（一）阿笠博士
新一變小後求助阿笠博士，得知新一身份後，幫他發明了許多裝備，助他破案。
（二）工藤夫婦【新一父母 / 優作·有希子】
從國外回來後，通過阿笠博士得知新一變小的事情。
（三）宮野明美
臨死前，柯南親口承認了自己的真實身份。
（四）灰原哀【宮野志保】
“APTX4869”主要發明者，兩次調查新一的家，發現新一國小的衣服不見了，最後得知變小的工藤新一就是柯南，之後也一直幫助柯南破案。
（五）服部平次
在一次事件中，柯南不小心用麻醉槍射中了服部，裝睡聽到了柯南的推理，最後逼柯南承認自己的真實身份。
（六）怪盜基德
假扮白鳥警官時，看見柯南在給阿笠博士打電話調查事件，推理出柯南就是工藤新一。
（七）貝爾摩德
在貝姐寄給柯南的信得知，封面寫着工藤新一，開頭寫着工藤柯南，由此得知貝姐知道柯南的真實身份【主線劇場都沒有具體說明，柯南推測的依據是貝姐是自己母親的朋友她可能見過新一小時候的照片】。
（八）本堂瑛祐
瑛祐當着柯南的面說喜歡小蘭，加上之前的調查他懷疑柯南就是新一，最後用“激将法”令柯南承認自己的真實身份。
（九）澤田弘樹
通過“繭”的體驗遊戲裝置，諾亞方舟讀取了柯南腦中的資訊，進而得知了柯南的真實身份。
（十）赤井秀一【沖矢昴】
一次事件中，被沖矢昴看到柯南用變聲器變成新一的聲音跟小蘭說話，由此得知秀一也知道了柯南的真實身份。
（十一）世良真純、赤井瑪麗【世良、秀一、秀吉的母親】
十年前她們在沙灘上見過小時候的新一，通過“我是福爾摩斯的弟子”這句話，由此推斷出柯南跟自己的母親一樣都變小了，進而得知柯南真實身份。
（十二）魯邦三世、峰不二子、次元大介、石川五右衛門
通過調查得知柯南身份。
（十三）阿郎史密斯
臨死前，柯南向他承認了自己的真實身份。
（十四）伊東末彥
通過指紋知道柯南就是工藤新一，因為他雙目失明也不能說是完全知道。
（十五）愛爾蘭
通過對比指紋，知道柯南就是工藤新一，最後為救柯南而死。
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