伏羲氏、神農氏的功德對孔子思想的形成也有巨大影響。
一、孔子在《周易》中對伏羲氏（包羲氏）的推崇
大家知道，孔子教授《易經》，《易經》也是儒家經典書籍之一。孔子五十歲左右開始研究《周易》，以至于“韋編三絕”。孔子在研究過程中，為《周易》增加了彖辭、象辭、文言、系辭、說卦、序卦、雜卦，計七項十篇文章，稱之為“十翼”，即十項解說和說明，使《周易》更加完善和豐富，這是孔子研究周易的巨大成果。
《易經》在夏朝有《連山易》，在商朝有《歸藏易》，在周朝有《周易》。據傳說，八卦、易經為伏羲氏所創，神農氏、黃帝進行了創新 ，《周易》是周文王所整理。
伏羲氏畫像圖檔
孔子在十翼中是怎樣評價伏羲氏的呢？
《易經·系辭下傳》說：
“ 古者包羲氏之王天下也，仰則觀象於天，俯則觀法於地，觀鳥獸之文，與地之宜，近取 諸身，遠取諸物，於是始作八卦，以通神明之德，以類萬物之情。作結繩而為網罟，以佃以漁，蓋取諸離。”
《離卦》象征着：利于堅守正道，這樣必然亨通；畜養柔順的母牛，可以獲得吉祥。
離卦示意圖檔
孔子《彖傳》說：“離，麗也;日月麗乎天，百谷草木麗乎土，重明以麗乎正，乃化成天下。柔麗乎中正，故亨，是以畜牝牛吉也。”
孔子《象辭》說：“明兩作，離；大人以繼明照于四方。”
離卦可解釋為：《離卦》的卦象為離(火)下、離(火)上，為光明接連升起之表象。《離卦》的本象為火，這裡代表太陽。太陽東升西落，因而有上下充滿光明的形象。太陽的光明連續照耀，必須高懸依附在天空才行，是以象征附着；聖人效法這一現象，也應當連綿不斷地用太陽般的光明美德普照四方。
伏羲氏首創八卦文明，就像是用連綿不斷的太陽般的光明美德普照四方，使萬民受益，這就是伏羲氏的聖德和為人民建立的功德。
二、孔子在《周易》中對神農氏的推崇
《易經·系辭下傳》第二章說：
“包羲氏沒，神農氏作，斫木為耜，揉木為耒，耒耨之利，以教天下，蓋取諸益。”
也就是說，神農氏的功德，是按照益卦來做的。（當然，也有可能神農氏的功德與益卦相似，孔子就把神農氏歸結到益卦中來）。
益卦示意圖檔
《益卦》下震，上巽。孔子在《象辭》說：風雷，益；君子以見善則遷，有過則改。《彖傳》說：益，損上益下，民說無疆，自上下下，其道大光。“利有攸往”，中正有慶。
《益卦》的整體意思是說：
巽為風；震為雷。風雷激蕩，其勢愈強，雷愈響，風雷相助互長，交相助益，相得益彰之表象，象征“增益”的意思。從中得到的啟示就是：君子看到良好的行為就馬上向它看齊，有了過錯就馬上改正，不斷增強自身的美好品德。君主損上益下，減輕群眾負擔，解救群眾困苦，為民服務，群眾就會非常歡喜，就會上下齊心，同心同德，就能戰勝一切艱難險阻；君上謙卑，深入民間，體察民意，那麼他的道義就會廣庇四方。
神農氏畫像圖檔
神農氏發明農具，教民種植百谷，解民饑渴。還傳說神農氏嘗百草，一日遇七十二毒，最終發明了中草藥，從此群眾可以用中草藥醫治疾病，減少痛苦。神農氏的這種舍己為民的品德及其豐功偉績，不正是對《益卦》很好的诠釋嗎？
孔子對故聖賢帝王推崇備至，七千言的“十翼”，“聖人”一詞就出現了29次。在《禮記·禮運》中，孔子還把夏禹之前的伏羲時代、神農氏時代、黃帝時代等稱作大道之行，天下為公的時代。
三、大道既隐，退而求其次——以仁為核心，以禮、義為法則
孔子認為，雖然夏禹以後的時代，大道既隐，天下為家，各親其親，各子其子，貨力為己，但是，把禮義作為處事法則，以便擺正君臣關系，使父子關系純厚，使兄弟關系和睦，使夫妻關系和諧，使事務各有規章制度可循，還是很有必要的。夏禹、商湯、周文王、周武王、周成王、周公旦，就是講究禮義的傑出人物。他們把仁愛定為法式，提倡禮讓；以禮義訓示人們要遵循既定的規則。如果有不遵循禮義的人，當官的就會被罷免，老百姓就可以把這(不按“禮”行事)當作禍害。這可以稱為小康社會。（詳見《禮記禮運》）
由此可見，孔子認為時過境遷，大道既隐，大同社會已成過去，但是把古聖王伏羲氏、神農氏等的損上益下，解民倒懸，如陽光一樣普照四方，給群眾溫暖的美德凝聚為一個“仁”字而繼承下來，形成一個以“仁政”為思想核心，以禮義為法則的有條理的小康社會，也是不錯的選擇。
是以，孔子才非常重視仁義、道德和禮義，并歸結為仁、義、禮、智、信等行為規範。