崇德八年（1643年）八月十四日拂晓时分，更部启心郎索尼偕同巴牙喇蠹章京图赖、巴图鲁鳌拜率两黄旗大臣聚集在大清门外，索尼对大家说：现在大行皇帝归天，皇室无主，为了大清的江山千秋万代，遵循祖制，我们要拥立皇子为后续之人。说完，他举起右手带领众人对天发誓："吾属食于帝，衣于帝，养育之恩与天同大，若不立帝之子，则宁死从帝于地下而已！"接着，他下令两黄旗巴牙喇兵（护军）,"张弓挟矢，环立宫殿"，其势极为雄壮威严，以示两黄旗人志不可移。这就是索尼为表示拥立皇子继位的决心而导演并参与的对确立帝位产生极大影响的盟誓行动。
索尼为什么要这样做呢？事出有因。
索尼是在后金建国初期，随父亲硕色由哈达部归附努尔哈赤的。由于他的父亲和伯父希福均通晓满、蒙、汉三种文字，努尔哈赤授予他"巴克什"称号（即先生、大儒），管理文案事，因此，索尼也被授予一等侍卫扈从于努尔哈赤左右。他对努尔哈赤十分忠诚，努尔哈赤也十分信任他。
天命四年（1619年），哈达部侵犯界藩城，索尼身先士卒，挥刀力战，击退来兵。后随太祖征栋揆，蒙古派大批援兵，助栋揆，扎下二寨，与栋揆成犄角之势，力抗后金。索尼与诸将合作，集中兵力先攻一个寨，结果寨破，另一寨的将士也全部投降。天聪元年（1627年），索尼随太宗攻锦州。正遇明军千余人迁徙大凌河民户，索尼仅率骑兵20人，奇击明军，他立马横刀，孤军奋战，斩获许多明军，保护了大凌河。
天聪二年（1628年），太宗准备远征喀尔喀蒙古，向外藩征兵时，其他部落纷纷响应，惟有科尔沁部奥巴迟迟不出兵，使皇太极十分恼火。他派索尼偕同侍卫阿珠枯带着他的谕令前往科尔沁，饬责土谢图额附奥巴。当初，奥巴是蒙古科尔沁部的台吉，归附太祖时，太祖把舒尔哈齐的孙女嫁给了他，目的是为了笼络他。不久，他多次违背会约，与明朝暗中来往。这次太宗向他征兵，他又迟迟不动，于是，索尼奉命前去宣谕天聪汗的赦谕。当他来到科尔沁部，奥巴因患脚病，没有马上来见他，命其部人送来牛羊肉款待他，索尼严辞拒绝，说："你们的汗有异心，你们的东西我怎么能吃呢？拿走！"说完就去晋见公主。部人将这个情况告诉了奥巴，奥巴在侍从的扶待下，也来到公主处，一进门，装作不知其事的样子，故意问公主："此人是谁？"索尼昂首大声回答："我们都是天朝汗的使者。你屡屡背约，本是有罪之人，按说应当与你绝交，只是因为公主在这里，我们才牵命来问候。"此时的奥巴正在后金和明之间选择靠山，主意未定，见索尼态度如此强硬，如果自己再犹豫下去，恐怕给部落带来灾祸。于是连忙吩咐左右设宴款待，索尼率阿朱枯等不屑一顾，拂袖而出。奥巴心中既没底又害怕，不知索尼一行此来为何，便派台吉塞冷询问索尼。索尼拿出谕旨，交给塞冷，谕旨皆为斥责奥巴之语，然后，索尼不等奥巴回音，便欲率随从先行回朝。奥巴看了谕旨，惊恐万分，命众人出帐挽留，索尼不从，众人皆哭泣，边哭边说："我汗要带罪亲自入朝去道歉！"这时有些人跪下叩首，有些人则拉住索尼马缰绳，极力挽留，索尼才勉强留下。第二天，奥巴又以患脚病为理由，令台吉拜恩噶尔和桑噶尔寨同索尼一起人朝谢罪。索尼见奥巴仍没有诚意，便气愤地说："你想解脱自己的罪过，而让他二人同我一块走，我岂是为取拜恩噶尔等而来的？"奥巴又派人去探索尼的底："如果汗饶恕我，我自然应诚恳谢罪，就怕汗王不容我而且赶我走。"索尼晓以大义，劝他说："皇上心胸广阔如天地，你如果认罪人朝晋见，必然得到同情和宽恕。"索尼这番活，使奥巴打消了顾虑，连连向索尼叩首致谢，决定亲自入朝。索尼见其诚心悔罪，便同阿珠枯偕其大臣党阿赖先行回朝奏明皇太极。此行，索尼圆满地完成了任务，使科尔沁重新归附了后金。
