《雍正王朝》中，当皇四子胤禛成为九子夺嫡的最后赢家而坐上帝位之后，是皇三子胤祉第一个向雍正帝下跪行礼，此举意义重大，这表示康熙帝儿子中最年长的一个（被圈进的皇长子和皇次子不算进来）率先承认了雍正帝，对于雍正帝控制当时的局面做出了不小的贡献，随着胤祉的臣服，底下的皇子们也纷纷表示了臣服。
基于此，胤祉得了一个“御前免跪”的恩赐，并得了善终，但这只是《雍正王朝》中的胤祉，实际上，历史上的胤祉并没有得什么善终，他的结局实在算不上好，雍正帝一继位，就对这个哥哥出手了，丝毫没有顾及什么亲情。
说到底，所谓的兄友弟恭在皇家基本就是不存在的，一旦沾染权力，全身而退基本是不可能的，即便没有染指那个位子，单就其身份来看，也很难全身而退。
九子夺嫡中，皇三子胤祉是相对来说最为良善的存在，他向来低调，但因为皇三子的身份，很多事情不可能绕过他，就比如这九子夺嫡，对太子之位没有企图心的胤祉偏偏就被卷了进来，且再也无法置身事外。
就康熙长大成人的24个皇子来说，胤祉排行第三，素来被称为皇三子，在他之上还有康熙的庶长子，也就是皇长子胤禛，其次就是康熙的嫡长子，也就是皇次子胤。胤礽两岁的时候就被康熙帝立为太子，这足以见得康熙对这个儿子的喜爱和看重。
之后，康熙就开始培养这个未来的接班人，在康熙的培养下，胤礽也确实是各方面都很优秀，完全符合一个合格储君的所作所为。
然后在胤礽三十五岁的时候，这对父子却不可避免产生了极深的矛盾，这种矛盾虽然是外人引起的，但未必不是存在于两人之间的矛盾，即康熙正春秋鼎盛，而皇太子胤礽年富力强，这样的矛盾在历史上酿成悲剧的例子比比皆是，自然到他们这里也好不到哪里去。
在处死索额图一事上，胤礽似乎性情大变，他种种异于往常的表现让康熙很是不满，康熙认为胤礽这是染了狂疾被鬼物给控制了，然后就将胤礽给废了。
这次废太子是清朝历史上的一件大事，原本皇长子胤禔就不服气胤礽做太子，于是提议让皇八子胤禩做太子，而其他的皇子也纷纷进场，于是大家明里暗里开始将目光盯上了太子之位，就有了著名的九子夺嫡。
原本对太子之位并没有什么兴趣的皇三子胤祉也被牵扯进来，他之所以进来是因为向来和胤礽的感情好，因此他在胤礽被废这件事上站了出来，帮胤礽找到了幕后的黑手，原来是皇长子胤禔私底下魇镇太子，他将这件事告诉了康熙帝，而康熙帝也在调查清楚之后选择将胤礽重新立为太子。
虽然胤礽再次成为太子，但很多东西已经变了样，皇帝和太子之间的不信任、亲王和太子之间的争斗都在加剧，因此胤礽被复立太子不久就再次被废，有意思的是，这次胤礽被废，似乎再也没有什么人站出来为太子说话。
所有的人都看得很清楚，是真的与那个位置无缘了，而各个皇子就开始使出浑身解数来争夺太子之位。当初在胤礽第一次被废后，除了胤祉站出来查出真相，还有胤禛站出来为胤礽说好话。在某种意义上来说，胤祉和胤禛在九子夺嫡中的表现很相似。
两人都表现得对太子之位没什么兴趣，都对胤礽有很大的善意，都很低调，也都在迎合康熙帝。但胤禛更多的是在积蓄力量，而胤祉是真的对那个位子不感兴趣，只不过这种不感兴趣在胤禛看来就是和他的目的一样。
在和胤礽都被圈进之后，康熙帝的儿子中已经没有嫡子来做太子，那么庶子按照年龄来排序的话，胤祉是最有资格做太子的，他的能力更是很匹配太子这个位置的，因此即便九子夺嫡在后来分为两个阵营，即四爷党和八爷党，而胤祉置身事外，但胤禛从来没有忽视胤祉，他始终觉得胤祉是他的一个巨大的阻碍。
胤祉当时也很得康熙帝的看重，但他除了完成自己的本职工作之外，最喜欢做的事情并不是和皇子们争斗，而是醉心于编书，当大家斗得如火如荼的时候，胤祉主持编纂了《律历渊源》和《古今图书集成》两部著作，也因此，胤祉被称为一名科学家。
就各方面的学识来说，胤祉是康熙帝儿子中最为优秀的儿子之一，也因此，胤禛一直将胤祉视为政敌。
即便胤祉在胤礽第二次被废之后就不再参与夺嫡之争，但并不代表别人就能允许他置身之外，毕竟他皇三子的身份就摆在那里，老大和老二被圈进，他就是最大的一个了，这样的一个人选择置身之外是不可能的，也不可能有人相信他没有丝毫的野心。
在胤禛看来，只要不是站在他这一边，支持他，那就是和他对着干，况且对方还是如此优秀的他的哥哥，自然更加不一样，因此，雍正继位后，胤祉虽然没有反对他，也没有和他为敌过，但还是被他安排到去为康熙守陵，这是胤祉灾难的开始。
一年之后，其嫡长子宏晟被削去了世子之位。又过了四年，胤祉向苏克济索要贿赂，被告到了雍正面前，然后被夺了爵位，又被囚禁在自己的府里，而他的儿子宏晟则被宗人府囚禁。之后他曾又被封为亲王。
但两年后，也就是1730年，这一年胤祥去世，雍正帝哀痛万分，而胤祉因为迟到了胤祥的葬礼且在葬礼上毫无悲戚之色，然后再次被雍正帝给夺了爵位，并幽禁在景山永安亭，直到他1732年去世，中间不曾有过自由。
可以说，康熙去世之后，胤祉就再也没有了自由之身，要么是在守陵，要么被圈禁在家中，要么被幽禁在永安亭，而发生在胤祉身上的这些事，偏偏雍正每次都能找到理由对他进行处罚，胤祉也只能发发牢骚，别的什么也做不了。
毕竟他的其他弟弟们也没有好到哪里去，雍正在这一点上确实是薄情寡义的很，但也正是因为这份薄情寡义，雍正帝一朝才没有出现内乱，造成什么动荡。