RNA-seq 比對軟體STAR——（1）安裝

文章目錄

• RNA-seq 比對軟體STAR——（1）安裝
• • 一、package下載下傳
  • 二、編譯
  • 三、環境配置
  • 四、測試

一、package下載下傳

在GitHub知道package，使用加速複制連結下載下傳。我需要2.7版本以上，是以下載下傳最新版，建議沒有特定需求下載下傳最新版，bug修複的差不多了，更便捷

#直接gitclone
git clone https://github.91chi.fun/https://github.com/alexdobin/STAR.git
#或者wget
wget https://github.91chi.fun/https://github.com//alexdobin/STAR/archive/refs/tags/2.7.10a.tar.gz
           

二、編譯

tar zxvf 2.7.10a.tar.gz
cd STAR-2.7.10a
cd source
make STAR
           

三、環境配置

修改環境

vim ~/.bashrc

增加下面一行後

source ~/.bashrc

注意：一定是bin目錄下的linux_x86_64_static 不是linux_x86_64！！ 如果寫錯了就會出現下圖的情形

四、測試

STAR --version
           

OK 啦