考核进入异族人的考核流程。1952年，为期两年的聘期已满，被普林斯顿大学解聘，给了一个名誉馆长。毛考虑擒贼先擒王的态度。胡适作为学术界的精神教主，只要把他压在五指山下，才能杀一儆百。1954年，倒胡运动开始，针对胡适的思想集中进行批判，郭沫若一马当先，开始口诛笔伐；胡适帮助沈从文追到张兆和（吴晗没追到），二人师生关系密切。但是沈从文依然选择批胡。胡适的小儿子胡思杜也站出来批判老爹，最后在1957年反右的时候，胡思杜被革职，变成了汉奸走狗，精神上奔溃的胡思杜最后选择上吊自杀。1957年前后，胡适也遭遇胃溃疡大出血，胃切除术，1958年胡适就任台湾中央研究院院长，为显示对学术界的尊重，蒋携陈诚亲自光临，以壮声势，1958年胡适主持台湾院士选举，选出杨振宁、李政道、吴健雄等海外的物理学家。1959年胡适公开反对蒋介石连任总统，蒋介石大为光火。1962年，胡适与梅贻琦在台大医院执手言谈，相互慰藉。1962年胡适心脏病发，当时有被李济气死一说。
身赴台湾的胡适，临死都不知道曾经谩骂他是“美帝国主义走狗”的小儿胡思杜已经自杀，还饶有深情地在遗嘱中提出给小胡分遗产，其状堪怜。胡适虽然是著名的学界“大鳄”，不仅要忍受台湾同行的明枪暗箭，还要忍受小儿胡思杜的检举揭发，精神上的抑郁可想而知。在胡适迷人微笑的背后，其实是一颗千疮百孔的心。最终，这位古稀老人在一次宴会上溘然离世。在胡适死后若干年发动的那场浩劫中，在红卫兵歇斯底里的批斗声中，曾经积极揭发过他的学生、朋友、亲戚，不知道想到的最多的又是什么？兔死狗烹吗？
张伯苓应周恩来挽留在北京，后被南开大学一阵抢白之后变得沉默寡言，郁郁寡华中离开人世，大陆只是给张伯苓举行了简单的告别仪式，而蒋听闻之后在日记中写下痛悼无己。并在台湾举行盛大的追悼大会。张伯苓的遗愿是葬在南开校园。直到1986年，才得以如愿。
梅贻琦。1948年梅贻琦离开大陆，来到美国，1955年创建台湾清华大学；1958年受好友陈诚相邀，就职教育部长，呕心沥血，夫人韩永华在美国，儿子梅祖彦在清华大学助教。1962年，继胡适去世之后，梅贻琦离世，新竹清华园内下葬，称为梅园。一心维系家国命运的梅贻琦，虽然在台湾新竹完成了重建清华的夙愿，但直到生命弥留之际再也没有见过爱子梅祖彦。
蒋梦鳞。辞去北大校长之后的蒋梦鳞跟着宋子文鞍前马后跑了一阵之后，随着宋子文倒台，树倒猢狲散了，蒋梦鳞到达台湾之后建立农复会。妻子陶氏死后，蒋梦鳞娶了徐贤乐，这位徐小姐也属于名流，但只追求钱财，嫁给一位年近50的杨杰将军（被国民党特务暗杀），维持婚姻7个月就宣布离婚，一直都有情人，直到75岁的蒋梦鳞遇到53岁的徐贤乐，为她写艳词，这得到了宋美龄在内一众人反对，胡适也不顾病体，加以劝告，但蒋梦鳞采取“打枪的不要，悄悄地进房”策略，悄悄结婚。之后徐掌控家中钱财，以前同事请蒋梦鳞吃饭从来不到，之后一请就来，一天饭钱都被限定为20元，蒋梦鳞跌伤一条腿之后，婚姻也走到了尽头，1964年蒋梦鳞肝癌离世。一代名儒惨淡收场。
