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德国鸢尾IgWRKY2基因,在Pb胁迫诱导下是如何响应的? 前言:土壤中的重金属具有不可降解性,重金属铅在低浓度时,会对

作者:初八没烦恼

德国鸢尾IgWRKY2基因,在Pb胁迫诱导下是如何响应的?

前言:土壤中的重金属具有不可降解性,重金属铅在低浓度时,会对植株的部分组织和功能造成破坏,进而对植株的生长发育、生化和分子水平造成影响,还可通过食物链的富集,直接或间接对人体造成危害,因此治理外界环境中铅污染问题十分重要。

德国鸢尾是鸢尾科鸢尾属多年生宿根花卉,观赏性好、抗逆性强,且对有毒气体有较强抗性,可作为工业区绿化植物。

WRKY转录因子作为植物体内广泛存在的DNA结合蛋白,不仅在植物的生长发育过程中起到重要作用,也参与调控了植物抵抗生物及非生物逆境胁迫的过程。

酸枣有55个ZjWRKY基因的表达量在高温胁迫下发生变化,棉花的GhWRKY4和GhWRKY5基因参与干旱和盐胁迫等逆境响应,中间锦鸡儿的CiWRKY75-1基因降低了植物在干旱胁迫下的耐受性。

本文以德国鸢尾“樱花园”叶片的cDNA为模板进行PCR扩增,经琼脂糖凝胶电泳检测,得到扩增片段长度约为570bp。

测序结果表明,与转录组测序序列完全一致,对扩增出的IgWRKY2基因的CDS序列进行开放阅读框分析,IgWRKY2具有的完整开放阅读框最大为534bp,编码117个氨基酸,在氨基酸序列41处发现WRKY家族特有序列WRKYGQK序列。

利用EXPASY在线软件分析表明,IgWRKY2基因编码蛋白的分子式为C579H882N172O186S3,理论相对分子质量为13324.59Da,理论等电点为6.42。

该蛋白中脯氨酸(Pro)和丝氨酸(Ser)数目最多,带负电荷的残基(Asp+Glu)总和为17个,带正电荷的残基(Arg+Lys)总和为15个,不稳定参数为46.32大于40,为不稳定蛋白。

蛋白的脂溶指数为47.88,亲水性平均值为-1.239,是亲水性蛋白,亚细胞定位预测表明,IgWRKY2定位在细胞核,跨膜结构预测表明,IgWRKY2不具有跨膜结构,为细胞膜外蛋白。

二级蛋白结构预测结果表明,IgWRKY2由5.93%的α-螺旋、6.78%的β-转角、15.25%的延伸链以及72.03%的无规则卷曲构成,BLAST比对分析结果则表明IgWRKY2与油棕的EgWRKY2、海枣的PdWRKY2等11种植物蛋白同源性较高。

将德国鸢尾IgWRKY2编码的氨基酸序列与筛选出的11种氨基酸序列进行同源比对,结果表明,与海枣的PdWRKY2和油棕的EgWRKY2基因序列的序列相似度较高,基因序列一致性最低的为欧基尼奥伊德斯种咖啡的CeWRKY2。

来自于这些植物的基因均与IgWRKY2结构相似,均含有一段WRKY结构域,进一步说明了IgWRKY2基因属于WRKY转录因子家族的一员。

通过NCBI下载其他植物的蛋白序列,利用软件MEGAX将德国鸢尾IgWRKY2与其余22种蛋白序列构建系统发育树,结果表明IgWRKY2与牵牛的InWRKY2、三裂叶薯的ItWRKY2和绒毛状烟草的NtWRKY2为同一分支,亲缘关系较近。

为了研究德国鸢尾IgWRKY2基因在Pb胁迫下的表达情况,将植物材料置于Pb2+溶液中胁迫0h、6h、12h、24h和48h,于不同胁迫时间点取叶片和根茎组织部位提取RNA,反转录后进行实时荧光定量PCR分析。

结果显示IgWRKY2基因在“樱花园”的根茎和叶片中都有表达,在根茎组织的表达量变化比叶片组织明显。

叶片组织受到胁迫时,与对照相比,IgWRKY2基因在6h表达量最高,为对照的1.42倍,12h表达量开始降低,24h出现短暂上升但表达量仍低于对照值,说明该基因在后续表达中受到抑制。

根茎组织受到胁迫时,IgWRKY2基因的表达量呈现出先下降后上升的变化趋势,说明IgWRKY2基因在根茎组织较叶片组织的响应程度更高。

在Pb胁迫下,IgWRKY2基因在叶片和根茎中都有不同程度的响应,其中根茎组织的响应较为明显,推测在受到Pb胁迫时,根茎响应Pb的能力要强于叶片。

结论:

德国鸢尾IgWRKY2基因受Pb胁迫诱导表达,且在根茎中表达量变化较叶片组织中的表达量变化更为明显,这可能与根茎是直接接触胁迫环境的部位有关,说明该基因在植物抵抗重金属胁迫过程中起到了一定的调节作用,但具体的调控机制有待进一步的研究。

德国鸢尾IgWRKY2基因,在Pb胁迫诱导下是如何响应的? 前言:土壤中的重金属具有不可降解性,重金属铅在低浓度时,会对
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