在中性條件下，氯溶解在水中産生次氯酸（HClO），溶液顯示酸度，在堿性條件下，氯氣溶解在水中産生次氯酸根離子（ClO-）。
細胞膜表面帶負電荷，是以次氯酸根（ClO-，也帶負電荷）不容易進入細胞，而次氯酸（HClO）是穿透細胞膜的中性小分子，進入細胞内部，并與其内部DNA和線粒體反應死亡。這也部分解釋了為什麼在氯同樣有效的情況下，次氯酸（HClO）比次氯酸鈉（NaClO）更殺菌。
次氯酸的氧化，就像子彈已經上膛的機槍一樣，可以随時發射，很快子彈就消失了。為了克服次氯酸易降解的問題，最早研制的次氯酸鹽作為消毒水，以漂白劑為代表，已成為市場上重要的消毒劑之一，但漂白酸的堿度往往在pH11、12之間，堿性太容易損傷皮膚，殘留量非常高， 更适合用于成分的消毒。後來，由于電解技術的改進，利用電解次氯酸實作了目前的做法，解決了次氯酸的最大弱點——易降解，是以發展出弱酸次氯酸水。雖然次氯酸的濃度遠低于次氯酸根，但其降解速度的問題仍然過快，即使使用封閉的避光容器，總遊離氯含量往往不到半個月。
次氯酸微酸是次氯酸易降解的最佳溶液，要密封擋光容器，往往半年時間其總遊離氯含量隻降解一半，最重要的是使用消毒濃度等酸性次氯酸溶液的濃度不高多少。這是因為我們隐藏了可生物降解的次氯酸，使其不會立即産生氧化還原反應，當細菌消耗次氯酸時，我們将次氯酸根轉化為次氯酸，進而使循環既能保持良好的消毒效果，又能保持儲存效果。
親水性病毒主要包括甲型肝炎、手足口病、脊髓灰質炎等病原菌;
促脂病毒主要包括丙型肝炎、人類免疫缺陷病毒（AIDS）等病原體;
