趙構的生育問題需要分段來探讨。在他年輕時，他确實生了五個女兒和一個兒子。然而，在靖康之役期間，五個女兒被金兵俘虜，其中三人在途中不幸夭折，而另外兩人被送到北方後遭受了沉痛的遭遇。
趙構的唯一兒子趙旉于1127年誕生。不久後，南宋爆發了苗劉兵變，導緻年僅三歲的趙旉被推舉為皇帝，但很快又“讓位”給了他的父親趙構。然而，這次兵變對趙旉造成了深刻的心理創傷，不久後他生病并于同年七月去世。趙旉的死使趙構陷入了絕望，盡管他在後宮努力耕耘，但再也沒有後繼的嗣子。
正史沒有詳細記載趙構為何無法再生育子嗣，但民間傳說卻紛紛傳播着各種理論。有一種說法認為，趙構因為金兵的追擊而受到極大的驚吓，導緻了一種無法言說的疾病，使他失去了生育能力。這種說法雖然不足為信，但也反映了趙構的困境。
另一方面，趙構在趙旉去世後選擇收養了兩名宗室孩子，趙伯琮和趙伯玖，這在曆史上并不常見。趙構當時年僅26歲，身體健康，但卻急着過繼養子。這可能是因為他自己已經意識到了生育上的問題，是以需要提前做好繼承安排。
盡管趙構曾積極地尋求醫治，他甚至提拔了一位醫生，但最終他無法再次成為親生父親。1162年，趙構決定将太子之位傳給趙伯琮（趙昚），并自己退位為太上皇。最終，于1187年，年屆81歲的趙構去世，不知在臨終前，他是否還心懷遺憾。