發酵時間：45-60天
優質有機肥堆肥的發酵過程一般需要45-60天。這是因為在堆肥前的升溫階段和高溫階段，它會殺死病原病原體、蟲卵、雜草種子等有害微生物，但微生物在這個過程中的主要作用是新陳代謝和繁殖，隻産生少量的代謝物，這些代謝物不穩定，不易被植物吸收。在後期的冷卻期，微生物将經曆有機物的腐殖化，并在此過程中産生大量有利于植物生長和吸收的代謝物，這一過程需要45-60天。
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堆肥通過這個過程可以達到三個目的，一個是無害的;另一個是羞辱;第三是産生大量的微生物代謝物，如各種抗生素、蛋白質等。
發燒階段→高溫階段→冷卻階段→分解保溫階段
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有機堆肥的發酵過程可以簡單地分為以下四個階段
發熱期
在堆肥生産的早期階段，堆肥中的微生物主要是中溫和良好的氣質，最常見的是非孢子囊菌和黴菌。它們開始堆肥的發酵過程，在良好的氣體條件下分解和分解有機物（如單糖，澱粉，蛋白質等），産生大量熱量，并不斷提高堆肥溫度，從約20°C上升到40°C，稱為發燒階段，或中溫階段。
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高溫級
随着溫度的升高，熱微生物逐漸取代媒體溫度型并起主導作用，并且溫度繼續上升，一般在幾天内達到50°C以上，進入高溫階段。
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在高溫階段，良好的熱釋放細菌和良好的熱真菌成為主要物種。它們在堆肥中強力分解複合有機物（如纖維素、半纖維素、果膠物質等），積熱，堆肥溫度升至60-70°C，甚至高達80°C。
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随後，大多數熱微生物也大量死亡或進入休眠狀态（超過20天），這對加速堆肥的分解非常重要。堆肥不當堆肥隻有很短的高溫期，或者根本沒有達到高溫，是以分解很慢，半年或更長時間内無法達到半分解狀态。
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當高溫階段持續一段時間時，大部分纖維素、半纖維素和果膠物質已經分解，留下難以分解的複雜成分（如木質素）和新形成的腐殖質，微生物的活性減弱，溫度逐漸降低。當溫度降至40°C以下時，中溫微生物成為優勢物種。
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如果冷卻階段來得較早，則表明堆垛條件不理想，植物物質的分解不足。此時，可以翻轉堆放，将堆放好的物料混合均勻，産生第二次加熱，促進堆肥的分解。
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堆肥分解後，體積減小，堆垛溫度下降到略高于溫度，然後應将堆肥緊壓緊，造成厭氧狀态，使有機物的礦化減弱，有利于肥料儲存。
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堆肥實際上是廢物穩定的一種形式，但它需要特殊的濕度，通風條件和微生物才能産生合适的溫度。研究表明，在一定溫度下加熱一段時間可以破壞病原體和雜草種子。通常在60-70°C的溫度（濕熱）下，加熱5-10分鐘（分鐘）。它可以破壞非孢子囊細菌和非休眠體孢子細菌的活性。使用熱滅菌，在70°C下加熱30分鐘（分鐘）可以消除污泥中的病原體。
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但是，在較低的溫度（50-60°C）下，一些緻病菌的滅活時間可長達60天。是以，在堆肥過程中，有必要在一段時間内保持溫度高于60°C。合理堆肥後殘留有機物的分解率低，相對穩定，易被植物吸收。堆肥後氣味可大大減少。
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堆肥有機物的礦化為作物和微生物提供速效養分，為微生物活動提供能量，為堆肥有機物的腐殖化制備基礎原料。
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當堆肥以良好的氣體微生物活性為主時，有機物迅速礦化，産生更多的二氧化碳，水和其他營養物質，分解速度快速徹底，釋放出大量的熱能;當氣态微生物活動為主時，有機物的分解速度慢，且往往不完全，釋放的熱能小，其分解産物除植物養分外，易積累有機酸和還原性物質如CH4、H2S、PH3、H2等。當它達到一定水準時，對作物生長是不利的，甚至是有害的。
是以，堆肥發酵過程中的傾倒也是為了轉化微生物活性的類型，以消除有害物質。
堆肥過程中各種生物和微生物的死亡、置換和轉化是同時進行的，無論是從熱力學、生物學還是材料轉化的角度來看，這些反應都不可能在短短的幾天或十天内完成，這就是為什麼即使各種溫度、濕度、水分、微生物等條件都得到了很好的控制， 堆肥仍然需要經過45-60天。
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