摩尔多瓦一级行政区共37个，包含32个区，3个直辖市，1个自治区（加告兹），以及名义上属于摩尔多瓦的德涅斯特河沿岸地区。
一、直辖市
1.基希讷乌（罗马尼亚语：Chișinău；俄语：Кишинёв）是东欧国家摩尔多瓦的首都及最大城市，也是该国的工业与商业中心，坐落在柏柯河上。面积571.6平方公里，人口779,300人基希讷乌是摩尔多瓦经济最繁荣的城市以及最大的交通枢纽。
2.伯尔齐，又译伯尔兹（罗马尼亚语：Bălţi；俄语：Бельцы）是摩尔多瓦按人口计算的第三大城市（仅次于首都基希讷乌及蒂拉斯波尔）。面积78平方公里，人口127，600人。在经济重要性及面积方面排在第二位，仅次于基希讷乌。它是摩尔多瓦五个具有都市地位的城市之一。伯尔齐被誉为摩尔多瓦北部的“首都”，是北部最主要的城市，亦是北部的工业、文化中心及交通枢纽。城市位于基希讷乌以北127公里，位于鲁特河畔。
3.宾杰里（俄语：Бендеры），或译为本德尔（摩尔多瓦语：Бендер）、蒂吉纳（罗马尼亚语：Tighina），是摩尔多瓦德涅斯特河沿岸的城市，位于该国东部德涅斯特河右岸，宾杰里始建于1408年，面积97.29平方公里，人口93,751人。
二、区
4.新阿内尼区 （罗马尼亚语：Anenii Noi）是摩尔多瓦中部的一个区，面积892平方公里，首府新阿内尼。人口81,710人，当中大部分是摩尔多瓦人（84.2％），其次是乌克兰人（8.0％）、俄罗斯人（5.1％）、罗马尼亚人（1.0%）、保加利亚人（0.6％）和加告兹人（0.3%）。
5.巴萨拉贝亚斯卡区 （罗马尼亚语：Basarabeasca）是摩尔多瓦东南部的一个区，东邻乌克兰，面积294.5平方公里，首府巴萨拉贝亚斯卡。人口28,978人，当中大部分是摩尔多瓦人（69.8％），其次是俄罗斯人（8.9％）、加告兹人（7.7%）、乌克兰人（6.7％）和保加利亚人（5.3％）。
6.布里切尼区（罗马尼亚语：Raionul Briceni）是摩尔多瓦西北部的一个区，北邻乌克兰，南隔普鲁特河与罗马尼亚相望。面积741平方公里。人口78,027人，首府布里切尼。
7.卡胡尔区（罗马尼亚语：Raionul Cahul）是摩尔多瓦最南部的一个区，西、南邻罗马尼亚 （西临普鲁特河，南临多瑙河），东邻乌克兰。面积1,147平方公里。人口119,231人，首府卡胡尔。
8.坎泰米尔区 （罗马尼亚语：Raionul Cantemir）是摩尔多瓦西南部的一个区，西邻罗马尼亚，面积870平方公里，首府坎泰米尔。人口60,001人，，当中大部分是摩尔多瓦人（88.3％），其次是保加利亚人（6.2％）、乌克兰人（1.6％）、罗马尼亚人（1.5％）和俄罗斯（1.2％）。名字来源于罗马尼亚历史人物迪米特里耶·坎泰米尔（摩尔多瓦军事家、政治家、文学家，两次成为摩尔多瓦统治者，曾与俄罗斯沙皇国联手对抗奥斯曼帝国，战败后流亡俄罗斯。儿子安齐奥赫·康捷米尔是俄罗斯诗人。罗马尼亚迪米特里耶·坎泰米尔乡和迪米特里耶·坎泰米尔基督教大学及摩尔多瓦的坎泰米尔区以他的名字命名。）。
9.克勒拉希区（罗马尼亚语：Raionul Călăraşi）是摩尔多瓦的一个区。面积1,147平方公里。人口75,075人，首府克勒拉希。
10.克乌谢尼区（罗马尼亚语：Raionul Căuşeni）是摩尔多瓦东南部的一个区，东临德涅斯特河，南邻乌克兰。面积821平方公里。人口90,612人，首府克乌谢尼。
11.奇米什利亚区（罗马尼亚语：Raionul Cimişlia）是摩尔多瓦南部的一个区，东南邻乌克兰。面积803平方公里。人口60,925人，首府奇米什利亚。
12.克留莱尼区 （罗马尼亚语：Criuleni）是摩尔多瓦中部的一个区，东邻乌克兰，面积688平方公里，首府克留莱尼。人口72,254人，当中大部分是摩尔多瓦人（92.8％），其次是乌克兰人（3.7％）、罗马尼亚人（1.6％）和俄罗斯人（1.4％）。
13.栋杜谢尼区（罗马尼亚语：Raionul Donduşeni）是摩尔多瓦南部的一个区，东北隔德涅斯特河与乌克兰相望。面积892平方公里。人口46,442人，首府栋杜谢尼。
14.德罗基亚区（罗马尼亚语：Raionul Drochia）是摩尔多瓦北部的一个区。面积769平方公里。人口87,092人，首府德罗基亚。
15.杜伯萨里区（罗马尼亚语：Raionul Dubăsari）是摩尔多瓦东部的一个区，分为两个不相连的部分，北部有部分、南部完全位于德涅斯特河以东。面积309.2平方公里。人口34,015人，首府科切里。
16.埃迪内茨区（罗马尼亚语：Raionul Edineţ）是摩尔多瓦西北部的一个区，西隔普鲁特河与罗马尼亚相望。面积911平方公里。人口81,390人，首府埃迪内茨。
17.弗莱什蒂区（罗马尼亚语：Raionul Făleşti）是摩尔多瓦西部的一个区，西隔普鲁特河与罗马尼亚相望。面积1,143平方公里。人口90,320人，首府弗莱什蒂。
18.弗洛雷什蒂区（罗马尼亚语：Raionul Floreşti）是摩尔多瓦北部的一个区，东临德涅斯特河。面积790平方公里。人口89,389人，首府弗洛雷什蒂。
19.格洛代尼区（罗马尼亚语：Glodeni）是摩尔多瓦西北部的一个区，西邻罗马尼亚，面积754.1平方公里，首府格洛代尼。2004年人口60,975人，当中大部分是摩尔多瓦人（76.0％），其次是乌克兰人（19.5％）、俄罗斯人（2.8％）、保加利亚人（0.1％）和加告兹人（0.1%）。
20.亨切什蒂区（罗马尼亚语：Hînceşti）是摩尔多瓦西部的一个区，西邻罗马尼亚，面积1,483.4平方公里，首府亨切什蒂。人口119,762人，当中大部分是摩尔多瓦人（90.3％），其次是乌克兰人（5.2％）、罗马尼亚人（2.5%）、俄罗斯人（1.2％）、保加利亚人（0.2％）和加告兹人（0.1%）。