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曾國藩是個明白人，他不會忘記那些犧牲在戰場上的勇士，是以他要辦一件大事：祭奠陣亡将士。
該撫恤的已經撫恤了，但祭奠不能少，是做給活着的人看的，起到進一步團結士兵，鼓舞士氣的作用。
他特地選了一個好日子，在湘江邊擺下香案進行祭奠，全軍衣着缟素，白旗白幡呼啦啦一大片。要是機靈一點的商家，事先進了一大批白布，此刻絕對大賺一筆。
曾國藩領着将士上拜天地，下拜諸神魂魄，淚流滿面地當衆大聲朗讀祭文，他要告訴所有将士們：跟着我曾國藩，活着有酒有肉有軍饷，死了還有榮耀。
有這樣的好事，哪個傻子才不跟他。
很多綠營士兵自動離隊，加入了湘勇的陣營，短短幾天，曾國藩的湘勇就翻了一倍多，有三四萬人之衆。
按大清例律，綠營兵擅自脫離隊伍就是逃兵，抓住是要被殺頭的，可是此一時彼一時，人家隻是換了一個身份，替自己增加了一點軍饷而已，還是和以前那樣替大清賣命。再說了，整個湖南都是曾大人說了算，連皇上都被曾大人牽着走，誰還敢說半個“不”字。
于是，湖南一半以上的綠營兵成了“曾家軍”。
太平軍雖然暫時退去，但是肯定會卷土重來的，曾國藩并沒有沉浸在勝利中，他認為重中之重必須要重整湘軍，在作戰中，有的奮不顧身，勇敢殺敵，而有的卻像綠營兵那樣不堪一擊，臨陣脫逃。湘軍一向強調“不怕死”的精神，而偏偏有的湘勇和将領臨陣退縮，對不起這份豐厚的軍饷，這樣的兵将，隻有讓其滾蛋，别一粒老鼠屎害了一鍋粥，在今後的戰役中，造成不可估量的損失。
曾國藩的性格就是，一旦發現了問題，就及時的處理，絕對不會讓問題鬧大，越早解決就能防範很多問題，不拖泥帶水。
經過一番調查，塔齊布、彭玉麟、楊載福所率之營能戰能防，臨敗不潰，三次戰鬥中都表現出色，志氣可嘉。對于這樣的将和兵，曾國藩大加獎勵，而且他還特别獎勵了什長鮑超和申名标，因為他們在戰鬥中面對強敵仍能勇敢奮戰，是以他們被提升為營官。而對于那些一觸即潰、貪生怕死的将和兵，曾國藩也給予了嚴厲的制裁，特别是在靖港之戰中，那些不服從指令，不
聽從指揮，隻知道逃命的官兵，無論級别大小一律不用，命其回家。其中，他的弟弟曾國葆所帶的一營就在被裁範圍之内，而曾國葆本人也被撤職趕回了老家。當他聽到這個指令時，在曾國藩面前跪下來，哭着求曾國藩把他留下，但曾國藩告訴他，軍令如山，必須服從，更何況正人必先正己，必須這樣做才能讓别人信服，并讓曾國葆回去告訴曾國荃和曾國華，讓他們在家鄉再招鄉勇五百名，日日進行操練，待機而用。
這次整頓共裁三千餘人。而塔齊布、彭玉麟、楊載福、羅澤南四部則大量增募，其中塔齊布一部高達七千人，羅澤南一部增至一萬餘人。整頓後的湘軍共有四十營，其中水陸兩師各二十營。水陸兩師均設統領兩人，塔齊布、羅澤南統領陸師，彭玉麟、楊載福統領水師。
曾國藩手下有兵力近四萬人，他知道西洋火炮在湘潭戰役中發揮了很大的作用，于是購進一大批先進的洋槍洋炮，緊急裝備出了五個火槍營。
在武器裝備上，湘軍的實力大于太平軍，經過兩個月的整頓，曾國藩大手一揮：進攻嶽州，拿下武昌。
駐守嶽州的是太平軍的猛将曾天養，塔齊布依仗洋槍洋炮的威力，很快拿下了嶽州的門戶城陵矶，并殺死曾天養。曾天養一死，太平軍失去指揮，如潮水般退去，曾國藩不費吹灰之力拿下了嶽州，湘軍鋒芒直逼武昌。
武昌因其獨特的戰略位置，自古以來為兵家必争之地。曾國藩認為要平定太平天國，首先奪取武昌，才能水陸順流東下，進攻九江、安慶，直抵金陵。是以他全力謀取此城。
新式洋槍洋炮的威力果然威猛，八月二十一日，曾國藩指揮湘軍水師，以摧枯拉朽之勢連克武昌和漢陽。
隻兩三天的時間就拿下了太平軍的重鎮，鹹豐皇帝接到湖廣總督楊霈的奏報之後，簡直不敢相信，過了幾天才确認消息是真的。鹹豐皇帝大喜：這個姓曾的剃頭匠，果真是朕的頂梁柱，朕沒看錯他，來人，馬上拟旨進行嘉獎。