叶公超。叔父叶恭绰（北洋政府交通总长，孙中山广州革命政府财政部长，南京国民政府铁道部长），1937年上海沦陷之后，叶恭绰流亡海外，小妾潘氏争夺财产（含有毛公鼎，道光出土，青铜器内有铭文，主要内容时周宣王治国（台北故宫博物院三宝毛公鼎、肉形石、翡翠白菜）），叶公超正值38岁，叔父叶恭绰派叶公超专程保护毛公鼎。毛公鼎最早落入端方手中，1916年，端方的后人将宝鼎押在天津俄国人开办的银行，时任交通总长的叶恭绰3万元赎回。结果，叶公超被小潘用计被日本宪兵队以间谍名义抓走，除了审判，最重要的是从叶公超口中得出毛公鼎的下落，但叶咬牙挺住，最终秘密携带毛公鼎逃往香港，这一去，也结束了叶公超的西南联大外文系主任以及教授生涯，成了国民党驻英办事处处长，之后升为欧洲司司长，抗战胜利后，叶公超被任命为台湾当局外交部长，之后调任台湾驻美大使。回台湾之后，在台湾过起了文人雅士的生活，梁秋实当时在台湾师范大学任教，立邀叶到学校讲课，但当局又来施压，一个学期之后便离开学校，甚至不让面见在美国的家人，直到1981年在台湾逝世。叶公超当时西南联大的同事有钱钟书、闻一多、徐志摩、梁秋实（翻译莎士比亚全集），他的学生季羡林、杨振宁、许渊冲。
有人说，台湾的学者唱戏彭屁股自己捧自己，大陆的学者对着镜子喊王八自己骂自己。
吴晗，解放战争期间，吴晗利用清华大学教授的身份暗中与中共地下党联系，召开秘密会议，蒋追捕地下党的时候，吴晗逃亡河北西柏坡，受到毛、周接见，吴晗把自己写的《朱元璋传》给毛过目。1949年1月解放军炮击天津，中共高c的授意下，入主清华园，整肃掉冯友兰头上清华校务委员会委员和文学院院长两顶帽子之后，吴晗接过冯友兰开始主持清华校务，1949年新中国成立之后，冯友兰闻听清华大学许多教授写信给毛表忠心，加以效仿，争取五年时间写出一部马列主义史官的哲学史，将功赎罪。结果毛回信，让其“采取老实态度为宜”。一月北平城和平解放的时候，11月，吴晗就出任北京市副市长。一次，毛看湘剧《生死牌》结尾海瑞经常大骂嘉靖皇帝，并且被下狱，但当得知皇帝死后，却大哭，说明对皇帝忠心耿耿，毛找到宣传部的人写一篇关于海瑞的文章，由此想到明史专家吴晗，吴晗受宠若惊，写了一篇《海瑞骂皇帝》发表在人民日报上，中心思想突出海瑞的“敢”，之后，又写了《海瑞罢官》》《海瑞的故事》等文章，宗旨就是宣传海瑞敢说真话的精神，给予充分肯定，之后1960年，吴晗在京剧演员马连良要求下，写出五场京剧《海瑞》剧本，如此在一帮糊涂蛋的鼓噪吹捧之下，彩排，《海瑞罢官》正式上演。上演之后，毛很高兴。1965年年底，吴晗从报纸上就看到了姚文y评新编历史剧《海瑞罢官》的文章，他隐约感觉到风暴要来临了。1969年被批斗致死。
俞大维（哈佛数学逻辑学，提出造原子弹）和曾昭抡（化学专家，北大教授，曾国藩后人），蒋介石和陈诚同意之后，筛选李政道、杨振宁、吴大猷，华罗庚等，随着解放战争的白热化，两党也开始争抢这些国宝级人物。吴大猷、李政道、杨振宁留在国外，曾昭抡、华罗庚、赵忠尧返回大陆。曾昭抡被周恩来任命为北大化学系主任兼教务长，权利和地位与清华的吴晗不相上下。1955年，中国科学院化学研究所成立，任所长。1957年，曾昭抡被打成右派，曾昭抡一生治学，之后武大校长李达请曾昭抡进入武汉大学教书，在这里更是一心治学，书写了140万字的《元素有机化学》，全稿六册，但文革爆发之后仅仅残存了两稿。自己得了淋巴癌，爱妻自杀，李达被批斗之后，曾昭抡惨死。
