由于水环境的恶化、饲养密度过大、饲料的投放量过高以及药物抗生素的滥用，使水中营养盐紊乱和缺乏，造成水环境破坏，有机质在水体大量的富集，而水中溶氧的下降引发的一系列问题，有毒有害物质的产生，氨氮、亚盐、硫化氢等理化指标的超标，同时寄生于鳃丝的虫害也在不断的增加造成生理性缺氧。饲料投放量过高，投放不合理引起消化代谢性疾病和肝胆负担过重引发的肝胆疾病。
草鱼属于草食性鱼类，在投喂的饲料中以植物性饲料和粗纤维为主，同时饲料中添加多种维生素，以保证维生素的供给，配合蛋白和能量弥补饲料中的营养不足。选择蛋白优质、配比合理的饲料，不仅可以提高饲料蛋白的转化率，降低饵料系数，同时还可以减少饲料中氮元素在水中的转化，防止氨氮对水体的破坏。
如果饲料中蛋白含量过高或投放量过大，非常容易引起草鱼的脂肪肝和肠炎。在饲料投放的过程中，一定要注意保护肝胆的健康，定期在饲料中添加保肝护胆的药物，以解除肝胆中毒素的蓄积，减轻肝胆的负担，维持正常的生理功能。
想要保证草鱼的高产就要合理放养，密度不可过大，降低池塘载鱼量，不仅减少了疾病的发生率，还可以减少因饲料的投入量和粪便的产出量过多对水环境的污染。在饲料大量投喂期间，定期的使用有益菌种，比如：芽孢杆菌、光合细菌、硝化菌和反硝化菌、乳酸菌、EM菌等生物制品来改良水质，平衡水体藻相菌相，减少氨氮、亚盐、硫化氢等有毒有害物质的产生和积累；同时加强改底，防止底质恶化产生有毒有害物质。
及时发现和杀灭水体中的寄生虫，可以防止草鱼因鳃部大量寄生而导致生理性缺氧，以保证肝胆生理功能的正常。合理消毒，减少使用对水体伤害较大，残留时间过长的药物。