上谕很快到了武昌：曾國藩為湖北巡撫，胡林翼被封為湖北按察使，羅澤南被封為浙江甯紹道台，彭玉麟被封為廣東惠潮嘉道，楊載福、鮑超、李元度、李續賓、郭嵩焘、劉蓉、陳士傑等人也均得到了提升。
就在曾國藩和衆将領喝酒慶祝的時候，第二道上谕緊接着到了：收回曾國藩的湖北巡撫任命權，隻授給兵部侍郎銜，其餘将領的賞賜暫緩，待再立戰功酌情論賞。
活脫脫一盆冷水從頭澆到腳。那個一直陷曾國藩于不仁不義，嫉妒曾國藩的小人陶恩培，竟實授了湖北巡撫之職。這些讓曾國藩費解，而在左思右想了一番，曾國藩明白了其中的原因：原來滿族的皇帝，始終信不過手握兵權的漢臣，看來，康熙時代周培公的經曆，又要在他身上重演了。
曾國藩明顯感覺到了鹹豐皇帝對他的猜忌，但他不是周培公，手裡有兵不說，太平軍的勢力還挺大的，才赢了兩戰，就想卸磨殺驢呀？門都沒有，他火了，直接上折子逼問是怎麼回事，哪有皇帝這麼出爾反爾的？
鹹豐的回信也很巧妙：朕料汝必辭，又念及整師東下，署撫空有其名，故已降旨令汝毋庸署理湖北巡撫，賞給兵部侍郎銜。
怎麼樣，我料到你會繼續往東剿匪，是以湖北巡撫這個職位對你可有可無，你不能占着茅坑不拉屎吧？
鹹豐皇帝沒有這樣的智商，但身邊有啊！
曾國藩有所不知，鹹豐皇帝開始确實要賞他的，可是皇帝耳根子軟，聽信了讒言，有一個平時就與曾國藩不對的大臣進言:曾國藩以侍郎在籍，猶匹夫耳。匹夫居闾裡，一呼，蹶起從之者萬餘人，恐非國家福也。
也就是說，曾國藩本不過是以侍郎銜在家守孝的退休官員，如同一介平民。一介平民在老家聲呼喚，就能聚集起這麼多人跟他打仗賣命，并且所向無敵，這恐怕非國家之福吧?
鹹豐皇帝一聽，有道理，這個家夥平時給自己上的那些道奏折，句句直言頂撞，現在想起來還頂得自己心口疼。這樣的人，怎麼能指望他老實聽話？如果你哪天起了異心，你這支生猛的軍隊，誰抵擋得住？如果曾國藩手裡有了兵權，再給他地方行政權，就很有可能開啟軍閥割據的局面。大清初期的三藩之亂，就是很好的證明。
手下的将領都感到不服，曾國藩還出言安慰大家：皇上這麼安排是有道理的，我們是來打仗的，不是來争寸功的，他日掃平了賊寇，朝廷自然會論功行賞。
安慰好了衆人，曾國藩把下一步的作戰計劃上報給了鹹豐帝。他想采取穩紮穩打、步步為營的戰略，同時想好好經營一下湖北，為湘軍建立糧饷基地。然後以湖北和湖南為基地，向江西、安徽等地進軍，一步步逼向太平天國的首都天京。眼下當務之急是休整部隊，補充兵員，這樣才能提高戰鬥力，為下一步的戰鬥奠定基礎。曾國藩明确地指出，太平軍的主要兵力在長江兩岸，那裡是主要實力所在，再說太平軍深得湖北和江西兩地群衆的擁戴，如果此時湘軍孤軍深入作戰，勢必會造成重大損傷，弄不好會全軍覆沒。
他還提出立即東下的三個困難：
一是經過從嶽州到武昌的一系列激烈戰鬥之後，湘軍減員嚴重，戰船大部分損壞，武器彈藥不足，且“屢勝之餘，志驕氣溢，殊覺散佚，暗伏挫敗之機”。必須進行較長時間的休整和補充。
二是太平軍仍有相當實力，湘軍若孤軍深入，很有可能陷入太平軍的包圍之中。
三是湘軍沒有穩固的後方，迅速東下江西安徽，沒人供給軍饷糧草，“軍火、銀米一有缺乏，軍士潰散，前功盡棄盤。”
不得不承認曾國藩的大智大勇，在取得幾次大的勝利之後，仍不驕不躁，小心謹慎，保持着清醒的頭腦。但此時的鹹豐帝已被勝利沖昏了頭腦，他不顧一切地急于求成，拒絕了曾國藩的正确意見，下旨嚴令曾國藩率湘軍立即東下，配合江南江北兩個大營，早日消滅太平軍。你如果停滞不前，難道是要造反嗎？
鹹豐皇帝在逼曾國藩進兵的同時，也下旨給江南大營的統帥向榮：若能迅克金陵，則汝功最大，前罪都無；若仍吃緊時巧為嘗試，則汝之罪難寬，朕必殺汝！
他同樣威脅江北大營主帥琦善：琦善老而無志，如再不知愧奮，朕必用從前賜賽尚阿之遏必隆刀将汝正法！
皇帝以死相逼，曾國藩深知若再上書，皇帝定會以抗旨不遵的罪名論處，隻好率軍東征，後來發生的事情果然驗證了他的英明決斷，湘軍隻在田家鎮一戰取得了勝利，之後便陷入了太平軍的重重困境之中。
既然知道了結局，曾國藩肯定想到了解決之法。（預知後事，請看下一節）