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前文讲到宇文化及打算与李密决战。
瓦岗军与骁果禁卫军的这场战役，算得上是一场“大战”，双方都派全部主力部队作战，且战斗值旗鼓相当，骁果军战斗力彪悍，瓦岗军身经百战，这在整个隋末农民起义中，算得上是最大的战役之一。实际上这场战争是可以避免的，对于瓦岗军来说，禁军只想回关中，威胁不大，但是在多种因素的作用之下，选择出战。但是事实证明，李密高估了自己的战斗力，激战中李密受了箭伤倒下，手下四散分离，只有秦琼挺身而出，不仅救了李密，还重新排兵布阵，继续与敌人战斗。
这场战争，对瓦岗军来说，只能说是杀敌一千，自损八百。虽然打败了宇文化及，但是瓦岗军也付出了惨痛的代价，同时这也是瓦岗军走向失败的一个分水岭。
对于宇文化及来说，回关中是不可能的了，从江都带走的10万兵力，一路逃的逃，死的死，此时只剩了两万多人了，他带着剩下的士兵和百官后宫，来到了魏县。到了魏县驻扎下来后，军心不稳，有的将领开始谋划怎么样带着自己的部队潜逃，被他知道后，将其斩首，从侧面看出，宇文化及军队的人心已然分离。
鉴于此，宇文化及也跟隋炀帝一样，成天买醉，醉酒后还跟手下起冲突，所以反叛逃亡者越来越多。在这大势已去的情况下，宇文化及又突然想当皇帝，于是他毒死了他从江都带回来的傀儡皇帝秦王浩，在魏县登基称帝，国号为“许”。恐怕宇文化及也是清楚自己已经是来日无多了，他现在来的是窦建德的地盘，窦建德怎会放过他呢？
果然不久之后，宇文化及就遭到了唐军李神通部的袭击，2000多人战死，然后他们又逃到了聊城，在聊城这个地方，又迎来了窦建德的主力部队，这下子宇文化及是彻底的完蛋了。
窦建德借打击逆贼的旗号攻破聊城之后，接回萧皇后，见面时窦建德特意裹了一件丧服，表示自己凭吊隋炀帝。他的这一姿态，跟其他的起义军一样，都是不愿意当出头鸟，表面上披麻戴孝，一口个“臣”，不过都是演员而已。
窦建德将杀死隋炀帝的一干元凶全部在隋朝百官面前处死了，将宇文化及和他的两个儿子押送至襄国城，并将他们处死，宇文化及就此消失在历史舞台上。