天聪三年（1629年），索尼随太宗再次伐明。此次是袭扰京畿地区。当后金大军兵临北京城下时，明督师袁崇焕率部赴援，在京城东南双方对阵。起初贝勒豪格先冲入敌阵，明军一拥而上，将其包围。矢石如雨，豪格的处境十分危险。索尼见此情景，舍生忘死，策马冲入阵地，东拼西杀，挥刀如飞，斩杀敌人无数，终于杀出一条血路救豪格突出重围。第二年，又参加了收榛子镇，抚沙河驿，克永平的战斗，每到一处，他便以汉语遍喻军民，军民心悦诚服，皆归顺。这年七月，他被选任吏部启心郎。
天聪五年（1631年）八月，随皇太极围大凌河。九月中旬，东巡抚邱禾嘉等率兵7000自锦州出援大凌河，行至小凌河岸，与主动出击堵截明援军的后金兵遭遇，索尼持短刀步战，仍然把明军杀得大败。第二年，又随皇太极征察哈尔，由大同入明边，夺取了阜台寨。天聪八年（1634年），皇太极以索尼任吏部启心郎事毫无过失，授与他骑都尉世职。日直内院。崇德八年（1643年）考绩，进三等甲喇章京（参领）。
崇德八年八月九日，皇太极暴崩于清宁宫，没有来得及安排后事，包括继位之事，在诸王之间展开了争夺皇位的斗争。
清初，皇位继承制度尚不健全，没有明文规定前朝皇帝死后，由谁来位，因此引起王的争也是必然的。势力位居诸王之首的睿亲王多尔衮对皇位觊觎已久，当然不能放过这个机会，皇子豪格地位显赫（身为肃亲王），能力出众，他以"父死子继"为据，同样要夺取皇位。
八月十四日，多尔衮按照八旗的惯例，就继承一事，首先征求皇太极所属两黄旗诸王与大臣的意见。他在三官庙特召索尼（满洲正黄旗）商议册立事。索尼果断地说："先帝有皇子在，必立其一，他非所知也。"索尼说完，见多尔衮并没有赞同的意思，知其想自立为帝，于是，索尼于当天晚上演出了我们前面所提到的一幕，誓死为捍卫皇子的继承权而斗争。他之所以这样做，实出于对大清的忠诚，也是受了传统观念的影响。
正由于这个原因，此后的几年里他受到了握有实权的摄政王多尔衮的排挤。
世祖继位时，索尼会同谭泰、图赖、巩阿岱、锡翰、鄂拜在三官庙结盟、誓辅幼主，六人为一体。但随着多尔衮擅权揽政，势力日益膨胀后、谭泰、巩阿岱、锡翰皆违背盟约，依附于多尔衮，对索尼不依附他很不满意。
顺治二年（1645年），索尼进二等昂邦章京（都统），多尔衮认为，索尼既然任都统了，就不应任文官，因此解索尼的启心郎职，但仍管理吏部事。
李自成败走前、放火烧了宫殿，朝议修建宫殿，但此时多尔衮也在营造自己的府第，招工备料，工部给造王府的工钱比较高，结果工匠们纷纷去王府工地干活，影响宫殿的工期。有个叫佟机的人对多尔衮提出异议，多尔衮大怒，要杀了佟机，索尼极力为其辩护，认为此人无罪，因此，多尔衮更加恨索尼。
英亲王阿济格轻慢皇上，视皇上为八岁小儿。索尼把此事告诉多尔衮请治阿济格的罪，多尔衮却没有答应。多尔衮曾召集诸大臣议分封诸王的事，索尼认为不可，巩阿岱、锡翰等向多尔衮进谗言，说："索尼这不是不让你平定天下吗？"请治索尼的罪，多尔衮也没有允许。索尼告发都统谭泰隐匿诏旨，谭泰因此被削去公爵。有一个人向索尼要古琴，索尼从库内取了一把漆琴给了他。索尼还曾令其仆从在禁门桥下捕鱼，另外，见库院内的草长高了，便让牧者把马放进去吃草。这本来都是些无足轻重的小事，谭泰为报私仇，便胪状弹劾索尼，结果多尔衮命将其下法司查问，因此削去索尼的世职，永不叙用。
