最近土耳其向埃及频频示好，表示将尽快将两国的关系升级为大使级外交关系。不过埃及外交部长萨梅赫舒克里的言辞略显不那么热情，称这将在“适当的时候”发生，这取决于“它带来的积极结果”。两国之间围绕着利比亚、东地中海和伊斯兰教政治等方面分歧较大。
利比亚问题仍然是潜在的土埃和解的挑战。东部军阀哈夫塔尔最近声称他的部队比利比亚政府部队更强大。这被视为一种含蓄的升级威胁。土耳其支持的民族团结政府军与埃及支持的哈夫塔尔国民军利比亚再次爆发冲突的风险持续存在。
东地中海仍然是一个紧张的地区，围绕着海底天然气开发和专属经济区的划定，两国矛盾颇深。埃及摆了一手，继续深化与希腊和塞浦路斯的安全关系，这导致土耳其被排除在东地中海天然气论坛之外。由此可能导致未来的紧张局势。
两国在非洲也有摩擦。土耳其与埃塞俄比亚的亲密关系，其中包括一项于 2022 年 12 月提交议会批准的军事协议，这对于恢复两国关系是一个关键障碍。埃及和土耳其也继续争夺在萨赫勒和东非的影响力。对于埃及而言，这些区域是不能坐视土耳其进行影响力扩张的。
两国关系的第四个障碍则是宗教政治问题。埃及是一个相对世俗化的军人专制国家。以穆斯林兄弟会为代表宗教政治势力一直被压制着。土耳其则一直是穆斯林兄弟会的坚定支持者，埃尔多安对于埃及打压国内的穆兄会势力十分不满。这其实也是两国关系恶化的最主要原因。
综上所述，虽然土耳其想要改善两国关系，但是双方之间的矛盾非常深，而且还不仅仅是两国之间的问题，涉及中东两股对立的势力，甚至涉及到伊斯兰世界的话语权。所以在短期内几乎无法缓和。不过最近两国外长之间的会晤，也算是一个良好的开端。