1988年，巴勒斯坦建国后，阿拉法特的民族解放事业终于迎来了曙光。六年后，阿拉法特回到了阔别27年的加沙定居，但和平并未到来。1995年，以色列总统拉宾被极端犹太分子刺杀，中东表面上的和平彻底被撕碎了。
在那之后，巴勒斯坦和以色列爆发大规模流血冲突，不少平民在冲突中死亡或受伤。接着，以色列以打击恐怖主义为由，将坦克和大炮开进了巴勒斯坦，还顺带把阿拉法特囚禁在了他的官邸里。2002年3月底，多次自杀式爆炸事件让以色列再一次抓到了巴勒斯坦恐怖分子的把柄，也让以色列给阿拉法特再次扣上恐怖头子的标签。
以色列趁机将军队推进到了阿拉法特官邸几十米的地方，肆无忌惮地摧毁官邸的建筑物断水断电，意图将阿拉法特活活困死。对此，阿拉法特强硬地表示，没有人可以把我赶走，我死都不会离开巴勒斯坦。就这样，他成了唯一一个在废墟中办公的国家领袖。
2004年10月27日晚，阿拉法特在与巴勒斯坦总理和前总理用餐时突然剧烈呕吐，两天后因为病情没有好转，他被送到法国巴黎郊区的贝尔西军医院进行治疗。11月11日，阿拉法特因为全身的血管血液凝固堵塞而去世，但有一部分人却认为阿拉法特是死于“钋中毒”，而凶手就是以色列的总理沙龙。
在他死后的第九年，法国专家在医学取样化验后公布，阿拉法特就是自然死亡的。关于阿拉法特的死因之谜，至今也没有一个统一的说法。这个中东地区的传奇人物死后却留下了许多故事和争议。阿拉法特不仅是巴勒斯坦人的父亲，也是中国人民的老朋友。
谈起阿拉法特和中国的关系，阿拉法特总是将中国是第一个承认巴勒斯坦地位的非阿拉伯国家这句话挂在嘴边。每一次巴勒斯坦一有重大事件发生，阿拉法特就会来到中国。阿拉法特每一年都要和中国领导人交流意见，尤其是国际大事件，他尤其在意中国的态度。
1993年，阿拉法特在华盛顿签署了《奥斯陆协议》后，他立即从华盛顿直接飞到北京，亲自给中国领导人解释这个和平协议是怎么回事。1998年已经是69岁高龄的阿拉法特在途经四十多个国家的访问后，身体已经吃不消了，但他还是决定到老朋友中国那里坐一坐，去干什么呢？
巴勒斯坦一直以来使用的都是以色列的纸币或者是美元。巴勒斯坦建国后，阿拉法特认为，巴勒斯坦人必须得有自己的货币，因此他决定求助中国，在向中国传达了这个想法之后，中国金币总公司设计部的胡福庆设计师接下了这个任务。
在几天几夜的连续工作后，胡福庆设计师给阿拉法特呈上了两张巴勒斯坦币的草图。这枚纸币的正面是阿拉法特肖像和巴勒斯坦银行，四周是花纹，背后是耶路撒冷硬石大教堂。阿拉法特见到纸币眼前一亮，连忙夸赞胡福庆设计师的构想。
后来这个由中国设计师设计的纸币成为了巴勒斯坦的第一枚纸币。也是这一年阿拉法特结束了对中国的访问。回到巴勒斯坦后，中国驻巴勒斯坦大使馆给他请了一个中医，中医让他保持良好的作息，保证充足的睡眠。但阿拉法特只是笑一笑，他依然每天八点开始工作，夜里一两点才回官邸休息，中医常常为了这个责怪阿拉法特。
2002年11月13日，当阿拉法特与中国中东问题特使王世杰会面时，他激动地抱住了这个老朋友。在简陋的贵宾室里，只有一张桌子、几把椅子、两个挂钟，大胡子卫队长端来两把椅子在门口一坐，整个气氛变得有些严肃了。
但当中国特使提到北京烤鸭的时候，那两个守门的士兵开始眉飞色舞的比划，北京烤鸭应该怎么吃？在阿拉法特去世前，他曾14次访问中国，每次去都要看望在中国的巴勒斯坦留学生。阿拉法特生前经常感叹，我与中国几代领导人都有着深厚的友谊，让大多数中国人记住他的，也许是阿拉法特的中国情缘，而让全世界记住他的却是他中东“不死鸟”的神秘称号。
