RNA-seq 比对软件STAR——（1）安装

文章目录

• RNA-seq 比对软件STAR——（1）安装
• • 一、package下载
  • 二、编译
  • 三、环境配置
  • 四、测试

一、package下载

在GitHub知道package，使用加速复制链接下载。我需要2.7版本以上，所以下载最新版，建议没有特定需求下载最新版，bug修复的差不多了，更便捷

#直接gitclone
git clone https://github.91chi.fun/https://github.com/alexdobin/STAR.git
#或者wget
wget https://github.91chi.fun/https://github.com//alexdobin/STAR/archive/refs/tags/2.7.10a.tar.gz
           

二、编译

tar zxvf 2.7.10a.tar.gz
cd STAR-2.7.10a
cd source
make STAR
           

三、环境配置

修改环境

vim ~/.bashrc

增加下面一行后

source ~/.bashrc

注意：一定是bin目录下的linux_x86_64_static 不是linux_x86_64！！ 如果写错了就会出现下图的情形

四、测试

STAR --version
           

OK 啦