顺治三年（1646年）正月，图赖弹劾谭泰，涉及到索尼。图赖谭泰由于后到，没有战功，到大军南下时，谭泰顾虑不想参与，并告诉图赖，一副非常不满意的样子。图赖说，他让人把此书送给索尼，让索尼向多尔衮报告，但索尼并没有报告。把捎书的人找来问时，此人却无中生有，说："我把书交给索尼时，索尼嘱咐我不要声张。"诸大臣议索尼此罪当斩。多尔衮亲自审问索尼，索尼感到非常奇怪，他说："以前我告发谭泰擅隐谕旨罪，现在我还能藏图赖的书而包庇谭泰吗？"大臣们又一次讯问捎书人，才知是佐领希思汉怕谭泰获罪，将书扔到河里了。真相大白，索尼遂昭雪。不久被授为二等子爵。
索尼始终不依附于多尔衮，在政事上还常常与多尔衮争论，多尔衮因此怀恨在心。顺治五年（1648年），贝子屯齐等诬告索尼于崇德八年与图赖等谋立肃亲王，私结盟誓之事，因此，议他为死罪。顺治下旨，免其死罪。多尔衮却坚持革去他所有的职务，籍没家产，遣其去守昭陵。
三年后，顺治亲政。念索尼对皇帝忠心耿耿，不畏权势，刚正不阿，以前议索尼罪不实为由，召其还京，复世职。此后，逐渐进至一等伯，世袭，晋升内大臣，兼议政大臣，总管内务府。
索尼复职后，顺治帝对他十分的宠信。十七年（1660年），下诏，命索尼上书，详言政事。索尼应召，就时弊胪列十一条，上书与顺治，顺治认为所举皆为实事，应予以申禁，命照此施行。
顺治十八年（1661年），顺治帝病逝，遗诏以玄烨继位，是为康熙皇帝，命索尼、苏克萨哈、遏必隆、鳌拜为辅政四大臣，索尼列首辅，地位在诸王之上。顺治以外姓四大臣辅政，是鉴于顺治初年多尔衮辅政危及皇权之教训。然而，索尼生怕引起诸王的不满，在宣布遗诏时，他立即跪下，请求诸王贝勒与他们共任国政。诸王贝勒都说："大行皇帝深知你四大臣，所以委以重任，谁敢干预呢？"随后，索尼率辅臣在大行皇帝灵前盟誓："先皇不以索尼、苏克萨哈、遏必隆、鳌拜等为庸劣，遗诏寄托，保诩冲主。索尼等誓协忠诚，共生死，辅佐政务。不私亲戚，不计怨仇，不听旁人及兄弟子侄教唆之言，不求无义之富贵，不私往来诸王贝勒等府受其馈遣，不结党羽，不受贿赂，惟以忠心仰报先皇大恩。若各为身谋，有违斯誓，上天顾罚，夺算凶诛。"
辅政不久，居功自傲的鳖拜便把誓言均忘在脑后，他轻视索尼，拉拢遏必隆，排斥苏克萨哈，结党营私，极力想占首辅之位。索尼因年老多病，力不从心，经常对鳌拜的专横跋扈持谨慎和回避态度，结果鳌拜的态度日渐嚣张，竟然在上朝时不顾秩序赶在索尼前面行走。
康熙四年（1665年），孝庄太皇太后为了笼络首辅索尼，使之更好的发挥首辅的威望和作用，遏制鳌拜，特降懿旨册立其孙女赫舍里氏为皇后，当年便举行了康熙皇帝的大婚礼，奉迎皇后人宫。果然在两年后，索尼为了维护康熙皇帝的皇位和出自对大清王朝的忠诚，于六年正月，为了遏制鳌拜的野心和出于对目前局面的忧虑，索尼于康熙六年正月首先提出，并与诸大臣共同奏请皇帝亲政。四月，上谕表彰他的功绩："辅政大臣伯索尼，太祖高皇帝时龟勉效力，太宗文皇帝任以内外大事，悉能果断，殚厥忠诚。世祖章皇帝时亦任以内外大事，竭忠纯笃。以其勋旧忠贞，堪受重托，遗诏俾令辅政，恪遵顾命，夙夜靖共，厥绩茂焉！今既染疴，且复年迈，宜特加恩宠，以示酬庸之典。"晋一等公，与前所授一等伯并世袭。索尼虽辞，下旨不允。康熙皇帝亲政，索尼病逝。
索尼侍奉太祖、太宗、世祖三帝，可谓"三朝元老"。生前得到许多荣耀，死后亦荫及后代。其五子心裕袭一等伯，六子法保袭一等公，授内大臣之职。其长子噶布喇（孝诚仁皇后的父亲）任领侍卫内大臣，三子索额图官至大学士，领侍卫内大臣。