阿拉法特这个“不死鸟”的称号是怎么来的呢？在阿拉法特去世前，以色列曾对他进行过75次暗杀行动。令人惊讶的是，阿拉法特每一次都能够死里逃生，他笑着接受了“不死鸟”这个称号，并开玩笑说，如果奥运会有躲避暗杀这个项目的话，那我绝对有资格代表中东去参加比赛了。
1973年，以色列军队将一架利比亚客机击落，一百多名乘客和机组人员不幸全部遇难。阿拉法特原本计划搭乘这一航班，但他临时决定改乘其他航班。这个无心的举动，让他顺利逃过了一劫。但阿拉法特并不是每一次都能够那么好运和灾难擦肩而过。
1992年4月7日晚上，阿拉法特乘坐的阿尔及利亚民航客机，在途经巴勒斯坦游击队营地时突然遭遇一场大沙暴，机上的一切电讯网络被瞬间切断，外界联系不到飞机里的乘客，甚至不知道飞机的具体位置。事后，当人们找到这架飞机的时候，机身已经被断成三节，但阿拉法特却只是轻微擦伤而已。
这一次死神离阿拉法特如此近，却依然没有带走他。正因如此，阿拉法特成了巴勒斯坦人心目中的“不死鸟”，让巴勒斯坦民众和中东国家津津乐道的不止他的不死传奇，还有阿拉法特的个人情感生活。阿拉法特曾经说过，由于我的民族解放事业的特殊性，所以我的伴侣只能是巴勒斯坦。
事实上，阿拉法特有过三段刻骨铭心的感情，他的第一位夫人是一个叫做娜达.亚斯鲁的阿拉伯妇女，两人感情很好。但1975年黎巴嫩内战爆发，阿拉法特的第一任夫人不幸遭到暗杀，阿拉法特伤心欲绝。许多年后他与西欧的一代影视皇后伊莎贝尔再次坠入爱河，但两人因为聚少离多而感情渐渐变淡，最终还是以分手告终。
最出名的当属阿拉法特的第三位夫人苏哈.塔维勒，他是一个年轻美丽的女人，巨大的年龄差并没有让苏哈停止追逐这位中东伟人的脚步。1991年10月，热恋三年的阿拉法特和苏哈结为夫妻。结婚时阿拉法特62岁，苏哈只有28岁。
两人在一起后，苏哈先后担任阿拉法特的公关顾问和巴勒斯坦自治政府的经济顾问。苏哈为阿拉法特分忧解难。照理说，该赢得巴勒斯坦人民的支持和喜爱，但事实上，阿拉法特周围的亲信没有一个喜欢他。2000年，苏哈以照顾生病的女儿为由，长期在巴黎过着奢侈的生活。
苏哈和女儿住在一家豪华饭店里，从头到脚都是名牌货，就连发型也是专门找著名发型师独家设计的。苏哈还在巴黎富人区买下一所豪华公寓，经常出入巴黎时装周这样的时尚场所。相比之下，阿拉法特的处境显得穷困潦倒，他随时面临着被暗杀的危险。
生活简朴，吃住和普通老百姓没什么两样。阿拉法特被困在官邸的几年里，苏哈依然在巴黎过着纸醉金迷的生活。直到2004年，阿拉法特病危，苏哈才回到巴勒斯坦露了一面。大众同情阿拉法特，同时也忍不住抨击他对苏哈的纵容。
传言阿拉法特每个月给苏哈和女儿180万美元作为生活费，一年下来就是2160万美元。阿拉法特死后，巴政府许诺，按照阿拉法特生前的标准，每一年给苏哈2200万美元作为生活费。由此可见，巴勒斯坦这个贫穷落后国家的钱究竟花到哪里去了？
巴民族权力机构的腐败问题又有多么的严重了。而阿拉法特虽然公认的民族英雄巴勒斯坦国父，但同时也因腐败问题被诟病。尽管阿拉法特这个人物存在一定争议，但有一点可以确定，阿拉法特已在中东历史中打下深深的烙印，留给后人更多的思考。