叶企孙的爱徒熊大缜，在敌后冀中根据地，制造炸药、地雷，抵御日本的机械化部队，切断日本交通线路，而新中国成立之后，地雷战那些电影中出演的农民发明的地雷，就艺术角度讲，显得新奇，适应人民创造历史的理论导向，但不符合历史事实，这也正是后来胜利者骨子里对知识分子轻视和不信任，才导致的知识分子群体的悲剧。
梁思成与林徽因，因为林徽因弟弟林恒在成都飞行员牺牲，蒋赠送一把中正剑，正是因为这把剑，也未能幸免，梁思成被斗争搞得焦头烂额，长叹抗战八年，跋山涉水，先长沙，在昆明，后李庄，面对饥饿与疾病，过关斩将，终于迎来胜利，现在看来却过不了文革这一关，1972年一带建筑大师梁思成溘然长逝。1946年，林徽因结束了九个年头的颠沛流离，跟家人回到了一直以来念兹在兹的北平，满怀深情地重访每一处故地。抗战结束之时，虽然已受尽病痛折磨，但她依然选择了放弃赴美治疗的机会，选择了“和祖国一起受苦”。这位“民国女神加才子”，像一位勇士，她的一生，是对得起金岳霖对她“一身诗意千寻瀑，万古人间四月天”的哀挽，以及终生未娶的痴情的。
钱穆：江苏无锡人，在联大任教，被顾颉刚携带至燕大，北大，与胡适、傅斯年等人不合，钱穆说傅斯年是山东土匪头子，傅斯年说钱穆是南方小裁缝，闻一多说钱穆不是东西。胡适讲课讲不过钱穆，国学大师开始嫉妒。钱穆第一个妻子死亡，第二个妻子肚子抚养五个孩子，新中国成立之后，钱穆到香港，后在朱家骅邀请到台湾演讲受伤，受到女学生胡美琪的照顾，1956年二人结为夫妇。这段婚姻，李敖讥讽台大教授的风气，有先奸而后娶，也有先奸而不娶者，1967年蒋介石让蒋经国师从钱穆，学习治国之学，钱穆被选为院士，直到1989年钱穆的靠山去世，一个叫陈水扁的立法委员也站了出来，书面形式收回素书楼，时任台湾总统的陈水扁，则想到一个办法，钱穆搬出后，改素书楼为钱穆纪念馆，结果钱穆大怒，说活着不让住，还没死就建纪念馆，这是哪家的逻辑，在这种夹攻之下，95岁双目失明的钱穆被迫在1990年搬出居住了20年的素书楼，三个月以后去世。胡美琪把钱穆的骨灰安葬在无锡太湖，也算落叶归根。1994年陈sb当上台b市长，把素书楼改为纪念馆，2010年，钱穆去世20周年，国民党主席马yj来到纪念馆纪念。
1952年，教育部开始清算和调整院校，为减少庚子赔款，美帝国主义遗留在清华的印痕和毒素，清华被五马分尸，文学院、法学院、理学院被并入北大，清华只得到一个北大的工学院，作为一个工科大学在风雨中自生自灭，北大成为了革命的摇篮，接受了清华三个学院之后，搬入燕京大学，兼并了燕京大学的校舍教职工和学生，与清华大学隔一条马路。
知识分子虽然命运不同，结局不同，但星星之火可以燎原，革命的火种和知识分子的火种还是得以保留，中华民族的文化基因依然在祖国大地绽放。